Supplemantary tables 2: Substitution data

> Prokaryotic psychrophiles vs mesophiles CORE

A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y

A 2395 34 8 14 2 81 5 27 8 20 7 8 18 5 5 143 83 79 0 2

C 19 314 0 0 1 2 4 4 1 11 2 1 0 0 1 14 5 12 0 1

D 10 1 673 12 2 2 2 0 0 1 0 4 0 3 1 1 1 2 0 0

E 5 0 8 514 0 1 1 1 1 3 2 0 0 2 0 2 1 2 0 0

F 1 2 2 6 1025 0 4 11 1 46 8 0 1 0 1 5 2 18 3 80

G 68 4 5 5 4 1858 1 1 4 3 0 4 2 1 2 31 6 1 0 1

H 2 3 0 1 2 0 341 0 1 8 0 3 0 5 3 11 0 1 2 6

I 16 2 0 1 9 0 0 1644 1 180 37 1 4 5 1 1 17 328 1 1

K 5 0 1 2 0 0 2 0 281 5 1 2 0 1 4 5 3 1 0 0

L 19 1 1 3 66 5 8 204 1 2769 116 1 2 13 3 3 2 121 0 16

M 11 3 1 0 10 1 0 43 2 90 548 1 0 4 0 11 4 23 0 1

N 2 2 6 2 0 2 4 2 0 1 1 529 0 7 2 8 7 4 0 1

P 14 0 0 0 0 4 1 3 0 3 0 1 746 1 1 6 2 2 0 0

Q 0 1 1 4 2 2 9 1 4 9 3 3 1 389 1 2 0 4 0 0

R 1 1 0 0 1 0 3 2 16 6 1 2 1 1 408 0 0 2 0 0

S 109 14 4 7 0 17 0 3 0 3 1 17 5 2 8 929 54 8 0 0

T 50 6 1 4 1 3 1 22 2 10 8 7 4 5 6 66 1054 45 0 2

V 75 18 3 1 7 1 3 338 2 98 20 8 3 1 0 10 49 1953 1 0

W 0 0 0 0 2 0 3 0 0 5 0 0 0 0 0 0 1 1 286 6

Y 1 2 0 0 64 0 3 0 0 5 3 0 0 1 0 5 0 3 3 677

> Prokaryotic psychrophiles vs mesophiles SURFACE

A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y

A 512 1 58 140 1 39 6 12 62 10 6 35 45 56 19 67 43 26 1 1

C 3 11 0 0 0 1 0 0 0 0 1 2 0 0 4 0 0 1 1 2

D 66 1 1093 219 3 47 17 5 54 4 6 104 21 50 16 56 28 6 1 9

E 144 0 280 1377 2 43 19 17 128 9 5 71 34 126 20 59 60 34 2 3

F 3 1 3 1 185 4 7 5 4 9 2 0 0 3 1 1 4 4 3 12

G 34 1 50 23 0 815 13 1 19 0 0 48 12 11 11 19 13 4 0 4

H 11 2 15 24 6 5 241 4 32 2 1 31 15 23 20 19 17 6 0 23

I 10 0 2 12 5 1 2 224 1 24 10 4 0 9 5 2 19 62 3 1

K 87 5 53 92 2 30 21 17 1104 17 11 80 22 116 130 67 76 25 0 5

L 14 1 11 14 20 0 7 30 18 370 37 8 2 24 9 8 13 31 2 7

M 6 0 2 5 2 3 2 9 5 13 127 3 0 4 1 9 3 5 0 1

N 48 0 97 53 3 51 38 2 55 13 2 431 7 48 22 56 30 9 0 2

P 43 1 21 43 2 6 10 3 17 18 1 9 640 15 7 39 15 8 0 1

Q 59 1 51 166 6 16 28 14 126 21 10 56 22 564 62 44 43 10 1 1

R 39 5 24 41 3 21 20 5 197 16 7 29 7 73 1000 31 24 18 3 4

S 61 2 57 35 3 34 10 3 38 4 11 42 23 42 18 378 53 10 0 5

T 50 0 37 52 1 9 19 16 37 9 8 33 18 33 17 77 418 22 1 2

V 31 1 9 23 4 3 2 67 14 18 9 8 8 10 7 14 25 241 0 1

W 2 0 1 0 0 2 0 1 0 0 1 1 0 2 2 0 0 0 81 6

Y 6 2 2 4 17 1 16 2 2 3 4 3 1 3 5 9 2 5 6 221

> Prokaryotic mesophiles vs thermophiles CORE

A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y

A 3677 68 15 23 9 188 10 58 23 67 37 33 20 20 14 263 126 214 4 7

C 40 265 0 0 3 3 0 6 0 3 2 3 0 0 0 16 4 10 0 1

D 6 9 784 24 0 6 9 4 1 0 1 15 0 26 0 19 12 1 0 0

E 8 0 28 643 0 9 3 4 1 4 1 0 1 17 1 4 3 8 2 2

F 17 3 3 0 1134 3 13 40 8 140 35 0 0 1 2 3 12 20 10 91

G 169 11 10 8 0 3156 2 2 3 3 1 24 34 4 11 51 6 8 0 14

H 3 1 6 2 4 1 434 3 4 15 0 10 0 12 23 2 0 2 1 17

I 52 9 1 4 97 1 8 2741 10 407 106 8 4 7 22 10 49 798 0 15

K 13 2 6 8 0 5 2 0 288 1 2 4 0 9 12 1 5 3 1 0

L 66 33 1 1 125 4 2 373 20 3397 256 12 13 15 21 12 31 184 1 32

M 25 1 3 2 32 2 3 63 5 167 612 0 7 3 1 3 4 25 1 4

N 3 0 5 7 0 8 2 0 9 2 1 516 0 2 2 11 6 2 2 3

P 38 1 0 0 2 14 0 11 0 24 0 0 1029 0 1 7 23 16 2 1

Q 8 0 3 23 0 1 4 0 6 5 11 2 0 419 9 1 4 9 0 0

R 2 0 1 2 0 9 6 0 35 1 1 4 2 24 473 1 3 2 1 1

S 147 1 7 27 0 31 0 4 9 13 13 29 1 8 6 810 67 16 0 1

T 50 15 13 10 11 9 3 34 3 16 10 20 11 4 7 120 1257 103 1 13

V 296 87 4 13 42 11 6 786 11 258 55 8 24 18 11 56 160 3749 1 12

W 1 0 0 2 7 0 0 3 2 9 3 0 0 0 4 1 1 0 118 7

Y 9 2 2 0 87 1 13 4 6 12 1 5 0 0 1 3 0 7 20 808

> Prokaryotic mesophiles vs thermophiles SURFACE

A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y

A 529 0 36 81 1 40 5 6 61 7 5 22 25 32 31 117 44 24 1 2

C 1 23 0 1 0 1 0 1 0 0 0 0 2 0 1 0 0 1 0 0

D 102 4 1568 445 6 69 12 4 96 7 3 144 15 59 29 72 34 10 0 5

E 260 1 725 3160 2 99 23 54 438 39 28 175 67 230 104 167 160 84 1 16

F 17 1 12 20 365 2 9 8 7 44 7 3 1 29 4 4 1 30 2 66

G 42 0 71 50 0 1804 9 3 46 5 1 99 6 23 26 64 15 6 0 1

H 6 1 17 22 36 4 327 4 38 2 1 40 8 11 26 15 12 3 0 10

I 30 1 6 43 10 3 6 532 56 57 65 10 6 19 18 16 22 148 3 12

K 213 0 138 341 6 68 46 35 2713 37 26 177 34 178 414 166 137 74 1 24

L 24 2 15 53 38 17 6 105 33 646 53 26 16 26 20 14 24 63 5 11

M 44 0 5 15 14 11 0 6 19 40 369 8 0 22 10 8 8 12 0 3

N 45 0 112 74 3 58 24 2 73 5 1 528 12 43 34 55 37 3 0 4

P 103 0 60 170 9 37 3 12 52 23 15 24 1423 34 35 52 32 43 2 3

Q 83 0 105 160 0 31 21 16 145 24 11 51 9 539 68 68 37 27 0 4

R 105 5 81 208 13 48 45 44 650 70 25 138 40 134 1962 89 81 58 9 26

S 71 3 72 60 6 78 15 7 77 8 2 50 19 20 35 485 55 5 3 1

T 39 0 44 71 2 13 11 34 89 42 14 47 10 22 47 190 966 16 0 3

V 36 1 8 74 36 5 5 114 43 27 12 6 29 28 22 16 74 567 0 1

W 0 0 1 2 14 0 7 4 4 1 1 1 0 1 4 1 0 0 95 5

Y 11 1 3 10 141 3 11 18 16 34 2 13 0 9 13 5 32 14 3 385