Supplementary Table 1. Haplotype and haplogroup information for 296 Swedish individuals and 39 Saami individuals (Tillmar et al.)

Estimated haplogroup /

Haplotype

/ Sweden
(Saami excluded) / Blekinge/Kristianstad /

Gotland

/ Uppsala / Östergötland/Jönköping / Skaraborg / Värmland / Västerbotten / Swedish Saami
? / 16183C 16189C 16193.1C 16271C 73G 150T 263G 315.1C / 2 / 1 / 0 / 0 / 1 / 0 / 0 / 0 / 0
? / 16224C 16519C 73G 152C 204C 263G 315.1C 497T 524.1A 524.2C / 1 / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0
? / 16069T 16261T 73G 185A 189G 263G 295T 315.1C 462T 489C / 1 / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0
? / 16189C 16519C 73G 263G 309.1C 309.2C 315.1C 327T / 1 / 0 / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0
? / 16224C 16519C 73G 152C 204C 263G 272G 315.1C 497T 524.1A 524.2C / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 1 / 0 / 0 / 0
? / 16362C 73G 263G 309.1C 315.1C 523d 524d / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 1 / 0 / 0 / 0
? / 16183C 16189C 16193.1C 73G 262T 263G 285T 309.1C 309.2C 315.1C 323A 385G 523d 524d / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 1 / 0
? / 16069T 16145A 16207G 16222T 16231C 16261T 73G 150T 152C 195C 215G 246C 263G 295T 309.1C 309.2C 315.1C 319C 489C 513A / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 1 / 0 / 0
? / 16183C 16189C 16193.1C 73G 262T 263G 285T 309.1C 315.1C 323A 385G 523d 524d / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 1 / 0
? / 16153A 16298Y 72C 73G 93G 95C 263G 309.1C 315.1C / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 1
? / 16153A 16298C 72C 73G 93G 95C 263G 309.1C 315.1C / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 1
B4b / 16183C 16189C 16193.1C 16217C 16519C 73G 263G 309.1C 309.2C 309.3C 315.1C 498d 499A / 1 / 0 / 0 / 0 / 1 / 0 / 0 / 0 / 0
C1b / 16223T 16298C 16311C 16325C 16327T 73G 249d 258T 263G 290d 291d 315.1C 489C 493G 523d 524d / 1 / 0 / 0 / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0
D4/G / 16223T 16311C 16362C 16519C 73G 263G 315.1C 489C 573.1C 573.2C 573.3C / 1 / 0 / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0
D4/G / 16093C 16172C 16223T 16297C 16311C 16362C 16400T 16519C 73G 146C 185A 263G 315.1C 489C / 1 / 0 / 0 / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0
H / 16519C 263G 315.1C / 8 / 1 / 0 / 2 / 1 / 2 / 1 / 1 / 0
H / 16311C 16519C 263G 315.1C / 4 / 0 / 0 / 0 / 0 / 1 / 0 / 3 / 0
H / 16357C 16519C 263G 315.1C / 3 / 3 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0
H / 16093C 16221T 16519C 263G 309.1C 315.1C / 3 / 1 / 0 / 1 / 1 / 0 / 0 / 0 / 0
H / 16519C 263G 309.1C 309.2C 315.1C / 3 / 0 / 1 / 0 / 1 / 1 / 0 / 0 / 0
H / 16519C 152C 263G 315.1C / 3 / 0 / 0 / 1 / 0 / 1 / 1 / 0 / 0
H / 16311C 16519C 263G 309.1C 309.2C 315.1C / 3 / 0 / 0 / 2 / 0 / 1 / 0 / 0 / 0
H / 195C 263G 315.1C 523d 524d / 2 / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 1 / 0 / 0
H / 16519C 263G 309.1C 315.1C 523d 524d / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 1 / 0 / 0 / 0
H / 16519C 263G 309.1C 315.1C / 1 / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0
H / 16093C 16468C 16519C 152C 263G 309.1C 315.1C 532G / 2 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 2 / 0
H / 16519C 152C 263G 309.1C 315.1C / 2 / 0 / 0 / 0 / 1 / 0 / 0 / 1 / 0
H / 16147T 16362C 16519C 263G 309.1C 315.1C / 1 / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0
H / 16319A 16519C 263G 315.1C / 1 / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0
H / 16182C 16183C 16189C 1613.1C 16519C 263G 309.1C 309.2C 315.1C / 1 / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0
H / 16093C 16311C 16519C 263G 315.1C / 1 / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0
H / 16189C 16519C 263G 315.1C / 1 / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0
H / 16093C 16519C 263G 309.1C 315.1C / 1 / 0 / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0
H / 16189C 16193.1C 16193.2C 16311C 16519C 263G 309.1C 309.2C 309.3C 315.1C 327T / 1 / 0 / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0
H / 16148Y 16519C 143A 146C 263G 309.1C 315.1C 524.1A 524.2C / 1 / 0 / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0
H / 16209C 16261T 16519C 234R 263G 309.1C 315.1C / 1 / 0 / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0
H / 16093C 16129A 16316G 16519C 263G 315.1C / 1 / 0 / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0
H / 16093C 16184T 16234T 16519C 263G 315.1C / 1 / 0 / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0
H / 16189C 16290T 16519C 44.1C 263G 315.1C / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 1 / 0 / 0 / 0
H / 16291T 16519Y 263G 309.1C 309.2C 315.1C 316A / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 1 / 0 / 0 / 0
H / 16124C 152C 263G 309.1C 315.1C 523d 524d / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 1 / 0 / 0 / 0
H / 16093C 16221T 16519C 152C 263G 315.1C / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 1 / 0 / 0 / 0
H / 16497G 195C 315.1C / 1 / 0 / 0 / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0
H / 195Y 263G 315.1C / 1 / 0 / 0 / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0
H / 16093C 16129A 16316G 16519C 185A 263G 315.1C / 1 / 0 / 0 / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0
H / 16183C 16189C 16193.1C 16527T 152C 199C 263G 309.1C 315.1C / 1 / 0 / 0 / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0
H / 16144C 16355T 16519C 150T 263G 315.1C / 1 / 0 / 0 / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0
H / 16189C 16193.1C 16193.2C 16519C 152C 263G 309.1C 309.2C 315.1C / 1 / 0 / 0 / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0
H / 16299G 16519C 263G 309.1C 315.1C / 1 / 0 / 0 / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0
H / 16093C 16221T 16311Y 16468C 16519C 263G 309.1C 315.1C / 1 / 0 / 0 / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0
H / 16519C 186A 263G 309.1C 309.2C 315.1C / 1 / 0 / 0 / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0
H / 16172C 16311C 263G 309.1C 315.1C / 1 / 0 / 0 / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0
H / 16325C 16519C 151T 152C 263G 315.1C / 1 / 0 / 0 / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0
H / 16093C 16311C 16519C 152C 263G 309.1C 315.1C 524.1A 524.2C / 1 / 0 / 0 / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0
H / 16311C 16519C 199C 263G 309.1C 315.1C / 1 / 0 / 0 / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0
H / 16311C 16519C 186A 263G 309.1C 315.1C / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 1 / 0
H / 16316G 16519C 263G 315.1C / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 1 / 0
H / 16192T 16519C 263G 315.1C 503G / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 1 / 0 / 0
H / 16093Y 16221T 16311C 16519C 263G 309.1C 309.2C 315.1C / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 1 / 0 / 0
H / 16311C 16519C 263G 309.1C 315.1C / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 1 / 0 / 0
H / 16519C 199C 263G 309.1C 315.1C 523d 524d / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 1 / 0 / 0
H / 16519C 146C 151T 195C 198T 263G 315.1C / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 1 / 0 / 0
H / 16172C 315.1C / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 1 / 0 / 0
H / 16183G 16519C 263G 309.1C 315.1C / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 1 / 0 / 0
H / 16519C 186A 263G 315.1C / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 1 / 0 / 0
H / 16311C 16519C 263G 315.1C 524.1A 524.2C / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 1 / 0
H / 16519C 146Y 152C 263G 309.1C 315.1C / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 1 / 0
H / 16209C 16519C 263G 309.1C 309.2C 315.1C / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 1 / 0
H / 16256T 55.1T 57C 59C 246C 263G 309.1C 315.1C 573.1C 573.2C 573.3C / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 1 / 0
H / 16519C 146C 263G 309.1C 315.1C / 1 / 0 / 0 / 0 / 1 / 0 / 0 / 0 / 0
H / 16189Y 16278T 263G 315.1C / 1 / 0 / 0 / 0 / 1 / 0 / 0 / 0 / 0
H / 16129A 16189C 16519C 263G 315.1C / 1 / 0 / 0 / 0 / 1 / 0 / 0 / 0 / 0
H11 / 16311C 16519C 152C 195C 263G 309.1C 309.2C 315.1C / 1 / 0 / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0
H1a / 16162G 16189C 16519C 73G 151T 152C 263G 315.1C / 1 / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0
H1a / 16051G 16162G 16519C 73G 263G 309.1C 315.1C / 1 / 0 / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0
H1a / 16162G 16519C 73G 263G 309.1C 315.1C / 1 / 0 / 0 / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0
H1a / 16162G 16519C 73G 263G 315.1C 513A / 1 / 0 / 0 / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0
H1a / 16162G 16167T 73G 263G 309.1C 315.1C / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 1 / 0 / 0
H1a / 16162G 16300G 16519C 73G 263G 315.1C / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 1 / 0 / 0
H1a / 16162G 16209C 16519C 73G 263G 309.1C 315.1C 524.1A 524.2C / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 1 / 0
H1a / 16162G 16288C 16290T 16519C 73G 263G 309.1C 309.2C 315.1C / 1 / 0 / 0 / 0 / 1 / 0 / 0 / 0 / 0
H1b / 16080G 16183C 16189C 16193.1C 16243C 16356C 263G 309.1C 315.1C / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 1 / 0 / 0 / 0
H1b / 16183C 16189C 16193.1C 16243C 16356C 16519C 263G 315.1C 524.1A 524.2C / 1 / 0 / 0 / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0
H1b / 16189C 16356C 16362C 16519C 263G 315.1C 523d 524d / 1 / 0 / 0 / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0
H1b / 16189C 16193.1C 16193.2C 16356C 16519C 152C 263G 309.1C 309.2C 315.1C / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 1 / 0 / 0
H1b / 16189C 16356C 16519C 131C 263G 309.1C 315.1C / 1 / 0 / 0 / 0 / 1 / 0 / 0 / 0 / 0
H1b / 16189C 16356C 16519C 263G 315.1C 335G / 1 / 0 / 0 / 0 / 1 / 0 / 0 / 0 / 0
H1b / 16189C 16261T 16356C 16519C 152C 263G 315.1C / 1 / 0 / 0 / 0 / 1 / 0 / 0 / 0 / 0
H1b H2a1 / 16189C 16354T 16356C 16519C 263G 315.1C / 1 / 0 / 0 / 0 / 1 / 0 / 0 / 0 / 0
H1c / 16519C 263G 315.1C 477C / 3 / 0 / 0 / 0 / 0 / 1 / 2 / 0 / 0
H1c / 16519C 152C 189G 263G 309.1C 315.1C 477C / 2 / 0 / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 1 / 0
H1c / 16362C 16519C 263G 315.1C 477C / 1 / 0 / 0 / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0
H1c / 16240R 16519C 263G 315.1C 477C / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 1 / 0 / 0
H1c1 / 16263C 16519C 263G 315.1C 477C / 3 / 1 / 0 / 0 / 0 / 2 / 0 / 0 / 0
H1c1 / 16263C 16519C 263G 309.1C 309.2C 315.1C 477C / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 1 / 0 / 0 / 0
H1f / 16093C 16183C 16189C 16193.1C 16519C 263G 315.1C 459d / 2 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 2 / 0 / 0
H2a / 16235G 16291T 16357C 263G 309.1C 315.1C 523d 524d / 1 / 0 / 0 / 0 / 1 / 0 / 0 / 0 / 0
H2a1 / 16354T 16519C 263G 309.1C 315.1C 507C / 1 / 0 / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0
H2a1 / 16354T 146C 263G 315.1C / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 1 / 0 / 0 / 0
H2a1 / 16354T 152C 263G 315.1C / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 1 / 0
H3a / 16239G 16519C 152C 263G 309.1C 309.2C 315.1C / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 1 / 0
H5 / 16304C 263G 315.1C 456T / 2 / 0 / 1 / 0 / 0 / 0 / 1 / 0 / 0
H5 / 16179T 16304C 146C 195C 263G 309.1C 315.1C 456T / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 1 / 0 / 0 / 0
H5 / 16179T 16304C 146C 195C 263G 309.1C 309.2C 315.1C 456T / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 1 / 0 / 0 / 0
H5 / 16070G 152C 263G 315.1C 390G 456T 524.1A 524.2C / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 1 / 0 / 0 / 0
H5 / 16304C 263G 315.1C 456T 523d 524d / 1 / 0 / 0 / 1 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0
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