#Felis_catus TTGTGCTAAG GTTGAAGTAA AATATAGAAG ATGATAAGTT GGTGGCTCTA ATTTAGAAAT TTAGTTTATA TTTGTAAAGT CTTTTTTGTT TTG-----AT CATTAGTTAT GTGAAACTGC AGAAGAGAGT GAGTCAGGTG TAAGTGTATA AGTGCACAGT CTATGTAAAG AAATCAGTCT CTGAAATGTT ACCTCAGTGC [ 200]

#Felis_silvestris ...... -----...... [ 200]

#Felis_libyca ...... -----...... A ...... [ 200]

#Felis_bieti ...... A...... -----...... [ 200]

#Felis_margarita ...... -----...... A ...... G ...... [ 200]

#Felis_chaus ...... C...... -----...... A ...... [ 200]

#Felis_nigripes ...... -----...... A ...... [ 200]

#Prionailurus_viverrinus ...... -----...... A ...... A...... G...... [ 200]

#Prionailurus_rubiginosus ...... -----...... A ...... G...... [ 200]

#Prionailurus_bengalensis ...... -----...... A ...... G...... [ 200]

#Prionailurus_planiceps ...... -----...... A ...... G...... [ 200]

#Octocolobus_manul ...... -----...... A ...... G...... [ 200]

#Lynx_lynx ...... -----...... C...... A ...... G...... [ 200]

#Lynx_canadensis ...... -----...... C...... A ...... G...... [ 200]

#Lynx_rufus ...... -----...... C...... A ...... G...... [ 200]

#Lynx_pardinus ...... -----...... C...... A ...... G...... [ 200]

#Puma_concolor ...... C...... -----...... A ...... G...... [ 200]

#Acinonyx_jubatus ...... -----...... A ...... G...... [ 200]

#Puma_yagouaroundi ...... -----G...... A ...... G...... [ 200]

#Leopardus_tigrinus ...... C.G...... TTTTG...... C ...... G...... [ 200]

#Leopardus_pardalis ...... C...... TTTTG...... C ...... C...... G...... [ 200]

#Leopardus_weidii ...... C...... TTTTG...... C ...... C...... G...... [ 200]

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#Leopardus_geoffroyi ...... C.G...... TTTTG...... C ...... G...... [ 200]

#Leopardus_colocolo ...... C...... TTTTG...... C ...... G...... [ 200]

#Caracal_serval ...... G...... C...... TTTTG...... G...... [ 200]

#Caracal_aurata ...... TTTTG...... A ...... A...... [ 200]

#Caracal_caracal ...... TTTTG...... A ...... G...... [ 200]

#Pardofelis_marmorata ...... A...... A...G...... GG...... TTTTG...... A ...... T...... G...... [ 200]

#Pardofelis_temminckii ...... A...G...... TTTTG...... C...... A ...... T...... G...... [ 200]

#Panthera_tigris ...... C...... A...... TTTTG...... C...... A ....C...... T...... T...... [ 200]

#Panthera_unca ...... C...... A...... TTTTG...... C...... A ....C...... T...... T...... [ 200]

#Panthera_pardus ...... C...... A...... TTTTG...... C...... A ....C...... T...... T...... [ 200]

#Panthera_leo ...... C...... A...... TTTTG...... C...... A ....G...... T...... T...... [ 200]

#Panthera_onca ...... C...... A...... TTTTG...... C...... A ...... T...... T...... [ 200]

#Neofelis_nebulosa ...... C...... TTTTG...... C...... A ...... T...... GC...... T.T...... [ 200]

#Felis_catus CACTGGAATT GCTTGAGTTC CAGGGTCATC TGTTGGTTGT TGGTGGTGGT GGTGTTGGTG TTGGTTTGTT TGTCTTGTTT GCTTTTTTAA TAGAACAATT TTTATATCTA ATTTTAGTTG TCGCAAAGAG TGGCCATTAA ATGTTGGGTA TGAAACATAT ATATTTTGCA TTCTGTTAAT CTTCAG------TAAAA [ 400]

#Felis_silvestris ...... ------..... [ 400]

#Felis_libyca ...... ------..... [ 400]

#Felis_bieti ...... ------..... [ 400]

#Felis_margarita ...... ------..... [ 400]

#Felis_chaus ...... G..G ...... G...... C...... GATA GACAG..... [ 400]

#Felis_nigripes ...... ------..... [ 400]

#Prionailurus_viverrinus ...... G ...... G...... C...... CATA GACAG..... [ 400]

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#Prionailurus_bengalensis ...... G ...... G..... G...... C...... -...... CATA GACAG..... [ 400]

#Prionailurus_planiceps ...... G ...... G...... C...... CATA GACAG..... [ 400]

#Octocolobus_manul ...... G ...... G...... C...... CATA GACAG..... [ 400]

#Lynx_lynx ...... C...... C...... CATA GACAG..... [ 400]

#Lynx_canadensis ...... C...... C...... CATA GACAG..... [ 400]

#Lynx_rufus ...... C...... C...... CATA GACAG..... [ 400]

#Lynx_pardinus ...... T...... G...... C...... CATA GACAG..... [ 400]

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#Leopardus_weidii ...... T...... G...... -...... CATA GACAG..... [ 400]

#Leopardus_guigna ...... G...... CATA GACAG..... [ 400]

#Leopardus_geoffroyi ...... T...... G...... CATA GACAG..... [ 400]

#Leopardus_colocolo ...... G...... CATA GACAG..... [ 400]

#Caracal_serval ...... G...... C...... C...... C....G...... C...... G ...... CATA GACAG..... [ 400]

#Caracal_aurata ...... C ...... G...... CATA GACAG..... [ 400]

#Caracal_caracal ...... C ...... G...... CATA GACAG..... [ 400]

#Pardofelis_marmorata ...... T...... G...... C .C...... G...... A...... C...... CATA GACAGC...- [ 400]

#Pardofelis_temminckii ...... T...... G..... G...... C...... G...... A...... C...... CATA GACAG....- [ 400]

#Panthera_tigris ...... C ...... G ...... C...... T.. ?...... G...... A...... CATA GACAG....- [ 400]

#Panthera_unca ...... C ...... G ...... C...... T...... G...... A...... CATA GACAG....- [ 400]

#Panthera_pardus ...... C ...... G ...... C...... G...... T...... G...... A...... CATA GACAG....- [ 400]

#Panthera_leo ...... C ...... G ...... C...... G...... T...... G...... A...... CATA GACAG....- [ 400]

#Panthera_onca ...... C ...... G ...... C...... G...... T...... G...... A...... CATA GACAG....- [ 400]

#Neofelis_nebulosa ...... C ...... G ...... C...... G...... A...... CATA GACAG....- [ 400]

#Felis_catus GCAGTATTCC CAGTTGTTTG GCAGTGGGAA A-CTGACATC AAGTTTTGAA CTTTA------AGTAGAAGT GAACAAACGC GGTGATGCGT AACATGCATT CAATATCCTC CTGAATGTGT TTTT--AAGG CTAAC---AG AATTAGGTTA TCGTTAAACT TTGTGTTTGA AACATAACTT TCACGTATAT CCAGTTCGCA [ 600]

#Felis_silvestris ...... -...... ------...... --...... ---...... [ 600]

#Felis_libyca ...... -...... ------...... - --...... --...... ---...... [ 600]

#Felis_bieti ...... -...... ------...... --...... ---...... A...... [ 600]

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#Felis_chaus ...... G...... -...... G-TTT A...... - --...... --...... ACAG.A ...... [ 600]

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#Prionailurus_rubiginosus ...... -...... G..G-TTT A...... C...... - --...... --.G...... ---...... G...... [ 600]

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#Octocolobus_manul ...... -...... G-TTT A...... - --..G...... --...... ---...... T...... [ 600]

#Lynx_lynx ...... -...... ------...... C...... - --...... --...... ---...... G...... [ 600]

#Lynx_canadensis ...... -...... ------...... C...... - --...... --...... ---...... G...... [ 600]

#Lynx_rufus ..C...... -...... ------...... - --...... --...... ---...... G...... C ...... [ 600]

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#Leopardus_tigrinus ...... -...... G-TTT A....C...... A...... T...... - --...... --...... ---...... C...... [ 600]

#Leopardus_pardalis ...... -...... G-CTT A...... A...... - --...... --...... ---...... [ 600]

#Leopardus_weidii ...... -...... G-TTT A...... A...... - --...... --...... ---...... [ 600]

#Leopardus_guigna ...... -...... G-TTT A....C...... A...... - --...... --...... ---...... C...... [ 600]

#Leopardus_geoffroyi ...... -...... G-TTT A....C...... A...... - --...... --...... ---...... C...... [ 600]

#Leopardus_colocolo ...... -...... C...G-TTT A...... A...... - --...... TT...... ---...... C...... [ 600]

#Caracal_serval ...... G .-...... G-TTT A...... A...... - --...... --...... ---...... [ 600]

#Caracal_aurata ...CA...... -...... G-TTT A...... G....C... .A...... - --..G...... --...... ---...... [ 600]

#Caracal_caracal ...CA...... -...... G-TTT A...... G....C... .A...... - --..G...... --...... C.---...... [ 600]

#Pardofelis_marmorata ...... -...... T....G-TTT A...... A....A...... - --...... --...... ---...... GG...... [ 600]

#Pardofelis_temminckii ...... -...... T....AGTTT A..C...... A....A...... - --...C...... --...... ---...... AT...... C. ...G...... [ 600]

#Panthera_tigris ...... C...... T.G. .A...... G...... T....G-TTT A...... A...... ?.....- --...... C.--...... ---...... [ 600]

#Panthera_unca ...... C...... -...... G...... T....G-TTT A...... A...... - --...... C.--...... ---...... [ 600]

#Panthera_pardus ...... C...... -...... G...... T....G-TTT A...... A...... - --...... C.--...... ---...... [ 600]

#Panthera_leo ...... C...... -...... G...... T....G-TTT A...... A...... - --...... C.--...... ---...... [ 600]

#Panthera_onca ...... C...... -...... G...... T....G-TTT A...... C ...... A...... - --...... C.--...... ---...... [ 600]

#Neofelis_nebulosa ...... -...... T....G-TTT A...... A...... - --...... C.--...... ---...... G ...... [ 600]

#Felis_catus TCA-GTTAGA TGTACATTCG CCCTTTGATT GAAAGGGATA ATAAAATGAA TGAAT----A ACAAAGTTTG GTTCGATTCG TAAA-GAGTG GCATA-GAGA CTTAAGCGTG GCGGATTAGA TGCGAAGCAC ACA-GGCAGT GAGCCGAGCA TGA------A CCTTATTTCG AAGTCAGCAT GAGAATGGTA GGTTGGGCTT [ 800]

#Felis_silvestris ...-...... ----...... -...... -...... -...... ------...... [ 800]

#Felis_libyca ...-...... ----...... -...... -...... -...... ------...... [ 800]

#Felis_bieti ...T...... ----...... -...... -...... -...... ------...... [ 800]

#Felis_margarita ...-...... ----...... -...... -...... -...... ------...... [ 800]

#Felis_chaus ...-...... A...... ----...... -...... -...... -...... C...... ------...... [ 800]

#Felis_nigripes ...-...... C...... ----. C...... -...... -...... -...... ------...... [ 800]

#Prionailurus_viverrinus ...-...... C...... T...... ----...... C...... -...... -...... T...... A...... -..------...... ------...... [ 800]

#Prionailurus_rubiginosus ...T...... T...... ----...... C...... -...... -...... TA...... -...... ------...... [ 800]

#Prionailurus_bengalensis ...-...... C...... T...... ----...... C...... -...... -...... A...... -...... ------...... [ 800]

#Prionailurus_planiceps ...-...... C...... T...... ----...... C...... -...... -...... A...... -...... ------...... A...... [ 800]

#Octocolobus_manul ...-...... T...... ----...... C...... C ....-...... -...... A...... -...... ------...... [ 800]

#Lynx_lynx ...-...... T...... ----...... C...... -...... -...... TA...... -...... ------...... [ 800]

#Lynx_canadensis ...-...... T...... ----...... C...... -...... G-...... TA...... -...... ------...... [ 800]

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#Lynx_pardinus ...-...... T...... G.----...... C...... -...... -...... TA...... -...... ------...... [ 800]

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#Leopardus_tigrinus ...-...... G.... T...... ----...... C...... -...... -...... A...... TA...... C-...... ------...... [ 800]

#Leopardus_pardalis ...-...... G.... T...... ----...... C...... -...... -...... A...... TA...... -...... ------...... [ 800]

#Leopardus_weidii ...-...... G.... T...... ----...... C...... -...... -...... A...... TA...... -...... ------...... [ 800]

#Leopardus_guigna ...-...... G.... T...... ----...... A.. C...... -...... A...... TA...... CC...... ------...... G...... [ 800]

#Leopardus_geoffroyi ...-...... G.... T...... ----...... C...... -...... -...... A...... TA...... C-...... ------...... [ 800]

#Leopardus_colocolo ...-...... G.... T...... ----...... C...... -...... -...... A...... TA...... -...... ------...... [ 800]

#Caracal_serval ...-...... C... T...... C ...... GAAT...... C...... G. ....-...... -...... G.. ..TA...... -...... ------...... C...... [ 800]

#Caracal_aurata ...-...... T...... G...... ----...... C...... -.GA...... -...... TA...... -...... GCATGA...... [ 800]

#Caracal_caracal ...-...... T...... G...... ----...... C...... -.GA...... -...... TA...... -...... GCATGA...... [ 800]

#Pardofelis_marmorata ...-...... T...... ----...... C. C...... T ....A...... -...... TA...... -...... ------...... C...... [ 800]

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#Panthera_tigris ...-...... C.... T...... ----...... C...... T ....-...... -...... G ..TA...... -...... ------. .T...... T...... A...... [ 800]

#Panthera_unca ...-...... C.... T...... ----...... C...... T ....-...... -...... TA...... -...... ------. .T...... T...... A...... [ 800]

#Panthera_pardus ...-...... C.... T...... ----...... C...... T ....-...... -...... TA...... -...... -----A. .T...... T...... A...... [ 800]

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#Felis_catus CGGCT-GTGG CCGGGGGCGG GTTTGAGGTG AGCTGCTGGG GCGGAGAAAT GAGTACTTTG CTAAGAAAAG TTAGAGCACG AAAGTCTCTG CTAGAAACAA CCTTCAACGG TTAGATAATT CTCGTAACGT TTACACCTTC GAACTTTGCT ACCCACCAAC CCCCC-TTTT TTAACGCTGC AATTTTATGC TTCTGGT-AT [1000]

#Felis_silvestris .....-...... -...... -.. [1000]

#Felis_libyca .....-...T ...... -...... -.. [1000]

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#Felis_catus CAAAGGCGCA AGGTGGCTCT AGAGAATCCC CAAACGCAAA ACTCAGAGAT CAGCAAGCAG CTGGGGTACC AGTGGAAAAT GCTTACACAA GCCGAAAAAT GGCCGTTCTT CGAGGAGGCA CAGAGACTAC AGGCGCTGCA CCGAGAGAAA TACCCGGGCT ATAGATACCG ACCTCGTCGG AAGGCCAGGC CAGAGAAAAG [1400]

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