Table 3S. Variability of 145Prunus SSRs in nine rosaceous species

Almond / Peach / Apricot / Japanese plum / European plum / Cherry / Apple / Pear / Strawberry
SSR / Sp1 / O2 / Am3 / A4 / Ho5 / Am3 / A4 / Ho5 / Am3 / A4 / Ho5 / Am3 / A4 / Ho5 / Am3 / A4 / Ho5 / Am3 / A4 / Ho5 / Am3 / A4 / Ho5 / Am3 / A4 / Ho5 / Am3 / A4 / Ho5
CPDCT003 / Al / G / 1 / 3 / 0.38 / 1 / 1 / - / 1 / 5 / 0.63 / 3 / 10 / n.c. / 1 / 2 / 0.38 / - / - / - / - / - / - / - / - / -
CPDCT004 / Al / G / 1 / 1 / - / - / - / - / 1 / 2 / 0.38 / 2 / 8 / n.c. / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / -
CPDCT005 / Al / G / 1 / 1 / - / 1 / 5 / 1.00 / 1 / 6 / 0.88 / 2 / 8 / n.c. / 1 / 1 / - / - / - / - / - / - / - / - / - / -
CPDCT006 / Al / G / 1 / 2 / 0.00 / 1 / 4 / 0.75 / - / - / - / 2 / 6 / n.c. / 1 / 1 / - / - / - / - / - / - / - / - / - / -
CPDCT007 / Al / G / 1 / 2 / 0.25 / 2 / 3/2 / 0.50/0.38 / 1 / 5 / 0.38 / 2 / 9 / n.c. / 1 / 1 / - / - / - / - / - / - / - / - / - / -
CPDCT014 / Al / G / 2 / 2/2 / 0.38/0.38 / 1 / 1 / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / -
CPDCT016 / Al / G / 1 / 2 / 0.13 / 1 / 5 / 0.86 / 1 / 4 / 0.63 / 2 / 9 / n.c. / 1 / 2 / 0.50 / - / - / - / - / - / - / - / - / -
CPDCT017 / Al / G / 1 / 1 / - / - / - / - / 1 / 3 / 0.75 / 2 / 5 / n.c. / 1 / 3 / 0.63 / - / - / - / - / - / - / - / - / -
CPDCT019 / Al / G / 1 / 1 / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / -
CPDCT022 / Al / G / 1 / 4 / 0.50 / 1 / 2 / 0.25 / 1 / 5 / 1.00 / 2 / 7 / n.c. / 1 / 5 / 0.88 / 1 / 1 / - / 1 / 2 / 0.25 / - / - / -
CPDCT025 / Al / G / 1 / 1 / - / 1 / 2 / 0.50 / 1 / 4 / 0.88 / 2 / 12 / n.c. / 1 / 3 / 0.50 / - / - / - / - / - / - / - / - / -
CPDCT027 / Al / G / 1 / 1 / - / 1 / 2 / 0.38 / 1 / 3 / 0.75 / 2 / 3 / n.c. / 1 / 1 / - / 1 / 2 / 0.00 / 1 / 2 / 0.38 / - / - / -
CPDCT028 / Al / G / 1 / 1 / - / 1 / 4 / 0.88 / 1 / 5 / 0.75 / 2 / 7 / n.c. / 2 / 3/1 / 0.75/- / 1 / 2 / 0.13 / - / - / - / - / - / -
CPDCT029 / Al / G / 2 / 2/3 / 0.50/0.88 / 2 / 6 / n.c. / 1 / 3 / 0.50 / 2 / 4 / n.c. / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / -
CPDCT031 / Al / G / 1 / 1 / - / 1 / 5 / 1.00 / 1 / 1 / - / 2 / 5 / n.c. / 1 / 1 / - / - / - / - / - / - / - / - / - / -
CPDCT033 / Al / G / 1 / 6 / 1.00 / 1 / 4 / 1.00 / 1 / 7 / 1.00 / 3 / 10 / n.c. / 1 / 1 / - / - / - / - / 1 / 3 / 0.75 / 1 / 1 / -
CPDCT034 / Al / G / 1 / 4 / 0.63 / 1 / 2 / 0.50 / 1 / 3 / 0.13 / 3 / 6 / n.c. / 1 / 2 / 0.63 / 1 / 4 / 0.50 / 2 / 3 / n.c. / 1 / 1 / -
CPDCT035 / Al / G / 1 / 1 / - / 2 / 2/3 / 0.57/0.29 / - / - / - / 1 / 1 / - / 1 / 1 / - / 1 / 1 / - / - / - / - / 1 / 1 / -
CPDCT037 / Al / G / 1 / 2 / 0.63 / 1 / 3 / 0.75 / 1 / 8 / 0.75 / 1 / 7 / 0.75 / 1 / 5 / 0.71 / - / - / - / - / - / - / - / - / -
CPDCT038 / Al / G / 1 / 1 / - / 1 / 1 / - / 1 / 7 / 0.25 / 2 / 5 / n.c. / 1 / 1 / - / - / - / - / - / - / - / - / - / -
CPDCT039 / Al / G / 1 / 1 / - / 1 / 3 / 0.38 / 1 / 4 / 0.25 / 2 / 9 / n.c. / 1 / 1 / - / - / - / - / - / - / - / 1 / 1 / -
CPDCT040 / Al / G / 1 / 4 / 0.38 / 1 / 2 / 0.38 / 1 / 4 / 0.63 / 2 / 4 / n.c. / 1 / 1 / - / 2 / 4 / n.c. / - / - / - / 1 / 1 / -
CPDCT042 / Al / G / 1 / 1 / - / 1 / 5 / 0.38 / 1 / 6 / 0.38 / 3 / 10 / n.c. / 1 / 1 / - / 1 / 2 / 0.25 / - / - / - / - / - / -
CPDCT044 / Al / G / 1 / 1 / - / - / - / - / 1 / 7 / 0.63 / 2 / 9 / n.c. / - / - / - / 1 / 2 / 0.13 / - / - / - / - / - / -
CPDCT045 / Al / G / 1 / 3 / 0.88 / 1 / 4 / 0.63 / 1 / 4 / 0.88 / 3 / 9 / n.c. / 1 / 4 / 0.50 / - / - / - / - / - / - / - / - / -
EPDCU5062 / Al / E / 1 / 1 / - / 1 / 2 / 0.38 / 1 / 2 / 0.50 / 2 / 4 / n.c. / 1 / 2 / 0.25 / - / - / - / - / - / - / - / - / -
EPDCU4658 / Al / E / 1 / 2 / 0.50 / 1 / 4 / 0.88 / 1 / 5 / 0.88 / 3 / 10 / n.c. / 1 / 1 / - / 1 / 1 / - / 1 / 3 / 0.50 / - / - / -
EPDCU4466 / Al / E / 1 / 1 / - / 1 / 1 / - / 1 / 3 / 0.88 / 1 / 2 / 0.75 / 1 / 1 / - / - / - / - / 1 / 1 / - / - / - / -
EPDCU4017 / Al / E / 1 / 1 / - / 1 / 2 / 0.50 / 1 / 2 / 0.50 / 2 / 4 / n.c. / 1 / 2 / 0.13 / 1 / 2 / 0.5 / 1 / 1 / - / 1 / 2 / 0.13
EPDCU3392 / Al / E / 1 / 2 / 0.13 / 1 / 3 / 0.63 / 1 / 5 / 0.75 / 3 / 11 / n.c. / 1 / 3 / 0.63 / - / - / - / 1 / 1 / - / 1 / 1 / -
EPDCU3122 / Al / E / 1 / 1 / - / 1 / 1 / - / 1 / 3 / 0.75 / 3 / 8 / n.c. / 1 / 1 / - / 1 / 2 / 0.5 / 1 / 1 / - / 1 / 1 / -

Table 3S (continued)

Almond / Peach / Apricot / Japanese plum / European plum / Cherry / Apple / Pear / Strawberry
SSR / Sp1 / O2 / Am3 / A4 / Ho5 / Am3 / A4 / Ho5 / Am3 / A4 / Ho5 / Am3 / A4 / Ho5 / Am3 / A4 / Ho5 / Am3 / A4 / Ho5 / Am3 / A4 / Ho5 / Am3 / A4 / Ho5 / Am3 / A4 / Ho5
EPDCU3083 / Al / E / 1 / 3 / 0.50 / 1 / 4 / 0.63 / 2 / 7/3 / 0.63/0 / 2 / 11 / n.c. / 1 / 2 / 0.38 / - / - / - / - / - / - / 1 / 1 / -
EPDCU2862 / Al / E / 1 / 2 / 0.25 / 1 / 3 / 0.75 / 1 / 1 / - / 1 / 1 / - / 1 / 1 / - / 2 / 3/1 / 0.25/- / 1 / 1 / - / 1 / 1 / -
EPDCU2584 / Al / E / 1 / 1 / - / 1 / 1 / - / 1 / 1 / - / 1 / 3 / 0.63 / 1 / 1 / - / 1 / 2 / 0.63 / 1 / 1 / - / 1 / 1 / -
EPDCU5100 / Al / E / 1 / 2 / 0.50 / 1 / 3 / 0.50 / 1 / 3 / 0.63 / 2 / 3 / n.c. / 1 / 2 / 0.00 / 1 / 1 / - / 1 / 1 / - / - / - / -
EPDCU5046 / Al / E / 1 / 1 / - / 1 / 1 / - / 1 / 2 / 0.25 / 3 / 9 / n.c. / 1 / 2 / 0.25 / - / - / - / - / - / - / - / - / -
EPDCU4805 / Al / E / 1 / 1 / - / 1 / 3 / 0.50 / 1 / 2 / 0.38 / 4 / 4 / n.c. / 1 / 1 / - / 1 / 1 / - / - / - / - / 1 / 1 / -
EPDCU3647 / Al / E / - / - / - / 1 / 5 / 0.38 / 2 / 1/4 / -/0.63 / 4 / 10 / n.c. / 2 / 1/1 / -/- / - / - / - / - / - / - / 1 / 1 / -
EPDCU3547 / Al / E / 1 / 1 / - / 1 / 2 / 0.13 / 2 / 2/2 / 0.50/0.13 / 3 / 8 / n.c. / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / -
EPDCU3537 / Al / E / - / - / - / 1 / 3 / 0.75 / 2 / 4/1 / 0.88/- / 2 / 6 / n.c. / - / - / - / - / - / - / 1 / 2 / 0.25 / - / - / -
EPDCU3516 / Al / E / 1 / 1 / - / 1 / 1 / - / 1 / 1 / - / - / - / - / - / - / - / 1 / 1 / - / - / - / - / 1 / 2 / 0.13
EPDCU3454 / Al / E / 1 / 1 / - / 2 / 1/2 / -/0.38 / 1 / 1 / - / 2 / 2 / n.c. / 1 / 1 / - / 1 / 1 / - / 1 / 1 / - / - / - / -
EPDCU3158 / Al / E / 1 / 1 / - / 1 / 1 / - / 2 / 2/1 / 0.38/- / 1 / 1 / - / 1 / 1 / - / - / - / - / - / - / - / - / - / -
EPDCU3146 / Al / E / 1 / 1 / - / 1 / 1 / - / 1 / 2 / 0.00 / 2 / 4 / n.c. / 1 / 1 / - / - / - / - / - / - / - / - / - / -
EPDCU3117 / Al / E / 1 / 2 / 0.25 / 1 / 3 / 0.38 / 1 / 2 / 0.50 / 2 / 5 / n.c. / 1 / 1 / - / - / - / - / - / - / - / - / - / -
EPDCU2931 / Al / E / 1 / 2 / 0.50 / 1 / 3 / 0.75 / 1 / 5 / 0.63 / 2 / 4 / n.c. / 1 / 4 / 0.63 / - / - / - / - / - / - / - / - / -
EPDCU2804 / Al / E / 1 / 1 / - / 1 / 2 / 0.38 / 1 / 2 / 0.13 / 4 / 8 / n.c. / 1 / 1 / - / - / - / - / - / - / - / - / - / -
BPPCT001 / P / G / 1 / 6 / 0.63 / 1 / 2 / 0.25 / 1 / 4 / 0.63 / 3 / 11 / n.c. / 1 / 1 / - / 1 / 1 / - / 2 / 3/1 / 0.50/- / - / - / -
BPPCT006 / P / G / - / - / - / 1 / 1 / 1 / 1 / - / 1 / 1 / - / - / - / - / - / - / - / 1 / 1 / - / 1 / 1 / -
BPPCT007 / P / G / 1 / 7 / 0.75 / 1 / 5 / 0.25 / 1 / 6 / 0.88 / 3 / 11 / n.c. / 1 / 2 / 0.75 / - / - / - / - / - / - / - / - / -
BPPCT008 / P / G / 2 / 5/6 / 0.50/0.50 / 2 / 4/1 / 0.88/- / 2 / 7/1 / 0.63/- / 5 / 19 / n.c. / 1 / 3 / 0.75 / 1 / 1 / - / 1 / 1 / - / 1 / 1 / -
BPPCT011 / P / G / 1 / 7 / 1.00 / 1 / 3 / 0.63 / 1 / 3 / 0.38 / 2 / 6 / n.c. / 1 / 3 / 0.38 / 1 / 1 / - / 1 / 1 / - / 1 / 1 / -
BPPCT014 / P / G / 1 / 3 / 0.50 / 1 / 1 / 1 / 6 / 1.00 / 3 / 10 / n.c. / 1 / 2 / 0.50 / 2 / 11 / n.c. / 2 / 7 / n.c. / - / - / -
BPPCT015 / P / G / 2 / 8 / n.c. / - / - / - / - / - / - / - / - / 1 / 1 / - / - / - / - / 1 / 1 / - / - / - / -
BPPCT016 / P / G / 1 / 1 / - / 1 / 2 / 0.13 / - / - / - / 2 / 5 / n.c. / - / - / - / 1 / 1 / - / 1 / 1 / - / 1 / 1 / -
BPPCT017 / P / G / 1 / 7 / 1.00 / 1 / 3 / 0.88 / 1 / 5 / 0.88 / 1 / 9 / 0.75 / 1 / 1 / - / 1 / 1 / - / 1 / 1 / - / 2 / 4 / n.c.
BPPCT020 / P / G / 1 / 6 / 0.63 / - / - / - / - / - / 2 / 4 / n.c. / - / - / - / 1 / 1 / - / 1 / 2 / 0.13 / - / - / -
BPPCT023 / P / G / 1 / 7 / 0.63 / - / - / 1 / 1 / - / 1 / 1 / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / -
BPPCT025 / P / G / 1 / 8 / 0.63 / 1 / 3 / 0.63 / 1 / 5 / 0.13 / 3 / 13 / n.c. / - / - / - / 1 / 1 / - / 1 / 2 / 0.00 / - / - / -
BPPCT033 / P / G / - / - / - / 1 / 1 / 1 / 3 / 0.25 / 2 / 1/2 / -/0.38 / - / - / - / 1 / 1 / - / - / - / - / - / - / -
BPPCT037 / P / G / 1 / 5 / 0.38 / - / - / 1 / 3 / 0.88 / 2 / 3 / n.c. / 1 / 5 / 1.00 / 1 / 1 / - / 1 / 1 / - / - / - / -

Table 3S (continued)

Almond / Peach / Apricot / Japanese plum / European plum / Cherry / Apple / Pear / Strawberry
SSR / Sp1 / O2 / Am3 / A4 / Ho5 / Am3 / A4 / Ho5 / Am3 / A4 / Ho5 / Am3 / A4 / Ho5 / Am3 / A4 / Ho5 / Am3 / A4 / Ho5 / Am3 / A4 / Ho5 / Am3 / A4 / Ho5 / Am3 / A4 / Ho5
BPPCT038 / P / G / 1 / 6 / 0.75 / 1 / 5 / 0.75 / 1 / 7 / 0.75 / 3 / 12 / n.c. / 1 / 5 / 0.63 / - / - / - / 1 / 1 / - / 1 / 1 / -
CPPCT005 / P / G / 1 / 7 / 0.38 / 1 / 2 / 0.25 / 1 / 7 / 1.00 / 4 / 13 / n.c. / 1 / 1 / - / - / - / - / - / - / - / 1 / 1 / -
CPPCT006 / P / G / 1 / 9 / 0.88 / 1 / 3 / 0.88 / 1 / 4 / 0.88 / 3 / 9 / n.c. / 1 / 4 / 0.63 / 2 / 3/1 / 0.63/- / 1 / 4 / 0.88 / - / - / -
CPPCT014 / P / G / 1 / 8 / 1.00 / 1 / 3 / 0.38 / 1 / 3 / 0.75 / 2 / 5 / n.c. / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / -
CPPCT017 / P / G / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / -
CPPCT022 / P / G / 1 / 5 / 0.38 / 1 / 4 / 0.38 / 1 / 6 / 0.75 / 3 / 10 / n.c. / 1 / 1 / - / 1 / 2 / 0.25 / - / - / - / - / - / -
CPPCT028 / P / G / 1 / 9 / 0.75 / - / - / 2 / 6/1 / 0.88/- / 1 / 1 / - / 1 / 1 / - / 1 / 1 / - / 1 / 1 / - / 1 / 1 / -
CPPCT029 / P / G / 2 / 9 / n.c. / - / - / - / - / - / 2 / 6 / n.c. / 1 / 4 / 0.63 / - / - / - / - / - / - / - / - / -
CPPCT030 / P / G / 1 / 5 / 0.50 / 1 / 4 / 0.50 / 1 / 5 / 0.63 / 3 / 10 / n.c. / 1 / 1 / - / - / - / - / 1 / 1 / - / 1 / 1 / -
CPPCT031 / P / G / 1 / 2 / 0.13 / 1 / 1 / - / - / - / - / - / - / - / - / - / 1 / 1 / - / 1 / 1 / - / 1 / 1 / -
CPPCT033 / P / G / 1 / 6 / 0.75 / 1 / 2 / 0.25 / 1 / 5 / 1.00 / 3 / 8 / n.c. / 1 / 4 / 0.38 / 1 / 1 / - / 1 / 1 / - / 1 / 1 / -
EPPCU9268 / P / E / 1 / 5 / 0.50 / 1 / 2 / 0.13 / 1 / 1 / - / 1 / 2 / 0.13 / 1 / 5 / 0.38 / 2 / 5 / n.c. / - / - / - / - / - / -
EPPCU9300 / P / E / 1 / 9 / 1.00 / 1 / 4 / 0.50 / 1 / 7 / 1.00 / 3 / 13 / n.c. / 1 / 4 / 1.00 / 3 / 6/1 / n.c./- / 2 / 6 / n.c. / - / - / -
EPPCU9566 / P / E / 1 / 7 / 0.50 / 1 / 5 / 1.00 / 1 / 6 / 0.75 / 2 / 5 / n.c. / 1 / 1 / - / - / - / - / 3 / 8 / n.c. / - / - / -
EPPCU9773 / P / E / 1 / 7 / 0.63 / 1 / 2 / 0.50 / 1 / 3 / 0.50 / 2 / 11 / n.c. / 1 / 2 / 0.50 / 1 / 2 / 0.25 / 1 / 3 / 0.38 / - / - / -
EPPCU0532 / P / E / 1 / 6 / 0.75 / 1 / 3 / 0.38 / 1 / 6 / 0.88 / 3 / 10 / n.c. / 1 / 1 / - / - / - / - / - / - / - / - / - / -
EPPCU1106 / P / E / 1 / 1 / - / 1 / 1 / - / 1 / 9 / 1.00 / 2 / 9 / n.c. / 1 / 4 / 0.38 / - / - / - / - / - / - / - / - / -
EPPCU1198 / P / E / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / -
EPPCU2000 / P / E / 1 / 7 / 0.75 / 1 / 2 / 0.50 / 1 / 3 / 0.25 / 3 / 5 / n.c. / 1 / 1 / - / - / - / - / - / - / - / - / - / -
EPPCU2256 / P / E / 1 / 9 / 0.75 / 1 / 4 / 0.50 / 1 / 9 / 1.00 / 3 / 13 / n.c. / 2 / 3/2 / 0.38/0.63 / 1 / 1 / - / 1 / 1 / - / 1 / 2 / 0.13
EPPCU2957 / P / E / 1 / 3 / 0.50 / 1 / 3 / 1.00 / 1 / 7 / 0.88 / - / - / - / 1 / 1 / - / - / - / - / - / - / - / 1 / 1 / -
EPPCU4921 / P / E / 1 / 6 / 0.88 / 1 / 1 / - / 1 / 6 / 1.00 / 2 / 8 / n.c. / 1 / 1 / - / 1 / 1 / - / 1 / 1 / - / - / - / -
EPPCU4962 / P / E / - / - / - / 1 / 5 / 0.63 / 1 / 7 / 0.63 / 3 / 6 / n.c. / 1 / 1 / - / - / - / - / - / - / - / - / - / -
EPPCU5191 / P / E / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / 1 / 4 / 0.38 / 1 / 2 / 0.63
EPPCU6216 / P / E / 1 / 7 / 0.88 / 1 / 4 / 0.75 / 1 / 6 / 0.88 / 1 / 2 / 0.13 / 1 / 1 / - / 1 / 5 / 0.50. / - / - / - / - / - / -
EPPCU7340 / P / E / 1 / 6 / 0.50 / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / -
EPPCU9054 / P / E / - / - / - / - / - / - / - / - / - / 1 / 2 / 0.00 / - / - / - / - / - / - / - / - / - / 1 / 2 / 0.13
EPPCU9168 / P / E / 1 / 6 / 0.63 / 1 / 5 / 0.63 / 1 / 4 / 0.75 / 2 / 5 / n.c. / 1 / 3 / 0.63 / - / - / - / - / - / - / - / - / -
EPPCU0491 / P / E / - / - / - / 1 / 4 / 0.25 / - / - / - / - / - / - / 1 / 4 / 0.43 / - / - / - / - / - / - / - / - / -
EPPCU1966 / P / E / 1 / 7 / 0.50 / - / - / - / 1 / 7 / 0.75 / 2 / 4 / n.c. / - / - / - / 2 / 6 / n.c. / - / - / - / - / - / -
EPPCU2288 / P / E / 1 / 9 / 0.88 / - / - / - / 1 / 2 / 0.50 / 3 / 14 / n.c. / 1 / 1 / - / - / - / - / - / - / - / - / - / -

Table 3S (continued)

Almond / Peach / Apricot / Japanese plum / European plum / Cherry / Apple / Pear / Strawberry
SSR / Sp1 / O2 / Am3 / A4 / Ho5 / Am3 / A4 / Ho5 / Am3 / A4 / Ho5 / Am3 / A4 / Ho5 / Am3 / A4 / Ho5 / Am3 / A4 / Ho5 / Am3 / A4 / Ho5 / Am3 / A4 / Ho5 / Am3 / A4 / Ho5
EPPCU3088 / P / E / 1 / 6 / 0.88 / 1 / 2 / 0.25 / 1 / 4 / 0.88 / 2 / 5 / n.c. / 1 / 4 / 0.63 / - / - / - / - / - / - / - / - / -
EPPCU4726 / P / E / 1 / 8 / 0.63 / 1 / 1 / - / 1 / 3 / 0.75 / 3 / 10 / n.c. / 1 / 1 / - / 1 / 3 / 0.63 / 1 / 1 / - / - / - / -
EPPCU5176 / P / E / 1 / 7 / 0.63 / - / - / - / 1 / 3 / 1.00 / 2 / 4 / n.c. / 1 / 1 / - / - / - / - / - / - / - / 1 / 3 / 0.50
EPPCU8702 / P / E / 1 / 3 / 0.20 / 1 / 2 / 0.13 / 1 / 4 / 0.63 / - / - / - / 1 / 1 / - / - / - / - / - / - / - / - / - / -
EPPCU1098 / P / E / 1 / 6 / 0.63 / 1 / 2 / 0.63 / 1 / 2 / 0.13 / 3 / 10 / n.c. / 1 / 1 / - / 1 / 1 / - / 1 / 1 / - / 1 / 1 / -
CPSCT004 / JP / G / 1 / 2 / 0.25 / 1 / 2 / 0.13 / 1 / 2 / 0.38 / 1 / 2 / 0.13 / 1 / 1 / - / 2 / 4 / n.c. / 2 / 4 / n.c. / 1 / 2 / 0.00
CPSCT005 / JP / G / - / - / - / 1 / 2 / 0.38 / 1 / 3 / 0.63 / 2 / 9 / n.c. / - / - / - / 2 / 5 / n.c. / - / - / - / - / - / -
CPSCT006 / JP / G / 1 / 4 / 0.88 / 1 / 2 / 0.13 / 1 / 3 / 0.25 / 2 / 10 / n.c. / 1 / 1 / - / 2 / 7 / n.c. / 2 / 7 / n.c. / 1 / 5 / 0.50
CPSCT008 / JP / G / 1 / 6 / 1.00 / 1 / 1 / - / 1 / 4 / 0.29 / 2 / 6 / n.c. / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / -
CPSCT010 / JP / G / 1 / 7 / 0.75 / 1 / 4 / 1.00 / 1 / 3 / 0.50 / 2 / 10 / n.c. / 1 / 1 / - / - / - / - / 1 / 2 / 0.63 / - / - / -
CPSCT011 / JP / G / 1 / 2 / 0.13 / 1 / 1 / - / 1 / 5 / 1.00 / 3 / 12 / n.c. / - / - / - / - / - / - / 2 / 6 / n.c. / - / - / -
CPSCT012 / JP / G / 1 / 8 / 0.88 / 1 / 3 / 0.50 / 1 / 3 / 0.50 / 3 / 10 / n.c. / 1 / 2 / 0.63 / 2 / 6 / n.c. / - / - / - / - / - / -
CPSCT018 / JP / G / 1 / 8 / 0.57 / 1 / 2 / 0.13 / 1 / 2 / 0.25 / 3 / 10 / n.c. / 1 / 5 / 0.63 / 2 / 3 / n.c. / 1 / 4 / 0.13 / - / - / -
CPSCT021 / JP / G / 1 / 5 / 0.25 / 1 / 2 / 0.13 / 1 / 4 / 0.63 / 2 / 11 / n.c. / 1 / 2 / 0.25 / - / - / - / 1 / 3 / 0.13 / 1 / 1 / -
CPSCT022 / JP / G / 1 / 2 / 0.38 / 1 / 2 / 0.38 / 1 / 1 / - / 3 / 7 / n.c. / 1 / 2 / 0.63 / 1 / 4 / 0.38 / 1 / 6 / 0.75 / - / - / -
CPSCT024 / JP / G / 1 / 2 / 0.63 / 1 / 1 / - / 1 / 4 / 0.63 / 3 / 10 / n.c. / 1 / 1 / - / 1 / 1 / - / - / - / - / - / - / -
CPSCT025 / JP / G / 1 / 1 / - / 1 / 1 / - / 1 / 5 / 0.63 / 3 / 8 / n.c. / - / - / - / 1 / 2 / 0.38 / 1 / 1 / - / 1 / 1 / -
CPSCT026 / JP / G / 1 / 1 / - / 2 / 1/1 / - / 2 / 5/3 / 0.63/0.50 / 4 / 14 / n.c. / 1 / 2 / 0.00 / - / - / - / - / - / - / - / - / -
CPSCT027 / JP / G / 1 / 6 / 0.75 / 1 / 1 / - / - / - / - / 2 / 9 / n.c. / 1 / 2 / 0.63 / 2 / 5 / n.c. / - / - / - / - / - / -
CPSCT029 / JP / G / 1 / 1 / - / 1 / 1 / - / 1 / 1 / - / 1 / 5 / 0.63 / 1 / 5 / 0.75 / - / - / - / 1 / 1 / - / 1 / 1 / -
CPSCT030 / JP / G / 1 / 5 / 0.50 / 1 / 1 / - / 1 / 3 / 1.00 / 3 / 12 / n.c. / 1 / 1 / - / - / - / - / 1 / 1 / - / 1 / 1 / -
CPSCT032 / JP / G / 2 / 2/5 / 0.25/0.38 / - / - / - / 1 / 2 / 0.63 / 3 / 10 / n.c. / 1 / 3 / 0.63 / 1 / 5 / 0.50 / 1 / 1 / - / - / - / -
CPSCT033 / JP / G / 1 / 6 / 0.88 / 1 / 4 / 0.63 / 1 / 4 / 0.50 / 3 / 12 / n.c. / 2 / 2/4 / 0.25/0.63 / 2 / 6 / n.c. / - / - / - / - / - / -
CPSCT034 / JP / G / - / - / - / - / - / - / 1 / 3 / 0.50 / 3 / 11 / n.c. / 1 / 2 / 0.25 / - / - / - / - / - / - / - / - / -
CPSCT035 / JP / G / 1 / 2 / 0.13 / 1 / 1 / - / - / - / - / 2 / 9 / n.c. / 1 / 3 / 0.38 / - / - / - / - / - / - / - / - / -
CPSCT036 / JP / G / 1 / 1 / - / 1 / 1 / - / 1 / 2 / 0.50 / 3 / 7 / n.c. / 1 / 2 / 0.50 / - / - / - / - / - / - / - / - / -
CPSCT037 / JP / G / - / - / - / 1 / 1 / - / - / - / - / 3 / 7 / n.c. / 1 / 3 / 0.25 / - / - / - / - / - / - / - / - / -
CPSCT039 / JP / G / 2 / 6/4 / 0.83/0.63 / 1 / 3 / 0.38 / 1 / 6 / 0.75 / 3 / 10 / n.c. / 1 / 2 / 0.25 / 1 / 4 / 0.63 / - / - / - / - / - / -
CPSCT042 / JP / G / 1 / 6 / 1.00 / 1 / 1 / - / 1 / 4 / 0.88 / 3 / 10 / n.c. / - / - / - / 1 / 3 / 0.38 / - / - / - / - / - / -
CPSCT044 / JP / G / 1 / 5 / 0.88 / 1 / 1 / - / 1 / 3 / 0.50 / 3 / 14 / n.c. / 1 / 2 / 0.63 / 2 / 4 / n.c. / - / - / - / - / - / -

Table 3S (continued)

Almond / Peach / Apricot / Japanese plum / European plum / Cherry / Apple / Pear / Strawberry
SSR / Sp1 / O2 / Am3 / A4 / Ho5 / Am3 / A4 / Ho5 / Am3 / A4 / Ho5 / Am3 / A4 / Ho5 / Am3 / A4 / Ho5 / Am3 / A4 / Ho5 / Am3 / A4 / Ho5 / Am3 / A4 / Ho5 / Am3 / A4 / Ho5
AMPA92 / Ap / G / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / -
AMPA93 / Ap / G / 1 / 6 / 0.00 / 1 / 3 / 0.50 / - / - / - / 2 / 7 / n.c. / 1 / 5 / 0.50 / - / - / - / - / - / - / - / - / -
AMPA94 / Ap / G / 1 / 3 / 0.25 / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / 1 / 1 / - / - / - / - / - / - / -
AMPA100 / Ap / G / 1 / 6 / 0.63 / 1 / 1 / - / 1 / 3 / 0.63 / 3 / 8 / n.c. / 1 / 1 / - / 2 / 6 / n.c. / - / - / - / - / - / -
AMPA101 / Ap / G / 1 / 7 / 0.50 / 1 / 2 / 0.63 / 1 / 6 / 1.00 / 3 / 12 / n.c. / 1 / 5 / 0.88 / - / - / - / - / - / - / - / - / -
AMPA103 / Ap / G / 1 / 6 / 0.75 / 1 / 3 / 0.13 / 1 / 5 / 0.75 / 3 / 12 / n.c. / 1 / 2 / 0.25 / - / - / - / - / - / - / - / - / -
AMPA105 / Ap / G / 1 / 8 / 0.88 / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / 2 / 3/1 / 0.63/- / - / - / - / - / - / -
AMPA107 / Ap / G / 1 / 6 / 0.50 / 1 / 3 / 0.88 / 1 / 6 / 0.57 / 1 / 5 / 0.63 / 1 / 2 / 0.38 / - / - / - / - / - / - / - / - / -
AMPA109 / Ap / G / - / - / - / 1 / 4 / 0.38 / - / - / - / 4 / 17 / n.c. / 1 / 3 / 0.63 / - / - / - / - / - / - / 1 / 1 / -
AMPA110 / Ap / G / 1 / 8 / 0.75 / 1 / 2 / 0.38 / 1 / 7 / 1.00 / 3 / 11 / n.c. / 1 / 2 / 0.14 / 1 / 1 / - / - / - / - / - / - / -
AMPA112 / Ap / E / 1 / 5 / 0.75 / 1 / 2 / 0.25 / 1 / 3 / 0.25 / 1 / 2 / 0.13 / 1 / 1 / - / - / - / - / - / - / - / 2 / 5 / n.c.
AMPA113 / Ap / E / 1 / 8 / 0.75 / 1 / 3 / 0.13 / 1 / 5 / 0.63 / 2 / 7 / n.c. / 1 / 4 / 0.75 / 1 / 4 / 0.63 / 1 / 2 / 0.13 / - / - / -
AMPA114 / Ap / E / 1 / 1 / - / 1 / 1 / - / 1 / 2 / 0.25 / 2 / 7 / n.c. / 1 / 1 / - / - / - / - / 1 / 1 / - / - / - / -
AMPA115 / Ap / E / 1 / 8 / 0.63 / 1 / 2 / 0.25 / 1 / 5 / 0.25 / 3 / 8 / n.c. / 1 / 5 / 0.25 / 1 / 1 / - / 1 / 1 / - / 1 / 1 / -
AMPA116 / Ap / E / 1 / 4 / 0.63 / 1 / 2 / 0.38 / 1 / 3 / 0.38 / 2 / 9 / n.c. / 1 / 1 / - / 1 / 1 / - / 1 / 1 / - / 1 / 1 / -
AMPA118 / Ap / E / 1 / 1 / - / 1 / 1 / - / 1 / 1 / - / 1 / 1 / - / 1 / 3 / 0.50 / 1 / 1 / - / 1 / 2 / 0.00 / 1 / 1 / -
AMPA119 / Ap / E / 1 / 1 / - / 1 / 2 / 0.13 / 1 / 7 / 0.75 / 3 / 13 / n.c. / 1 / 2 / 0.13 / - / - / - / - / - / - / - / - / -
AMPA121 / Ap / E / 1 / 8 / 0.75 / 1 / 2 / 0.25 / - / - / - / 3 / 8 / n.c. / 1 / 6 / 1.00 / - / - / - / - / - / - / - / - / -
AMPA122 / Ap / E / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / 1 / 1 / - / - / - / - / - / - / -
AMPA123 / Ap / E / - / - / - / 1 / 1 / - / 1 / 4 / 0.75 / 3 / 7 / n.c. / - / - / - / - / - / - / - / - / - / 1 / 2 / 0.13
AMPA124 / Ap / E / 2 / 4/1 / 0.50/- / 1 / 1 / - / 1 / 4 / 0.13 / 4 / 17 / n.c. / 1 / 1 / - / - / - / - / - / - / - / 1 / 1 / -
AMPA126 / Ap / E / - / - / - / 1 / 1 / - / 1 / 4 / 0.25 / 1 / 3 / 0.13 / - / - / - / - / - / - / 1 / 1 / - / - / - / -
AMPA127 / Ap / E / 1 / 1 / - / 1 / 1 / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / 1 / 1 / - / - / - / - / - / - / -

1Sp. SSR source species: Al = almond; P= peach; Ap= apricot; JP = Japanese plum

2 O. origin of the microsatellite: G = from genomic DNA; E = from ESTs

3 Am. amplification: - = no amplification; 1-3 = estimated number of amplified loci

4 A. number of alleles detected for the primer pair. For primer pairs that detect two loci that can be individually interpreted the data for each locus is separated by a slash. For primer pairs with three loci or two loci with unclear allele assignment, the total number of alleles is shown.

5 Ho. observed heterozygosity for single-locus SSRs. For primer pairs that detect two loci that can be individually interpreted the data for each locus is separated by a slash. n.c. = not calculated (for primer pairs detecting two or three loci of unclear interpretation).