Table S1. List of the Maize Germplasm Used in This Study

Table S1. List of the maize germplasm used in this study.

Name / Reid / Tem-Tropic I / P / TSPT / Lancaster / Pedigree/Source
B73 / 0.997 / 0.001 / 0.001 / 0.001 / 0.000 / Derived from BSSS
LD175-1 / 0.995 / 0.001 / 0.002 / 0.001 / 0.001 / Unknown
Ye478 / 0.991 / 0.001 / 0.006 / 0.001 / 0.001 / Ye8112 × Shen5003
Liao7794 / 0.990 / 0.002 / 0.002 / 0.004 / 0.002 / Tie7922 × Ye8112/(32 × Shen5003）
Ye8112 / 0.985 / 0.001 / 0.001 / 0.011 / 0.001 / Hybrid 3382 × Hhybrid 3147
32 / 0.984 / 0.006 / 0.003 / 0.005 / 0.003 / Pioneer hybrid P3382
Ye488 / 0.978 / 0.002 / 0.013 / 0.004 / 0.003 / Ye8112 × Shen5003
488 / 0.969 / 0.002 / 0.006 / 0.002 / 0.021 / Unknown
Tie7922 / 0.928 / 0.002 / 0.062 / 0.002 / 0.006 / Pioneer hybrid P3382
3189 / 0.875 / 0.002 / 0.119 / 0.002 / 0.002 / Shen5003 × Ye8112
8723 / 0.804 / 0.006 / 0.044 / 0.017 / 0.130 / Unknown
82Huangzaosi / 0.778 / 0.210 / 0.004 / 0.006 / 0.002 / B73 × Bup44
XZ19 / 0.776 / 0.211 / 0.003 / 0.007 / 0.002 / Jin0-14 × xin335
Cheng435 / 0.757 / 0.167 / 0.003 / 0.008 / 0.066 / Unknown
FR218 / 0.745 / 0.242 / 0.002 / 0.008 / 0.002 / America
Liao5110 / 0.729 / 0.009 / 0.246 / 0.008 / 0.008 / Tie7922 × Shen5003
C8605-2 / 0.708 / 0.006 / 0.217 / 0.007 / 0.062 / Tie7922 × Shen5003
Ningchen20 / 0.703 / 0.258 / 0.015 / 0.003 / 0.021 / B73 × Ye478
Ji854 / 0.690 / 0.299 / 0.002 / 0.005 / 0.004 / Huangzaosi × Zi330
785 / 0.680 / 0.261 / 0.007 / 0.005 / 0.047 / Zi330 × Huangzaosi
Ji856 / 0.619 / 0.340 / 0.002 / 0.002 / 0.036 / Huangzaosi × Zi330
Lo1125 / 0.612 / 0.230 / 0.009 / 0.004 / 0.144 / Pioneer ADA (PR3374)
A801 / 0.596 / 0.249 / 0.130 / 0.007 / 0.018 / Dan9042 × (Dan9046 × Mohuang9)
Yi12 / 0.561 / 0.029 / 0.109 / 0.171 / 0.130 / Unknown
BC4B / 0.548 / 0.431 / 0.002 / 0.005 / 0.014 / Yugoslavia hybrid
Qin8-22-1 / 0.548 / 0.297 / 0.116 / 0.021 / 0.018 / Unknown
Su75 / 0.547 / 0.132 / 0.163 / 0.021 / 0.137 / Tropical germplasm
De811 / 0.54 / 0.349 / 0.027 / 0.006 / 0.077 / B14
Ji870 / 0.533 / 0.436 / 0.002 / 0.014 / 0.016 / 9146 × B73
Zhong106 / 0.526 / 0.290 / 0.046 / 0.046 / 0.092 / Yemen dwarf corn
K10 / 0.500 / 0.002 / 0.014 / 0.007 / 0.476 / Shen5003 × Chang3
Zhongyin10 / 0.475 / 0.397 / 0.105 / 0.007 / 0.016 / Japan
HD586 / 0.474 / 0.261 / 0.002 / 0.260 / 0.003 / Unknown
8112 / 0.470 / 0.198 / 0.007 / 0.025 / 0.299 / Hybrid3382 × Hybrid3147
MP704 / 0.467 / 0.319 / 0.009 / 0.012 / 0.194 / Nigeria
B37 / 0.467 / 0.312 / 0.168 / 0.002 / 0.051 / BSSSC0
Qi410 / 0.452 / 0.388 / 0.016 / 0.123 / 0.021 / Ye8112 × Baibangnian
Fu8701 / 0.446 / 0.332 / 0.011 / 0.004 / 0.207 / Fu746 × F542
Ji876 / 0.420 / 0.299 / 0.004 / 0.004 / 0.273 / SC55M
Fu130 / 0.404 / 0.289 / 0.004 / 0.059 / 0.243 / Yinglizi × Zi330
75-322 / 0.400 / 0.216 / 0.004 / 0.002 / 0.378 / Italy
Tie222 / 0.380 / 0.363 / 0.042 / 0.002 / 0.213 / 334-11 × H84
Liao2204 / 0.364 / 0.176 / 0.345 / 0.005 / 0.109 / America
Liao2202 / 0.364 / 0.219 / 0.302 / 0.005 / 0.111 / America
72-105 / 0.299 / 0.249 / 0.184 / 0.002 / 0.267 / Italy
Wu109 / 0.005 / 0.943 / 0.010 / 0.011 / 0.030 / S-410 × 8B
Wu308 / 0.005 / 0.928 / 0.010 / 0.018 / 0.039 / Selected from Wu109
Wuxi205 / 0.012 / 0.891 / 0.042 / 0.047 / 0.008 / Landrace Liaodongbai
CML125-2 / 0.012 / 0.889 / 0.062 / 0.017 / 0.020 / Mexico
VG85-5 / 0.040 / 0.879 / 0.009 / 0.013 / 0.060 / Shen5003 × Guan17
85Bai41 / 0.037 / 0.878 / 0.008 / 0.017 / 0.060 / Mo17 × 414
Yanlai3 / 0.003 / 0.868 / 0.025 / 0.098 / 0.006 / Opaque-2
Yuanwu02 / 0.002 / 0.868 / 0.008 / 0.087 / 0.035 / Wu105 × Duo229
Jiao51 / 0.002 / 0.866 / 0.010 / 0.121 / 0.001 / Landrace Jiaomaerhuangzao
Wu202 / 0.005 / 0.860 / 0.009 / 0.024 / 0.102 / Wu403 × Bup29
A509 / 0.003 / 0.859 / 0.004 / 0.132 / 0.002 / America
Yan172 / 0.067 / 0.855 / 0.021 / 0.050 / 0.007 / Fucheng dwarfing corn
Fanrong2 / 0.095 / 0.851 / 0.004 / 0.035 / 0.014 / Landrace Badaoqu
CWu215B / 0.007 / 0.848 / 0.009 / 0.019 / 0.117 / RC264Ht × 88（9-2）
A495 / 0.038 / 0.843 / 0.006 / 0.100 / 0.012 / America
75-24 / 0.012 / 0.843 / 0.007 / 0.133 / 0.005 / (77 × Wu151)
CML58 / 0.008 / 0.842 / 0.004 / 0.137 / 0.009 / Mexico
P51 / 0.067 / 0.840 / 0.013 / 0.007 / 0.074 / America
Shuangtaiwu / 0.010 / 0.835 / 0.003 / 0.147 / 0.006 / (Shuang26A × Tai184) × Wu151B4
Za5125.su / 0.086 / 0.825 / 0.004 / 0.002 / 0.084 / America
Duo229 / 0.011 / 0.821 / 0.008 / 0.158 / 0.002 / Puyangshihuilou × Xiaohuangyumi
CML61 / 0.042 / 0.817 / 0.069 / 0.045 / 0.027 / Mexico
Yanlai2 / 0.071 / 0.815 / 0.064 / 0.034 / 0.015 / Opaque-2
GB / 0.005 / 0.815 / 0.003 / 0.049 / 0.128 / Landrace Tianjinbaiyumi
FusheA / 0.002 / 0.814 / 0.004 / 0.178 / 0.002 / Unknown
Feng273 / 0.106 / 0.811 / 0.009 / 0.069 / 0.005 / Chunza1
Jingnuo2 / 0.017 / 0.810 / 0.040 / 0.127 / 0.006 / Unknown
Jiu22 / 0.016 / 0.805 / 0.030 / 0.092 / 0.057 / Unknown
707 / 0.006 / 0.805 / 0.084 / 0.103 / 0.003 / Derived from inbred 77
Ji69 / 0.003 / 0.805 / 0.025 / 0.158 / 0.009 / 2569 × Aishui28
Yan103 / 0.009 / 0.804 / 0.076 / 0.052 / 0.059 / Yuanwu02
Meibao / 0.002 / 0.802 / 0.005 / 0.189 / 0.002 / America
Xiangai3 / 0.149 / 0.800 / 0.012 / 0.024 / 0.014 / Unknown
Wu302 / 0.002 / 0.796 / 0.009 / 0.191 / 0.002 / Landrace Yejihong
Ji432 / 0.051 / 0.792 / 0.109 / 0.042 / 0.006 / Mixed population
AR226-2 / 0.103 / 0.786 / 0.007 / 0.024 / 0.080 / America
M9 / 0.029 / 0.785 / 0.172 / 0.010 / 0.004 / Mexico
Huobai / 0.054 / 0.781 / 0.006 / 0.137 / 0.023 / Landrace Huojiabaimaya
Huangjin63 / 0.003 / 0.777 / 0.007 / 0.210 / 0.002 / Huangxiao162 × Jin131
Lu45 / 0.170 / 0.775 / 0.016 / 0.026 / 0.014 / Luda Red Cob
Longkang279 / 0.108 / 0.774 / 0.040 / 0.070 / 0.008 / Unknown
Fu844 / 0.091 / 0.772 / 0.007 / 0.021 / 0.108 / Ji485 × 508
Chi545 / 0.066 / 0.770 / 0.097 / 0.061 / 0.007 / Landrace Baimaya
Zhangjin6 / 0.127 / 0.764 / 0.010 / 0.013 / 0.085 / Landrace Jinhuanghou
CML67 / 0.006 / 0.764 / 0.031 / 0.149 / 0.049 / Mexico
Ai154 / 0.002 / 0.760 / 0.007 / 0.229 / 0.002 / Wuzhi dwarf corn
Sheai16 / 0.109 / 0.759 / 0.006 / 0.114 / 0.012 / WF9 × M14/157 × 158
Zheng22 / 0.173 / 0.756 / 0.061 / 0.005 / 0.004 / Dan340 × E28
Da255 / 0.053 / 0.754 / 0.005 / 0.026 / 0.162 / Unknown
55113-3-3-5 / 0.121 / 0.752 / 0.005 / 0.016 / 0.107 / ZPDC551B
M256 / 0.037 / 0.745 / 0.158 / 0.057 / 0.003 / Mexico
Ning37 / 0.188 / 0.744 / 0.020 / 0.039 / 0.010 / Yan753 × 7601
Fu8527 / 0.103 / 0.741 / 0.046 / 0.090 / 0.019 / Dan360 × E28
Tzi28 / 0.124 / 0.738 / 0.091 / 0.009 / 0.038 / Nigeria
Dong623O2 / 0.014 / 0.738 / 0.096 / 0.143 / 0.009 / Unknown
W5543.su / 0.156 / 0.737 / 0.007 / 0.004 / 0.096 / America
Chang7 Daxian1 / 0.002 / 0.736 / 0.005 / 0.179 / 0.078 / Unknown
Fu842 / 0.115 / 0.732 / 0.045 / 0.006 / 0.101 / Dian11 × Yi210 × Fu746
Feng263 / 0.017 / 0.730 / 0.012 / 0.098 / 0.144 / Landrace Huatingbaimaya
Yunnan9-6 / 0.014 / 0.730 / 0.152 / 0.097 / 0.006 / Landrace Yunnandabaibaogu
Jinnuo / 0.010 / 0.726 / 0.015 / 0.200 / 0.049 / Jinhuanghou × Waxy corn
Chengbei711 / 0.126 / 0.722 / 0.074 / 0.050 / 0.029 / Quntuan1
Jiu03 / 0.153 / 0.72 / 0.005 / 0.109 / 0.013 / Unknown
Hua160 / 0.170 / 0.716 / 0.015 / 0.078 / 0.021 / Huadong2
BC19 / 0.048 / 0.714 / 0.021 / 0.046 / 0.171 / Yugoslavia
200-24-13413 / 0.023 / 0.712 / 0.010 / 0.075 / 0.180 / Unknown
Ji63 / 0.171 / 0.709 / 0.016 / 0.007 / 0.097 / (127-32 × Tie88) × (W24 × W20)
Baihe43 / 0.139 / 0.708 / 0.074 / 0.004 / 0.075 / Landrace Baihe
Weifeng322 / 0.154 / 0.700 / 0.007 / 0.031 / 0.109 / W59E × Fengke
Hengbai522 / 0.122 / 0.694 / 0.049 / 0.119 / 0.017 / Landrace Hengbaiduosui
Wei3322 / 0.079 / 0.694 / 0.031 / 0.029 / 0.167 / Weier42
ShuangM9B-1 / 0.022 / 0.689 / 0.183 / 0.101 / 0.006 / CIMMYT
CG10 / 0.245 / 0.686 / 0.018 / 0.014 / 0.037 / Canada
GR29086-3 / 0.177 / 0.686 / 0.005 / 0.012 / 0.120 / France
Han102 / 0.031 / 0.686 / 0.034 / 0.049 / 0.199 / Henanduosui
P39.su / 0.178 / 0.685 / 0.009 / 0.002 / 0.126 / America
W6786.su / 0.124 / 0.685 / 0.004 / 0.004 / 0.184 / America
Duohangjin / 0.141 / 0.679 / 0.007 / 0.021 / 0.152 / Landrace Jinhuanghou
Gan41 / 0.027 / 0.676 / 0.013 / 0.023 / 0.261 / Unknown
CN165 / 0.137 / 0.674 / 0.125 / 0.007 / 0.057 / Pioneer hybrid P78599
Zhengbai11 / 0.008 / 0.674 / 0.098 / 0.021 / 0.200 / Mobai
Cheng2 / 0.005 / 0.673 / 0.008 / 0.207 / 0.107 / Huobai × 525
Suwan1611 / 0.064 / 0.672 / 0.104 / 0.148 / 0.012 / Suwan2
E28 / 0.161 / 0.671 / 0.088 / 0.004 / 0.076 / (Lu9 Kuan × A619Ht) × Lu9 Kuan
H66.6 / 0.003 / 0.670 / 0.007 / 0.119 / 0.201 / Yugoslavia
Xing26 / 0.011 / 0.664 / 0.014 / 0.298 / 0.013 / Huang61, Xing11, Jin03
2005 / 0.013 / 0.661 / 0.112 / 0.086 / 0.127 / Unknown
HDa-5 / 0.141 / 0.660 / 0.032 / 0.007 / 0.159 / H84 × Luda Red Cob
F516 / 0.098 / 0.660 / 0.005 / 0.034 / 0.204 / France
YX46 / 0.232 / 0.659 / 0.006 / 0.008 / 0.096 / Soviet Union
Yue267-3-1 / 0.180 / 0.656 / 0.008 / 0.027 / 0.129 / Shen5003× Kanghandalihuang
18 / 0.108 / 0.656 / 0.007 / 0.029 / 0.199 / North Korea
F72 / 0.230 / 0.655 / 0.004 / 0.011 / 0.100 / France
13AO2 / 0.153 / 0.655 / 0.082 / 0.026 / 0.083 / Unknown
Ziduosui / 0.007 / 0.654 / 0.069 / 0.117 / 0.154 / Unknown
91af361 / 0.008 / 0.653 / 0.006 / 0.084 / 0.249 / Unknown
Wutang448 / 0.011 / 0.652 / 0.011 / 0.321 / 0.005 / Landrace Tangsipingtou
Longkang15 / 0.082 / 0.647 / 0.020 / 0.009 / 0.241 / RC103 × Chang3
Fu8716 / 0.058 / 0.645 / 0.009 / 0.101 / 0.187 / Qujin × 413
Jitian15 / 0.161 / 0.643 / 0.003 / 0.003 / 0.189 / Sweet corn hybrid
Danhuang02 / 0.119 / 0.638 / 0.049 / 0.028 / 0.165 / Selected from E28 Synthetic
Fu8529 / 0.087 / 0.638 / 0.065 / 0.040 / 0.171 / Dan360 × E28
Yue89A12-1 / 0.178 / 0.637 / 0.080 / 0.008 / 0.097 / Unknown
ZHONG7 / 0.334 / 0.635 / 0.002 / 0.008 / 0.022 / Yugoslavia
Chaoxianbai / 0.147 / 0.635 / 0.030 / 0.182 / 0.006 / Landrace Chaoxianbaiyumi
Pa405 / 0.178 / 0.632 / 0.064 / 0.013 / 0.113 / America
Luyuan92 / 0.181 / 0.630 / 0.006 / 0.004 / 0.179 / Yuanqi122 × 1137
H205 / 0.172 / 0.630 / 0.008 / 0.003 / 0.187 / Unknown
Zhong128 / 0.027 / 0.624 / 0.099 / 0.127 / 0.123 / Zhong7490 × Ni2118
Bainuo6 / 0.243 / 0.621 / 0.115 / 0.008 / 0.014 / Unknown
Lu28 / 0.132 / 0.621 / 0.035 / 0.032 / 0.179 / Ludahonggu
NN14B / 0.305 / 0.618 / 0.008 / 0.042 / 0.027 / Australia
Xing83 / 0.098 / 0.618 / 0.042 / 0.087 / 0.156 / 144 × 147
M3736 / 0.100 / 0.617 / 0.038 / 0.023 / 0.222 / Meibao
85Bai64 / 0.095 / 0.616 / 0.012 / 0.102 / 0.175 / 85huang11 × Wu403
91huang10 / 0.189 / 0.610 / 0.004 / 0.015 / 0.182 / Dian11A × Lu9
79131 / 0.004 / 0.610 / 0.006 / 0.183 / 0.198 / Jin261, Bai313, Liaojin32-1,Wei22
Xuan6 / 0.103 / 0.602 / 0.012 / 0.110 / 0.172 / H95 × Mo17
Jingnuo6 / 0.103 / 0.601 / 0.081 / 0.196 / 0.019 / Unknown
D729 / 0.031 / 0.598 / 0.021 / 0.055 / 0.294 / Dtuan synthetic
F520-1.reccob / 0.345 / 0.597 / 0.009 / 0.046 / 0.003 / France
Aijin525 / 0.044 / 0.597 / 0.024 / 0.130 / 0.205 / Wuzhi dwarf Maize × Jinhuanghou
Tai183 / 0.206 / 0.596 / 0.056 / 0.084 / 0.058 / Hunxuan1
L105 / 0.011 / 0.593 / 0.149 / 0.042 / 0.206 / America
Dan3116 / 0.184 / 0.587 / 0.114 / 0.003 / 0.112 / 107, E28
B97 / 0.155 / 0.587 / 0.076 / 0.007 / 0.174 / BSCB1（R）C9-2
Timpunia-1 / 0.286 / 0.586 / 0.007 / 0.019 / 0.101 / Germany
Va35 / 0.019 / 0.585 / 0.076 / 0.004 / 0.316 / America
Fengke1 / 0.054 / 0.583 / 0.008 / 0.152 / 0.203 / Keli67 × Oh43
Zhongxi042 / 0.081 / 0.575 / 0.208 / 0.011 / 0.125 / Across, 7741, HEO2
B12 / 0.083 / 0.572 / 0.008 / 0.149 / 0.188 / B73 × Super sweet
F522 / 0.402 / 0.570 / 0.004 / 0.019 / 0.005 / France
RC103Luo31B / 0.020 / 0.568 / 0.006 / 0.004 / 0.402 / RC103 × Luo31B
Lan766-4-2 / 0.236 / 0.567 / 0.031 / 0.013 / 0.153 / Luanpinghuang × W24
Ji866 / 0.250 / 0.566 / 0.003 / 0.003 / 0.179 / JizongB24-2
Cai11-8 / 0.003 / 0.562 / 0.009 / 0.038 / 0.387 / MenkeB × Zi330
Shen125 / 0.209 / 0.558 / 0.143 / 0.005 / 0.085 / 6045 × (Shen5003 × E28)
Zhebai1 / 0.134 / 0.553 / 0.057 / 0.192 / 0.064 / Chi526-1/C103
Qiu23 / 0.196 / 0.550 / 0.009 / 0.137 / 0.108 / Landrace Nanchongqiuzi
Zao49 / 0.054 / 0.547 / 0.054 / 0.254 / 0.090 / Tuxpeno × Zao22
87-20 / 0.028 / 0.544 / 0.220 / 0.149 / 0.059 / Unknown
Ji880 / 0.056 / 0.543 / 0.010 / 0.027 / 0.364 / ZheB77A
Ning24 / 0.143 / 0.540 / 0.092 / 0.008 / 0.218 / Liaoao606/T423
Zong3 / 0.042 / 0.537 / 0.003 / 0.007 / 0.412 / Derived from Zi330
Yi113 / 0.166 / 0.535 / 0.062 / 0.038 / 0.199 / Unknown
Guangyou5 / 0.005 / 0.531 / 0.020 / 0.265 / 0.180 / Unknown
Chihuang32 / 0.147 / 0.525 / 0.005 / 0.018 / 0.306 / Lu9 × Ci7
Yue89E4-2 / 0.002 / 0.523 / 0.002 / 0.461 / 0.011 / Wu102 × Huangzaosi
Yan11 / 0.007 / 0.522 / 0.007 / 0.208 / 0.256 / 86-11
Yue39-4 / 0.056 / 0.518 / 0.065 / 0.064 / 0.296 / Sizhangsan × 47
Yan85 / 0.032 / 0.518 / 0.018 / 0.175 / 0.256 / Dong01 × Zi330
Ernan24 / 0.122 / 0.517 / 0.013 / 0.055 / 0.292 / Nan107 × Nan55
Lo1067 / 0.385 / 0.512 / 0.009 / 0.007 / 0.086 / Pioneer3780 × Lo87602
48-2 / 0.106 / 0.508 / 0.003 / 0.097 / 0.286 / (Dan340 × 331) × 6 Hybrids
C107 / 0.180 / 0.506 / 0.068 / 0.010 / 0.235 / 107
Ning45 / 0.275 / 0.498 / 0.035 / 0.019 / 0.173 / Unknown
Yan156 / 0.170 / 0.497 / 0.034 / 0.033 / 0.266 / 623-10
RW64A / 0.263 / 0.496 / 0.012 / 0.005 / 0.224 / America
Longkang1 / 0.054 / 0.492 / 0.018 / 0.047 / 0.390 / Liao1311(Dian11 × Dafeng22)
Dan3115 / 0.147 / 0.489 / 0.008 / 0.003 / 0.353 / 333-2, 339
79028 / 0.211 / 0.484 / 0.087 / 0.005 / 0.213 / Chang × Ai90
Ziyu3 / 0.009 / 0.477 / 0.110 / 0.034 / 0.370 / Luziyu3
1029 / 0.144 / 0.475 / 0.141 / 0.004 / 0.237 / XL80
Zhang21 / 0.011 / 0.475 / 0.020 / 0.041 / 0.452 / Multiple hybrids
Fu8538 / 0.026 / 0.474 / 0.039 / 0.006 / 0.455 / Ji336-4
Cai48-1111 / 0.005 / 0.473 / 0.037 / 0.035 / 0.450 / Zhongdan2 × Hechuantuofanshan