9 / 5
1 / 5
2 / 5
4 / 5
5 / 5
6 / 5
7 / 5
8 / 6
0 / 6
4 / 6
5 / 6
7 / 6
8 / 7
3 / 7
5 / 7
6 / 7
8 / 7
9 / 8
0 / 8
1 / 8
8 / 9
1 / 9
2 / 9
5 / 9
7 / 9
9 / 1
0
0
CONSENSUS / T / A / T / C / G / C / G / A / C / G / C / A / G / A / C / G / C / C / T / G / C / A / A / T / A / C / C
T. abalienatum / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / A/T / . / . / . / . / . / . / . / . / C/T / . / . / . / . / C/T / .
T. abax / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / A/T / . / . / . / . / . / . / . / . / C/T / . / . / . / . / C/T / .
T. mongoliforme / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / A/T / . / . / . / . / . / . / . / . / C/T / . / . / . / . / C/T / C/T
T. odibile / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / G/C / . / . / . / . / . / T/C / . / . / . / . / . / . / . / C/G
T. formosissimum / . / . / . / . / . / . / . / . / C / . / C/T / . / . / . / C/T / . / . / . / . / . / . / . / . / . / A/C / . / .
T. margaritanum / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / C/T
T. nobile / . / A/T / T/G / . / . / . / . / . / . / G/A / . / A/T / . / . / . / . / . / . / T/A / . / C/T / . / . / . / . / C/T / .
T. stupendum / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / G/A / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / .
T. suasorium / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / C/G / . / G/C / . / . / G/A / . / . / T/C / . / . / . / . / . / . / . / C/G/T
T. suave / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / C/A / G/A / C/T / . / . / . / . / . / . / . / . / . / .
T. venustius / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / C/T / . / . / . / . / . / . / . / . / G/A
T. album / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / G/A / . / . / . / G/A / . / . / . / . / . / . / .
T. armeriifolium / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / G/C / . / . / . / . / . / T/C / . / . / . / . / . / . / . / C/G
T. candidatum / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / A/T / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / .
T. ingustabile / . / . / . / . / . / C / . / A/T / . / . / . / . / G/C / . / . / G/A / . / . / T/C / . / . / . / . / . / . / . / C/G
T. inimitabile / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / G/C / . / . / . / . / . / T/C / . / . / . / . / . / . / . / C/G
T. leucanthum / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / G/C / . / . / . / . / . / T/C / . / . / . / . / T/G / . / C/T / C/G
T. luridum / . / . / . / . / . / . / . / . / C/T / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / T / . / . / A/G / . / . / T
T. niveum / . / . / . / C/T / G/T / C/T / G/T / . / . / . / . / . / G/C / A/T / C/G / . / . / . / T/C / . / . / A/G / A/G / A/T / . / . / C/G
T. occultum / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / G/C / . / . / . / . / . / T/C / . / . / . / . / . / . / . / C/G
T. sinicum / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / G/C/T / . / . / G/A / . / . / T/C / . / . / . / . / . / . / . / C/G/T
T. virgineum / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / G/T / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / .
T. bessarabicum / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / .
T. cylleneum / T/C / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / .
T. tenuifolium / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / C/T / . / . / C/T / . / . / . / . / . / C/T
T. stenocephalum / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / C/T / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / .
Appendix. - Ribotypes found in ITS1 of 245 cloned sequences of Taraxacum sect. Leucantha, Stenoloba, Suavia and diploids T. bessarabicum, T. cylleneum, T. tenuifolium and tetraploid sexual T. stenocephalum. One clone of T. leucanthum have indel of 13 bp (TGTGAACACGTAA) in the alignment position 80-92. Alignment positions of ITS1 1-265.
1
Appendix 1 Cont. (1)
RIBOTYPE ITS1 / 10
1 / 1
0
5 / 1
1
4 / 1
1
5 / 1
2
0 / 1
2
1 / 1
2
3 / 1
2
6 / 1
3
0 / 1
3
3 / 1
3
4 / 1
3
5 / 1
3
6 / 1
3
7 / 1
3
9 / 1
4
1 / 1
4
6 / 1
4
7 / 1
4
9 / 1
5
0 / 1
5
3 / 1
5
6 / 1
5
7 / 1
6
1 / 1
6
3
CONSENSUS / G / G / A / A / T / C / T / G / A / A / T / G / A / A / G / A / G / A / C / T / A / C / A / C / C
T. abalienatum / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / C/A / . / . / C/A / . / . / .
T. abax / G/A / G / A/G / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / C/A / . / . / C/A / . / . / .
T. mongoliforme / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / C/A / . / . / C/A / . / . / .
T. odibile / G/T / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / .
T. formosissimum / G/A / . / . / . / . / . / . / G/T / A/C / . / . / . / A/T / . / . / . / G/T / . / . / . / . / C/A / . / . / C/T
T. margaritanum / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / .
T. nobile / . / . / . / . / . / . / T/A / . / . / . / . / . / . / . / G/A / . / . / . / C/A / . / . / C/A / . / . / .
T. stupendum / G/A / . / . / . / . / . / . / G/T / . / . / T/C / . / . / . / . / . / . / . / C/A / . / . / C/A / . / C/G / .
T. suasorium / . / . / . / . / . / . / T/A / . / . / . / . / . / . / A/T / . / . / . / . / C/A / T/A / . / C/A / . / . / .
T. suave / G/A / . / . / . / T/C / . / . / G/T / . / . / . / . / . / A/G / . / . / . / . / . / T/A / . / C/A / . / . / .
T. venustius / . / . / . / . / . / . / . / G/T / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / .
T. album / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / A / . / .
T. armeriifolium / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / A/T / . / . / . / . / . / . / . / . / . / .
T. candidatum / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / A / . / .
T. ingustabile / . / G/T / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / A/T / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / C/T
T. inimitabile / G/A / . / . / . / . / . / . / G/T / . / . / . / . / . / A/T / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / .
T. leucanthum / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / A/T / . / . / . / . / . / . / . / . / .
T. luridum / . / . / . / . / . / T / . / . / . / . / . / . / . / A/T / . / . / . / . / . / . / . / C/A / . / . / .
T. niveum / . / . / . / A/T / . / . / . / . / . / . / . / . / . / A/T / . / . / . / . / . / . / . / C/A / . / . / .
T. occultum / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / A/T / . / . / . / . / . / . / . / C/A / . / . / .
T. sinicum / G/T / . / . / . / . / . / T/A / . / . / . / . / . / . / A/T / . / A/C / . / . / . / . / C/A / .
.T. virgineum / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / A/C / . / . / . / A/G / . / . / A/C / A / A/C / . / .
T. bessarabicum / . / . / . / . / T/C / . / . / . / . / A/G / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / A / . / . / .
T. cylleneum / G/A / . / . / . / . / . / . / . / . / A/G / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / A / . / . / .
T. tenuifolium / . / . / . / . / . / . / T/G / G/A / . / . / . / G/A / . / . / . / . / . / . / A / . / . / C/A/G / . / . / .
T. stenocephalum / . / . / . / . / . / . / . / . / . / A/G / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / C/A / A/G / . / .
Appendix 1 Cont. (2)
RIBOTYPE ITS1 / 16
7 / 1
6
8 / 1
7
0 / 1
7
1 / 1
8
1 / 1
8
4 / 1
8
9 / 1
9
0 / 1
9
1 / 1
9
3 / 1
9
4 / 1
9
7 / 1
9
8 / 1
9
9 / 2
0
1 / 2
0
4 / 2
0
7 / 2
0
8 / 2
0
9 / 2
1
0 / 2
1
2 / 2
1
3 / 2
1
4 / 2
1
6 / 2
1
8 / 2
2
2 / 2
2
3 / 2
2
4
CONSENSUS / A / C / G / C / C / G / C / A / A / T / A / C / G / G / A / G / T / T / G / A / C / T / T / A / T / C / C / G
T. abalienatum / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / T/C / . / . / . / . / . / . / . / C/T / .
T. abax / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / T/C / . / . / . / . / . / . / . / . / .
T. mongoliforme / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / T/C / . / . / . / . / . / . / . / . / .
T. odibile / . / . / G/A / C/T / . / . / . / . / . / T/A / . / . / . / . / . / . / . / T/C / . / . / . / . / . / . / . / . / . / .
T. formosissimum / . / . / . / . / . / . / . / A/T / . / . / . / . / . / G/A / . / G/T / . / C / . / . / . / . / A/T / C / C/T / . / .
T. margaritanum / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / .
T. nobile / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / T/C / . / . / . / . / T/A / . / . / . / . / .
T. stupendum / . / . / . / . / . / . / C/T / . / A/G / T/A / . / C/T / G/A / . / . / G/T / . / T/C / G/T / . / . / . / . / . / . / . / . / G/C
T. suasorium / . / . / . / C/T / . / . / C/T / . / . / . / . / . / . / . / . / . / T/A / T/C / . / . / C/T / . / . / . / . / . / . / .
T. suave / . / . / . / . / . / . / C/T / . / . / . / . / . / . / . / . / G/T / T/A / T/C / . / . / C/T / . / . / . / . / . / . / .
T. venustius / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / T/C / . / A/G / . / . / . / . / . / . / C/T / .
T. album / . / . / . / . / . / C/T / A/C / . / . / . / . / . / . / . / . / . / C / . / . / . / . / . / . / . / . / .
T. armeriifolium / . / . / T / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / C / G/T / . / . / . / . / . / . / . / .
T. candidatum / C/T / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / T/C / . / . / . / . / . / . / . / . / .
T. ingustabile / . / . / . / C/T / . / . / . / . / . / T/C / . / C/T / . / . / . / . / . / T/C / . / . / . / . / . / . / . / . / . / .
T. inimitabile / . / . / . / C/T / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / C / . / . / . / . / . / . / . / C/T / . / .
T. leucanthum / . / . / . / . / . / . / . / . / . / T/C / . / . / . / . / . / . / . / . / C/T / .
T. luridum / . / . / . / C/T / C/T / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / T/C / . / . / . / . / . / . / . / . / . / .
T. niveum / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / T/C / . / . / . / . / . / . / . / . / . / .
T. occultum / . / . / . / C/T / . / G/T / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / T/C / . / . / . / . / . / . / . / . / . / .
T. sinicum / . / . / . / . / C/T / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / T/C / . / . / . / . / . / . / . / . / . / .
T. virgineum / . / . / . / . / . / . / T / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / C / . / . / . / . / . / . / . / . / . / .
T. bessarabicum / . / . / G/A / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / A/G / . / . / T/C / . / . / . / . / . / . / . / . / . / .
T. cylleneum / A/G / C/T / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / C / . / . / . / . / . / . / C / . / . / .
T. tenuifolium / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / A/G / . / . / . / . / G/A / . / C / . / . / . / T/C / . / . / . / . / . / .
T. stenocephalum / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / T / . / . / . / . / . / C / G/A / . / . / . / . / . / . / . / G/A
Appendix 1 Cont. (2)
RIBOTYPE ITS1 / 22
5 / 2
2
6 / 2
2
7 / 2
2
8 / 2
2
9 / 2
3
0 / 2
3
2 / 2
3
5 / 2
3
7 / 2
3
8 / 2
4
1 / 2
4
2 / 2
4
4 / 2
4
5 / 2
4
6 / 2
4
7 / 2
4
8 / 2
5
1 / 2
5
3 / 2
5
8 / 2
6
1 / 2
6
2 / 2
6
3
CONSENSUS / T / T / T / G / C / G / T / T / A / T / T / G / G / C / G / C / G / C / C / G / T / C / A
T. abalienatum / . / . / . / . / C/T / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / G/A / . / . / .
T. abax / . / . / . / . / C/T / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / G/A / . / . / .
T. mongoliforme / . / . / . / . / C/T / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / G/A / . / G/A / . / . / .
T. odibile / . / . / . / . / C/T / . / . / . / . / . / . / . / G/T / C/T / . / . / . / . / . / . / . / .
T. formosissimum / . / T/A / T/C / . / C/T / . / . / T/A / . / . / . / . / . / C/T / G/C/A / . / . / . / G/A / . / C/G / .
T. margaritanum / . / .
T. nobile / . / . / . / . / C/T / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / G/A / . / C/G / .
T. stupendum / . / . / . / . / C/T / . / T/G / . / . / . / C/T / T/C / . / . / G/C / . / . / . / . / G/A / . / . / .
T. suasorium / T/G / . / . / . / C/T / . / . / . / . / . / . / T/C / G/T/C / C/T / . / . / . / C/T / C/T / . / T/A / . / .
T. suave / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / T/C / . / . / . / G/C / . / . / C/T / . / . / . / C/G / A/G
T. venustius / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / G/C / . / . / . / . / . / . / C/G / .
T. album / . / . / . / . / . / . / T/C / . / G/C / . / . / . / . / . / . / . / .
T. armeriifolium / . / . / . / . / C/T / . / T/G / . / . / . / G/T / C/T / . / . / . / . / . / .
T. candidatum / T/G / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / G/A / . / . / .
T. ingustabile / . / . / . / . / C/T / . / . / . / . / . / . / . / G/T / C/T / . / . / . / . / . / . / . / .
T. inimitabile / . / . / . / . / C/T / . / . / . / . / . / . / . / G/T / C/T / G/C / . / . / . / . / . / C/G / .
T. leucanthum / . / . / . / . / C/T / . / . / . / . / . / . / . / G/T/C / C/T / . / . / . / . / . / . / . / .
T. luridum / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / G/C / . / G/A / . / G/A / . / . / . / . / .
T. niveum / T/G / . / . / G/C / C/T / . / . / . / . / . / . / . / G/C/T / C/T / . / . / . / . / . / . / . / .
T. occultum / . / . / . / . / C/T / . / T/G / . / . / . / . / . / G/T / C/T / . / . / . / . / . / . / . / .
T. sinicum / . / . / T/C / . / C/T / . / . / . / . / . / . / . / G/T / C/T / . / . / . / C/T / . / . / T/A / .
T. virgineum / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / C/T / .
T. bessarabicum / . / . / . / . / . / G/A / . / . / C / A / . / . / . / . / . / . / . / . / . / .
T. cylleneum / . / . / . / T / T / . / . / A/G / . / T/C / G/A / . / . / . / . / T / . / T / - / . / . / .
T. tenuifolium / . / . / . / . / T / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / .
T. stenocephalum / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / C / A / . / . / . / . / . / . / . / . / . / . / .
Appendix 2 Ribotypes found in 5.8S of 245 cloned sequences of Taraxacum sect. Leucantha, Stenoloba, Suavia and diploids T. bessarabicum, T. cylleneum, T. tenuifolium and tetraploid sexual T. stenocephalum. Alignment positions of 5.8S 266-.