Table S1. Microarray data
CS ID / ProbeID / Annotation / SKBR3 / unactivated macrophage / IL-4 activated macrophage1283 / 1030 / hsa-let-7a / 5.51 / 2.35 / 3.80
2323 / 1431 / hsa-let-7b / 4.46 / 2.44 / 1.69
529 / 1268 / hsa-let-7c / 9.05 / 2.06 / 2.30
13 / 2584 / hsa-let-7d / 15.28 / 14.36 / 4.69
1594 / 3217 / hsa-let-7e / 8.10 / 1.89 / 3.22
1282 / 1033 / hsa-let-7f / 4.38 / 2.06 / 2.71
1831 / 3076 / hsa-let-7f-2* / 0.51 / 0.08 / 0.06
525 / 2791 / hsa-let-7g / 4.98 / 2.60 / 3.05
1052 / 2245 / hsa-let-7i / 3.00 / 0.48 / 0.78
1794 / 1064 / hsa-miR-100 / 1.35 / 0.06 / 0.12
15 / 2562 / hsa-miR-101 / 0.19 / 0.42 / 0.30
1076 / 3015 / hsa-miR-101* / 0.44 / 0.03 / 0.06
2083 / 2984 / hsa-miR-103 / 0.59 / 0.25 / 0.44
33 / 2954 / hsa-miR-105* / 0.47 / 0.42 / 0.53
2841 / 2517 / hsa-miR-106a / 2.68 / 0.89 / 0.64
2085 / 3082 / hsa-miR-106a* / 0.49 / 0.47 / 0.03
788 / 1282 / hsa-miR-106b / 1.26 / 0.20 / 0.43
2084 / 2983 / hsa-miR-107 / 1.26 / 0.77 / 0.73
2057 / 2146 / hsa-miR-10a / 0.59 / 0.03 / 0.05
2611 / 3040 / hsa-miR-10a* / 0.59 / 0.27 / 0.20
785 / 1301 / hsa-miR-10b / 0.42 / 0.18 / 0.16
2333 / 2942 / hsa-miR-10b* / 2.14 / 0.94 / 0.72
2592 / 2943 / hsa-miR-125a-3p / 0.62 / 0.22 / 0.17
1064 / 3063 / hsa-miR-125a-5p / 1.19 / 0.10 / 0.54
292 / 2955 / hsa-miR-125b-1* / 0.51 / 0.18 / 0.20
1812 / 1377 / hsa-miR-127-3p / 0.71 / 0.17 / 0.10
1025 / 1021 / hsa-miR-129-3p / 0.36 / 0.24 / 0.36
267 / 2005 / hsa-miR-130a / 1.47 / 0.06 / 0.11
562 / 3009 / hsa-miR-130b / 2.36 / 0.99 / 0.95
546 / 2961 / hsa-miR-130b* / 0.43 / 0.20 / 0.13
1068 / 3159 / hsa-miR-135a / 0.42 / 0.21 / 0.20
811 / 3156 / hsa-miR-135a* / 1.02 / 0.48 / 0.53
809 / 3158 / hsa-miR-135b / 0.79 / 0.07 / 0.07
1328 / 3259 / hsa-miR-135b* / 0.55 / 0.22 / 0.18
547 / 2960 / hsa-miR-136 / 0.66 / 0.27 / 0.25
2349 / 3278 / hsa-miR-137 / 0.88 / 0.58 / 0.47
535 / 1878 / hsa-miR-138 / 0.57 / 0.20 / 0.20
2870 / 3141 / hsa-miR-138-1* / 0.97 / 0.44 / 0.29
2306 / 1106 / hsa-miR-140-5p / 0.57 / 0.21 / 0.17
1547 / 2117 / hsa-miR-141 / 0.93 / 0.57 / 0.53
2817 / 1169 / hsa-miR-142-5p / 0.46 / 0.43 / 0.32
17 / 1182 / hsa-miR-142-5p / 5.32 / 0.33 / 0.34
2058 / 2140 / hsa-miR-144 / 0.58 / 0.42 / 0.28
310 / 3101 / hsa-miR-144* / 1.58 / 0.77 / 0.66
309 / 3102 / hsa-miR-145* / 0.41 / 0.07 / 0.10
2067 / 1409 / hsa-miR-146a / 0.56 / 1.10 / 0.96
795 / 2237 / hsa-miR-146b-5p / 0.82 / 0.80 / 1.18
1838 / 3269 / hsa-miR-147b / 0.83 / 0.06 / 0.07
2832 / 2899 / hsa-miR-148a* / 0.57 / 0.47 / 0.24
526 / 2772 / hsa-miR-151-5p / 0.50 / 0.12 / 0.10
2074 / 2323 / hsa-miR-153 / 0.46 / 0.44 / 0.32
1538 / 1047 / hsa-miR-154* / 0.26 / 0.12 / 0.21
2093 / 3274 / hsa-miR-155 / 1.68 / 1.76 / 1.76
2088 / 3079 / hsa-miR-155* / 0.23 / 0.18 / 0.07
1042 / 1312 / hsa-miR-15a / 0.67 / 0.33 / 0.44
1041 / 1313 / hsa-miR-15b / 0.73 / 0.40 / 0.37
1319 / 3068 / hsa-miR-15b* / 0.44 / 0.04 / 0.10
269 / 2740 / hsa-miR-16 / 1.61 / 1.99 / 1.11
294 / 3053 / hsa-miR-16-1* / 0.48 / 0.15 / 0.14
549 / 3058 / hsa-miR-16-2* / 0.45 / 0.13 / 0.13
2575 / 2896 / hsa-miR-17 / 3.20 / 0.57 / 0.49
288 / 2907 / hsa-miR-181a / 0.73 / 1.00 / 0.46
287 / 2908 / hsa-miR-181b / 0.96 / 0.71 / 0.35
1026 / 1015 / hsa-miR-181c / 0.67 / 0.48 / 0.32
285 / 2910 / hsa-miR-181c* / 0.69 / 0.34 / 0.40
286 / 2909 / hsa-miR-181d / 0.69 / 0.45 / 0.21
810 / 3157 / hsa-miR-183 / 0.65 / 0.24 / 0.33
1083 / 3208 / hsa-miR-183* / 1.14 / 0.45 / 0.50
273 / 1242 / hsa-miR-184 / 2.74 / 1.67 / 1.43
311 / 3100 / hsa-miR-185 / 1.38 / 0.99 / 0.85
786 / 1292 / hsa-miR-18a / 1.08 / 0.44 / 0.47
2822 / 1850 / hsa-miR-18a* / 0.56 / 0.03 / 0.12
1803 / 2125 / hsa-miR-18b / 1.55 / 1.14 / 0.95
2322 / 1437 / hsa-miR-190 / 1.49 / 1.17 / 0.96
1851 / 3220 / hsa-miR-190b / 0.66 / 0.16 / 0.24
2609 / 3042 / hsa-miR-191 / 0.48 / 0.50 / 0.38
800 / 2915 / hsa-miR-193b / 0.09 / 0.03 / 0.05
823 / 3108 / hsa-miR-193b* / 1.26 / 0.76 / 0.88
2066 / 1416 / hsa-miR-194 / 0.47 / 0.37 / 0.28
818 / 3013 / hsa-miR-194* / 0.45 / 0.04 / 0.14
1043 / 1311 / hsa-miR-195 / 1.46 / 0.76 / 1.71
2348 / 3179 / hsa-miR-198 / 0.68 / 0.23 / 0.28
1840 / 3267 / hsa-miR-19a / 0.72 / 0.18 / 0.16
1581 / 3266 / hsa-miR-19b / 0.57 / 0.07 / 0.18
787 / 1287 / hsa-miR-200a / 0.77 / 0.37 / 0.28
1802 / 2132 / hsa-miR-200b / 0.74 / 0.44 / 0.46
1841 / 3030 / hsa-miR-200b* / 0.65 / 0.50 / 0.43
2103 / 3128 / hsa-miR-200c / 0.53 / 0.20 / 0.27
2856 / 3091 / hsa-miR-202 / 1.25 / 0.68 / 0.43
530 / 1260 / hsa-miR-203 / 0.67 / 0.52 / 0.42
7 / 1489 / hsa-miR-204 / 0.45 / 0.04 / 0.05
1331 / 3020 / hsa-miR-208b / 0.95 / 0.57 / 0.66
1592 / 3119 / hsa-miR-20a / 2.29 / 0.33 / 0.74
802 / 2965 / hsa-miR-20a* / 0.57 / 0.32 / 0.35
2317 / 2894 / hsa-miR-20b / 3.53 / 1.20 / 1.16
1300 / 1315 / hsa-miR-21 / 5.55 / 3.93 / 15.46
2076 / 2291 / hsa-miR-210 / 0.74 / 0.13 / 0.18
16 / 2560 / hsa-miR-214 / 1.61 / 1.87 / 1.23
2618 / 3233 / hsa-miR-214* / 0.58 / 0.07 / 0.24
2563 / 1122 / hsa-miR-215 / 0.81 / 0.55 / 0.43
2060 / 2136 / hsa-miR-216a / 0.46 / 0.38 / 0.31
1544 / 1775 / hsa-miR-216b / 0.55 / 0.25 / 0.27
2871 / 3140 / hsa-miR-217 / 0.39 / 0.21 / 0.17
2820 / 1143 / hsa-miR-218 / 0.47 / 0.03 / 0.05
2098 / 3033 / hsa-miR-218-1* / 0.79 / 0.03 / 0.10
2097 / 3034 / hsa-miR-218-2* / 1.25 / 0.03 / 0.32
1570 / 2977 / hsa-miR-219-2-3p / 0.65 / 0.46 / 0.50
1284 / 1022 / hsa-miR-22 / 0.30 / 0.18 / 0.77
271 / 2607 / hsa-miR-22* / 0.44 / 0.26 / 0.19
39 / 3048 / hsa-miR-220c / 0.19 / 0.21 / 0.23
2050 / 1088 / hsa-miR-221 / 0.88 / 0.47 / 0.52
35 / 2952 / hsa-miR-221* / 0.42 / 0.45 / 0.34
272 / 2594 / hsa-miR-222 / 2.09 / 1.14 / 0.78
2091 / 3176 / hsa-miR-222* / 0.36 / 0.84 / 0.06
1326 / 3261 / hsa-miR-223 / 0.99 / 14.01 / 13.66
1317 / 3070 / hsa-miR-223* / 0.36 / 0.03 / 0.06
1587 / 3024 / hsa-miR-23a / 1.38 / 0.71 / 0.84
1333 / 3118 / hsa-miR-23a* / 0.54 / 0.09 / 0.13
1588 / 3023 / hsa-miR-23b / 1.27 / 0.42 / 0.78
565 / 3106 / hsa-miR-23b* / 0.49 / 0.05 / 0.05
1539 / 1044 / hsa-miR-24 / 1.23 / 0.81 / 0.96
312 / 3099 / hsa-miR-24-2* / 0.49 / 0.26 / 0.29
2562 / 1139 / hsa-miR-25 / 0.69 / 0.04 / 0.04
2595 / 2992 / hsa-miR-25* / 0.82 / 0.26 / 0.23
2834 / 1483 / hsa-miR-26a / 1.23 / 1.31 / 0.61
1063 / 3064 / hsa-miR-26a-2* / 0.46 / 0.05 / 0.06
1578 / 3169 / hsa-miR-26b / 1.42 / 0.65 / 1.25
2095 / 3272 / hsa-miR-26b* / 0.45 / 0.05 / 0.04
2833 / 1485 / hsa-miR-27a / 2.49 / 2.18 / 0.33
2851 / 2996 / hsa-miR-27a* / 0.50 / 0.18 / 0.12
2607 / 3280 / hsa-miR-27b / 2.96 / 0.69 / 0.32
1053 / 2922 / hsa-miR-28-5p / 0.66 / 0.12 / 0.14
50 / 3001 / hsa-miR-296-3p / 23.84 / 10.25 / 9.16
275 / 1189 / hsa-miR-297 / 0.46 / 0.23 / 0.27
1825 / 2982 / hsa-miR-298 / 1.59 / 2.23 / 2.73
2827 / 2180 / hsa-miR-299-3p / 1.53 / 0.84 / 0.43
270 / 2733 / hsa-miR-29a / 1.25 / 1.03 / 0.60
14 / 2563 / hsa-miR-29a* / 0.17 / 0.41 / 0.21
42 / 3145 / hsa-miR-29b / 1.46 / 0.91 / 0.54
2343 / 3084 / hsa-miR-29b-1* / 0.75 / 0.27 / 0.21
1071 / 3256 / hsa-miR-29b-2* / 0.56 / 0.14 / 0.17
1044 / 1310 / hsa-miR-29c / 0.98 / 0.42 / 0.62
293 / 3054 / hsa-miR-301a / 1.01 / 0.61 / 0.49
552 / 3055 / hsa-miR-301b / 0.46 / 0.24 / 0.06
2104 / 3127 / hsa-miR-302a / 0.53 / 0.28 / 0.07
1316 / 2971 / hsa-miR-302a* / 0.54 / 0.23 / 0.20
1845 / 3126 / hsa-miR-302b / 0.65 / 0.25 / 0.28
1847 / 3124 / hsa-miR-302c / 0.37 / 0.09 / 0.05
2577 / 1474 / hsa-miR-302c* / 0.43 / 0.18 / 0.15
1846 / 3125 / hsa-miR-302d / 0.45 / 0.03 / 0.13
1070 / 3257 / hsa-miR-30a / 0.77 / 0.35 / 0.43
560 / 3247 / hsa-miR-30b* / 0.82 / 0.53 / 0.36
1561 / 2281 / hsa-miR-30c / 0.49 / 0.28 / 0.24
301 / 3246 / hsa-miR-30c-1* / 0.84 / 0.65 / 0.53
531 / 1251 / hsa-miR-30d / 0.99 / 0.47 / 0.57
318 / 3293 / hsa-miR-30d* / 0.47 / 0.09 / 0.12
1820 / 2282 / hsa-miR-30e / 0.83 / 0.61 / 0.50
2049 / 1092 / hsa-miR-31 / 0.32 / 0.41 / 0.40
2866 / 3045 / hsa-miR-32* / 0.41 / 0.03 / 0.17
2842 / 2516 / hsa-miR-320 / 4.30 / 1.97 / 1.28
308 / 3003 / hsa-miR-323-5p / 1.14 / 0.18 / 0.21
2051 / 1082 / hsa-miR-324-3p / 0.42 / 0.08 / 0.12
298 / 3149 / hsa-miR-325 / 0.97 / 0.59 / 0.74
2580 / 1455 / hsa-miR-328 / 0.47 / 0.09 / 0.08
1543 / 1778 / hsa-miR-329 / 0.39 / 0.13 / 0.12
542 / 2913 / hsa-miR-337-5p / 0.51 / 0.40 / 0.25
27 / 2197 / hsa-miR-338-3p / 0.59 / 0.09 / 0.20
2829 / 2902 / hsa-miR-338-5p / 0.84 / 0.45 / 0.22
1077 / 3114 / hsa-miR-33a / 0.44 / 0.05 / 0.05
2351 / 3276 / hsa-miR-340 / 1.33 / 0.80 / 0.62
2860 / 3187 / hsa-miR-340* / 0.65 / 0.05 / 0.03
314 / 3197 / hsa-miR-342-3p / 1.10 / 0.91 / 1.30
52 / 2999 / hsa-miR-342-5p / 1.24 / 0.84 / 0.67
1584 / 3263 / hsa-miR-346 / 0.44 / 0.04 / 0.05
532 / 1247 / hsa-miR-34a / 0.36 / 0.22 / 0.51
1823 / 2932 / hsa-miR-34b / 0.33 / 0.39 / 0.33
2604 / 3183 / hsa-miR-361-3p / 0.27 / 0.03 / 0.04
2350 / 3277 / hsa-miR-361-5p / 0.58 / 0.16 / 0.13
32 / 2903 / hsa-miR-362-3p / 0.46 / 0.33 / 0.18
2566 / 1822 / hsa-miR-363 / 0.57 / 0.21 / 0.12
2059 / 2138 / hsa-miR-365 / 0.05 / 0.03 / 0.03
1537 / 1052 / hsa-miR-367 / 0.58 / 0.37 / 0.32
1540 / 1038 / hsa-miR-369-3p / 1.32 / 0.81 / 0.72
2873 / 3238 / hsa-miR-370 / 1.05 / 0.60 / 0.28
2576 / 2895 / hsa-miR-372 / 0.60 / 0.39 / 0.28
1281 / 1037 / hsa-miR-373 / 0.70 / 0.16 / 0.30
2052 / 1078 / hsa-miR-373* / 0.92 / 0.36 / 0.46
2836 / 1480 / hsa-miR-374a / 0.94 / 0.70 / 0.69
2600 / 3087 / hsa-miR-374a* / 0.75 / 0.16 / 0.08
1557 / 1924 / hsa-miR-374b / 0.83 / 0.64 / 0.55
2341 / 3086 / hsa-miR-374b* / 0.61 / 0.05 / 0.13
2585 / 2342 / hsa-miR-375 / 0.42 / 0.03 / 0.03
822 / 3109 / hsa-miR-376a* / 0.55 / 0.04 / 0.06
1814 / 1934 / hsa-miR-376b / 0.98 / 0.65 / 0.48
30 / 2905 / hsa-miR-376c / 0.78 / 0.65 / 0.44
2855 / 3092 / hsa-miR-377* / 0.42 / 0.03 / 0.08
2821 / 1851 / hsa-miR-378 / 1.27 / 1.44 / 0.90
283 / 2208 / hsa-miR-378* / 0.75 / 0.05 / 0.18
815 / 3252 / hsa-miR-379 / 1.07 / 0.74 / 0.68
1066 / 3161 / hsa-miR-379* / 0.32 / 0.34 / 0.31
2828 / 2177 / hsa-miR-380 / 0.66 / 0.27 / 0.13
2571 / 2171 / hsa-miR-381 / 0.77 / 0.30 / 0.27
2311 / 1808 / hsa-miR-410 / 0.77 / 0.44 / 0.36
1329 / 3022 / hsa-miR-421 / 0.66 / 0.64 / 0.51
1060 / 2967 / hsa-miR-422a / 0.90 / 0.80 / 1.10
1595 / 3216 / hsa-miR-423-5p / 0.81 / 0.71 / 0.71
2079 / 2936 / hsa-miR-425 / 0.42 / 0.24 / 0.21
1801 / 2134 / hsa-miR-429 / 0.65 / 0.35 / 0.42
1305 / 2267 / hsa-miR-449a / 0.43 / 0.11 / 0.12
783 / 2837 / hsa-miR-450a / 0.38 / 0.22 / 0.15
799 / 2916 / hsa-miR-452 / 1.16 / 0.78 / 0.62
556 / 3151 / hsa-miR-454 / 0.67 / 0.39 / 0.27
798 / 2917 / hsa-miR-483-5p / 1.98 / 1.35 / 1.18
279 / 1863 / hsa-miR-485-5p / 0.80 / 0.74 / 0.56
2309 / 1812 / hsa-miR-487a / 1.12 / 0.60 / 0.44
2568 / 1817 / hsa-miR-487b / 0.66 / 0.49 / 0.49
63 / 3288 / hsa-miR-488 / 0.48 / 0.20 / 0.17
1082 / 3209 / hsa-miR-489 / 0.50 / 0.31 / 0.27
2599 / 3088 / hsa-miR-491-3p / 0.77 / 0.14 / 0.11
1560 / 1911 / hsa-miR-491-5p / 1.79 / 1.09 / 1.36
2081 / 2986 / hsa-miR-492 / 0.43 / 0.46 / 0.59
2331 / 2329 / hsa-miR-493* / 0.66 / 0.22 / 0.11
538 / 2230 / hsa-miR-494 / 4.83 / 4.42 / 8.56
1051 / 2248 / hsa-miR-496 / 0.41 / 0.03 / 0.06
319 / 3292 / hsa-miR-498 / 0.49 / 0.11 / 0.16
2101 / 3130 / hsa-miR-500 / 0.61 / 0.29 / 0.21
2071 / 1942 / hsa-miR-501-5p / 0.96 / 0.26 / 0.34
2843 / 2402 / hsa-miR-502-3p / 0.81 / 0.53 / 0.21
1580 / 3167 / hsa-miR-505 / 0.60 / 0.03 / 0.06
1545 / 2123 / hsa-miR-506 / 0.42 / 0.35 / 0.25
2844 / 2343 / hsa-miR-507 / 1.10 / 0.14 / 0.04
1850 / 3221 / hsa-miR-508-3p / 0.85 / 0.15 / 0.16
2853 / 3094 / hsa-miR-509-3p / 0.78 / 0.42 / 0.27
2872 / 3139 / hsa-miR-509-5p / 0.43 / 0.08 / 0.15
41 / 3146 / hsa-miR-509-5p / 0.77 / 1.00 / 0.61
548 / 2959 / hsa-miR-510 / 0.87 / 0.59 / 0.58
1583 / 3264 / hsa-miR-511 / 0.33 / 0.12 / 0.14
1301 / 1910 / hsa-miR-512-3p / 0.43 / 0.06 / 0.22
2608 / 3279 / hsa-miR-513-5p / 1.46 / 0.50 / 0.41
2354 / 3037 / hsa-miR-514 / 0.69 / 0.51 / 0.33
819 / 3012 / hsa-miR-515-3p / 0.43 / 0.03 / 0.04
64 / 3287 / hsa-miR-516a-5p / 0.19 / 0.47 / 0.31
281 / 2217 / hsa-miR-517b / 0.88 / 0.15 / 0.21
2069 / 1946 / hsa-miR-517c / 0.50 / 0.08 / 0.07
520 / 1759 / hsa-miR-518b / 0.53 / 0.07 / 0.16
313 / 3198 / hsa-miR-518c* / 0.65 / 0.03 / 0.10
2319 / 2892 / hsa-miR-519a / 0.54 / 0.33 / 0.36
517 / 1765 / hsa-miR-519c-3p / 1.04 / 0.58 / 0.58
1567 / 2928 / hsa-miR-519e / 0.57 / 0.04 / 0.03
2862 / 3285 / hsa-miR-519e* / 0.89 / 0.09 / 0.05
776 / 1771 / hsa-miR-520a-3p / 0.52 / 0.06 / 0.08
774 / 1773 / hsa-miR-520b / 0.45 / 0.08 / 0.05
2574 / 2897 / hsa-miR-520c-3p / 0.67 / 0.17 / 0.18
773 / 1774 / hsa-miR-520e / 0.85 / 0.18 / 0.15
2054 / 1802 / hsa-miR-520f / 0.55 / 0.11 / 0.22
2335 / 2940 / hsa-miR-520g / 0.53 / 0.27 / 0.23
2565 / 1824 / hsa-miR-520h / 0.49 / 0.15 / 0.19
2359 / 3132 / hsa-miR-524-5p / 0.70 / 0.42 / 0.35
58 / 3193 / hsa-miR-526a;hsa-miR-518d-5p;hsa-miR-518f*;hsa-miR-520c-5p / 0.42 / 0.31 / 0.23
569 / 3202 / hsa-miR-526b / 0.49 / 0.06 / 0.07
775 / 1772 / hsa-miR-526b* / 0.47 / 0.06 / 0.12
2346 / 3181 / hsa-miR-532-3p / 1.01 / 0.03 / 0.12
813 / 3254 / hsa-miR-541 / 0.65 / 0.43 / 0.36
1817 / 2289 / hsa-miR-542-3p / 1.42 / 0.79 / 0.76
2857 / 3190 / hsa-miR-542-5p / 0.60 / 0.19 / 0.08
2092 / 3175 / hsa-miR-545* / 0.48 / 0.15 / 0.09
12 / 1988 / hsa-miR-548b-3p / 0.24 / 0.44 / 0.05
1293 / 2878 / hsa-miR-548b-5p / 0.23 / 0.51 / 0.38
2839 / 1978 / hsa-miR-548c-3p / 0.34 / 0.37 / 0.25
1294 / 2877 / hsa-miR-548c-5p / 0.19 / 0.31 / 0.27
1552 / 2879 / hsa-miR-548d-5p / 1.08 / 1.09 / 0.85
796 / 2232 / hsa-miR-549 / 0.49 / 0.37 / 0.30
521 / 2074 / hsa-miR-551b / 0.66 / 0.08 / 0.09
2831 / 2900 / hsa-miR-551b* / 2.08 / 0.82 / 0.42
1542 / 1779 / hsa-miR-552 / 0.71 / 0.38 / 0.35