Table S4: Pairwise Rst values (below diagonal) and p values (above diagonal) calculated for the Chinese Yi Minority residing in Liangshan Yi autonomoue prefacture and 29 other Chinese groups or relative populations.

Population

[01]

[02]

[03]

[04]

[05]

[06]

[07]

[08]

[09]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

[17]

[18]

[19]

[20]

[21]

[22]

[23]

[24]

[25]

[26]

[27]

[28]

[29]

[30]

[01]

-

0.0505

[02]

0.0000 0.0000

-

[03]

[04]

0.0000

0.0005

0.0000

-

0.0061

0.0026

0.0066

0.0406

0.0087

[05]

[06]

[07]

[08]

[09]

[10]

0.0000

0.0004

0.0000

0.6981

0.0010

0.0070

0.0087

0.0000

0.0225

-

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

[17]

[18]

[19]

[20]

[21]

[22]

[23]

[24]

[25]

[26]

[27]

[28]

[29]

[30]

0.0000 0.0000 0.0008 0.0000 0.0022

0.0000 0.0001 0.0003 0.0000 0.0000

0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000

0.0116 0.0663 0.0276 0.0000 0.0265

-

0.0058

0.0033 0.0128

0.0581 0.0339 0.0643

0.0238 0.0186 0.0211 0.0325

0.0000

0.0001

0.0000

0.7564

0.0002

0.0196

0.0035

0.0000

0.0409

0.6498

-

0.0272

0.0508

0.0373

0.1575

0.0628

0.0771

0.1140

0.0829

0.0734

0.0535

0.0516

0.0618

0.1534

0.0703

0.0000

0.0000

0.0000

0.0018

0.0009

0.0000

0.0064

0.0000

0.0000

0.0002

0.0001

-

0.1104

0.0976

0.2033

0.0670

0.1440

0.1302

0.1641

0.1023

0.0854

0.0791

0.0941

0.2454

0.1004

0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000

0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000

0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000

0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000

0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000

0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000

0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000

0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000

0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000

0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000

0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000

0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

0.0005

-

0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0005 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000

0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0018 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000

0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000

0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0622 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000

0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.1404 0.0000 0.0002 0.0000 0.0000

0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0045 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000

0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.1740 0.0000 0.0000 0.0000 0.0002

0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000

0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0003 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000

0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0133 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000

0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0055 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000

0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.5078 0.0000 0.0000 0.0001 0.0000

0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000

0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000

0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000

0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0013 0.0067

0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0001 0.0000 0.0000 0.0000

0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000

0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0572 0.0000 0.0000 0.0000

0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000

0.7168 0.8309 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000

0.0000

-

0.0677 0.0722

0.0242 0.0234 0.0410

0.0237 0.0410 0.0326

0.0301 0.0318 0.0248

0.0172 0.0287 0.0440

0.0613 0.0696 0.0356

0.0184 0.0482 0.0602

0.0049 0.0966 0.0000 0.0004

0.0014 0.0000 0.0008

0.0000 0.0007

-

-

-

0.0000

-

0.0212 0.0231 0.0394 -0.0010 0.0087 0.0048 0.0088 0.0351 0.0081

0.0258 0.0290 0.0414 -0.0013 0.0102 0.0037 0.0113 0.0338 0.0065 -0.0007

0.0393 0.0430 0.0756

0.0752 0.0930 0.0492

0.0596 0.0837 0.0395

0.1461 0.1952 0.1689

0.0431 0.0731 0.0997

0.0694 0.1161 0.1006

0.0772 0.1266 0.1679

0.0861 0.1186 0.0866

0.0832 0.0877 0.1193

0.0835 0.0597 0.1203

0.0839 0.0615 0.1200

0.0947 0.0720 0.1258

0.1883 0.2010 0.1420

0.0793 0.1046 0.0473

0.0247 0.0282 0.0544

0.0748 0.1010 0.0923

0.0472 0.0773 0.0432

0.0301 0.0592 0.0786

0.0452 0.0571 0.0897

0.0182

0.0568

0.0444

0.1626

0.0581

0.0801

0.1070

0.0853

0.0717

0.0514

0.0493

0.0606

0.1651

0.0665

0.0058

0.0760

0.0513

0.0320

0.0500

0.0209 0.0305 0.0163 0.1018 0.0492

0.0721 0.0470 0.0758 0.0253 0.0449

0.0579 0.0358 0.0636 0.0161 0.0340

0.1735 0.1627 0.1721 0.1441 0.1285

0.0441 0.0594 0.0473 0.1089 0.0688

0.1020 0.0778 0.1094 0.0406 0.0598

0.1118 0.1162 0.1151 0.1428 0.1127

0.1076 0.0799 0.1189 0.0279 0.0694

0.0701 0.0804 0.0691 0.1318 0.0769

0.0625 0.0676 0.0541 0.1247 0.0696

0.0642 0.0676 0.0551 0.1195 0.0627

0.0726 0.0753 0.0656 0.1292 0.0760

0.1907 0.1510 0.1983 0.0865 0.1480

0.0532 0.0458 0.0705 0.0728 0.0849

0.0034 0.0138 0.0033 0.0809 0.0330

0.0971 0.0756 0.1050 0.0396 0.0709

0.0302 0.0389 0.0444 0.0730 0.0694

0.0191 0.0391 0.0218 0.0942 0.0452

0.0369 0.0562 0.0290 0.1130 0.0640

0.0258

0.0531

0.0413

0.1614

0.0580

0.0747

0.1053

0.0786

0.0694

0.0493

0.0470

0.0574

0.1565

0.0673

0.0100

0.0704

0.0505

0.0345

0.0514

-

0.0045

0.0258 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000

0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000

0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000

0.0000 0.0000 0.0000 0.0000

0.0000 0.0138 0.0000

0.0000 0.0000

-

0.1020 0.0802

0.1250 0.1121 0.2215

0.0514 0.0408 0.1055 0.1344

0.1653 0.1390 0.1977 0.0648 0.1001

0.0493 0.0388 0.1271 0.1401 0.0104 0.1236

0.1404 0.1139 0.1683 0.0939 0.1583 0.1286 0.1643

0.1392 0.1206 0.2129 0.1091 0.1757 0.1716 0.1805 0.0225

0.1376 0.1250 0.2365 0.1098 0.1688 0.1670 0.1708 0.0363 -0.0015

0.1425 0.1295 0.2365 0.1160 0.1796 0.1771 0.1813 0.0298 -0.0020 0.0006

-

-

-

-

-

0.0000

-

-

0.1839 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000

0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000

0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000

0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000

0.0000 0.0000 0.0014 0.0000

0.0000 0.0000 0.0000

0.0004 0.0000

-

0.0393 0.0521 0.1447 0.2432 0.1165 0.2782 0.1015 0.2539

0.0631 0.0578 0.1794 0.0932 0.1078 0.1539 0.0983 0.1373

0.2599

0.1468

0.0684

0.1620

0.1184

0.0793

0.0896

0.2549 0.2583

0.1493 0.1496 0.1493

0.0658 0.0782 0.2241 0.0768

0.1535 0.1646 0.1355 0.0828 0.1176

0.1249 0.1277 0.1946 0.0329 0.0531 0.0760

0.0811 0.0902 0.2397 0.0818 0.0225 0.1075 0.0298

0.0906 0.0972 0.2524 0.0928 0.0367 0.1416 0.0521 0.0114

-

-

0.0132 -0.0013 0.0922 0.0775 0.1819 0.0492 0.1225 0.1159 0.1380 0.0809

-

0.0778

0.0580

0.0399

0.0568

0.1368

0.0858

0.0409

0.0511

0.0692 0.0559 0.1592 0.1207 0.0254 0.0946 0.0088 0.1524

0.0844 0.0659 0.1510 0.0442 0.0896 0.0819 0.0876 0.0895

0.1142 0.0974 0.2037 0.0108 0.1184 0.0644 0.1264 0.0711

0.1232 0.1110 0.2110 0.0116 0.1555 0.0963 0.1646 0.0756

-

-

-

0.0058

-

[1]Yi-Liangshan-Sichuan-China [YA004223, 311]; [2]Bai-Yunnan-China [101]; Reference [3]HakkaHan-Meizhou-China [567]; Reference [4]Han-Beijing-China [YA003861, 246]; Reference [3] and [5]Han-Hunan-China [YA004146, 310] [24]; [6]Han-Shanghai-China; YA003975, 517] [21]; [7]Han-Xuanwei-China [145]; Reference [8]Hui-Cangzhou-China [392]; Reference [9]Hui-Gansu-China [100]; Reference [10]Manchu-Chengde-China [366]; Reference [11]Manchu-Liaoning-China [328]; Reference [12]MinHan-Minnan-China [YA003308, 109] [22]; [13]Mongolian-Inner-Mongolia-China [YA004136, 364] Reference [26] and [14]Mongolian-Ordos-China [YA004123, 258] [8]; [15]Tibetan-Tibe-China [YA004005, 248] [9]; [16]Zhuang-Guangxi-China [YA004006-1, 266] [5]; [18]Majhi-Chhattisgarh-India [YA004145, 107] [23]; [19]Tamil-Southern-India [YA003312, 126] [20]; [20]Japanese-Tsukuba-Japan [163]; Reference [21]Korean-Daejeon-South-Korea [YA003407, 133] [19]; [22]Korean-Seoul-South-Korea [572]; Reference [23]Korean-South-Korea [YA004151, 604]; Reference [24]Mongolian-Ulaanbaatar [YA004127, 261]; Reference [25]Filipino-Philippines [YA003206, 943]; Reference [17] and [26]Han-Singapore [YA003270, 104] [18]; [27]Indian-Singapore [YA003271, 106] [18]; [28]Malay-Singapore [YA003272, 104] [18]; [29]Thai-Central-Thailand [256]; Reference [30]Yong-Northern-Thailand [124] Reference