CaPO2 / - / - / - / - / - / - / - / M / S / I / S / N / N / S / F / A / A / V / A / A / I / F / S / L / V / L / L / C / S / M / Q / C / H / A / Q / L / S / S / T / - / - / - / F / Y / D / R / A / C / P / N / - / - / - / - / - / - / - / - / - / -
FBP3 / - / - / - / - / M / V / L / H / S / F / S / S / S / T / T / T / F / A / I / A / F / F / T / L / F / L / I / G / S / S / S / - / - / A / Q / L / S / E / N / - / - / - / F / Y / A / K / K / C / P / K / - / - / - / - / - / - / - / - / - / -
Wheat / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / M / A / S / A / S / R / L / G / L / V / V / L / V / A / M / A / S / A / A / S / - / A / Q / L / S / S / T / - / - / - / F / Y / D / T / S / C / P / N / - / - / - / - / - / - / - / - / - / -
Rice / - / - / M / A / S / K / L / G / M / V / V / L / L / I / S / G / L / F / A / A / R / C / A / A / V / V / T / T / G / E / P / V / V / A / G / L / S / W / G / - / - / - / F / Y / D / T / S / C / P / S / - / - / - / - / - / - / - / - / - / -
Swpa4 / M / A / S / F / V / T / R / L / S / L / A / L / S / F / I / A / L / A / L / A / G / F / S / I / Y / Q / N / T / H / T / A / M / K / G / Q / L / K / L / T / P / K / W / L / L / D / N / T / L / E / S / S / V / A / D / V / L / S / L / R / L
CaPO2 / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / A / L / N / T / I / R / K / S / V / R / Q / A / V / S / A / E / R / R / M / A / A / S / L / I / R / L / H / F / H / D / C / F / V / Q / G / C / D / A / S / I / L / L / D / E / T / P / T / I
FBP3 / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / V / L / Y / A / V / K / S / V / V / Q / S / A / V / A / K / E / P / R / M / G / A / S / L / L / R / L / F / F / H / D / C / F / V / N / G / C / D / G / S / V / L / L / D / G / P / S / - / -
Wheat / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / A / L / A / T / I / K / A / G / V / T / T / A / V / Q / N / E / A / R / M / G / A / S / L / V / R / L / H / F / H / D / C / F / V / D / G / C / D / G / S / V / L / L / A / D / T / G / S / F
Rice / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / V / E / G / I / V / R / W / H / V / T / E / A / L / R / R / D / I / G / I / A / A / G / L / V / R / I / F / F / H / D / C / F / P / Q / G / C / D / A / S / V / L / L / T / G / S / Q / - / -
Swpa4 / G / I / S / S / G / K / L / S / D / E / D / C / I / F / S / A / V / K / E / V / V / D / A / A / I / D / A / E / T / R / M / G / A / S / L / I / R / L / F / F / H / D / W / F / V / D / G / C / D / A / G / L / L / L / N / D / T / P / T / F
CaPO2 / V / S / E / K / T / A / L / P / N / L / G / S / V / R / - / - / G / Y / G / I / I / E / D / A / K / R / E / L / E / K / T / C / P / - / G / I / V / S / C / A / D / I / L / A / V / A / A / R / D / A / S / T / L / V / G / G / P / S / W / T
FBP3 / - / S / E / K / T / A / P / P / N / D / K / S / L / R / - / - / G / Y / E / V / I / D / A / I / K / S / K / V / E / A / L / C / P / - / G / I / V / S / C / A / D / I / V / A / I / A / A / R / D / S / V / N / I / L / G / G / P / F / W / K
Wheat / I / G / E / Q / G / A / A / P / N / N / N / S / I / R / - / - / G / M / N / V / I / D / N / I / K / T / Q / V / E / A / V / C / K / - / Q / T / V / S / C / A / D / I / L / A / V / A / A / R / D / S / V / V / A / L / G / G / P / T / W / T
Rice / - / S / E / L / G / E / I / P / N / - / Q / T / L / R / P / S / A / L / K / L / I / E / D / I / R / A / A / V / H / S / A / C / G / - / A / K / V / S / C / A / D / I / T / T / L / A / T / R / D / A / I / V / A / S / G / G / P / Y / F / D
Swpa4 / T / R / E / Q / T / A / G / G / N / N / N / S / V / T / - / - / G / F / E / V / I / Q / Q / A / K / E / N / V / I / T / K / C / P / Y / I / Q / V / S / C / A / D / I / L / S / I / A / A / R / D / S / F / Q / R / F / T / G / E / T / Y / T
CaPO2 / V / K / L / G / R / R / D / S / T / T / A / S / H / T / L / A / E / T / - / D / L / P / G / P / F / D / P / L / T / R / L / I / S / G / F / A / K / K / G / L / S / T / R / D / M / V / A / L / S / G / S / H / S / I / G / Q / A / Q / C / F
FBP3 / V / K / L / G / R / R / D / S / S / T / G / F / F / Q / L / A / S / S / G / A / L / P / S / P / A / S / S / L / D / T / L / I / S / S / F / K / D / Q / G / L / S / A / K / D / M / V / A / L / S / G / A / H / T / I / G / K / A / R / C / A
Wheat / V / L / L / G / R / R / D / S / T / T / A / S / K / T / N / A / E / N / - / D / L / P / P / P / T / F / D / L / Q / N / L / T / T / L / F / G / N / K / Q / L / S / M / T / D / M / V / A / L / S / G / A / H / T / I / G / Q / S / Q / C / R
Rice / V / P / L / G / R / R / D / G / L / A / P / A / S / S / D / K / V / G / - / L / L / P / A / P / F / F / D / V / P / T / L / I / Q / A / F / K / D / R / N / L / D / K / T / D / L / V / A / L / S / G / A / H / T / I / G / L / G / H / C / G
Swpa4 / V / T / L / G / R / L / D / A / R / T / A / N / L / T / G / A / N / T / - / Q / L / V / G / P / N / E / E / L / A / S / Q / V / E / K / F / A / A / K / G / F / S / E / T / E / L / V / A / L / L / G / V / H / T / V / G / F / S / R / C / P
CaPO2 / L / F / R / D / R / I / Y / S / N / G / T / D / I / D / A / G / F / A / S / T / R / R / R / R / C / P / Q / E / D / - / - / - / - / Q / N / G / N / L / A / P / L / D / L / V / T / P / N / Q / L / D / N / N / Y / F / K / N / L / R / Q / R
FBP3 / V / Y / G / S / R / I / Y / N / E / - / K / N / I / E / S / L / F / A / K / A / R / Q / K / N / C / P / R / N / S / N / G / T / P / K / D / N / N / V / A / P / L / E / F / K / T / P / N / H / F / D / N / N / Y / Y / K / N / L / I / N / K
Wheat / F / F / R / D / R / I / Y / N / E / - / T / N / I / N / T / T / F / A / T / S / L / R / A / N / C / P / Q / S / G / - / - / - / - / G / D / S / S / L / A / P / L / D / T / Q / T / P / N / G / F / D / N / A / Y / Y / T / N / L / M / S / Q
Rice / S / F / N / D / R / F / D / G / S / K / P / I / M / D / P / V / L / V / K / K / L / Q / A / K / C / A / K / D / V / P / - / - / - / V / N / S / V / T / Q / E / L / D / V / R / T / P / N / A / F / D / N / K / Y / Y / F / D / L / I / A / K
Swpa4 / L / L / C / V / P / I / F / I / N / - / - / - / - / - / P / A / R / A / S / T / L / Q / C / N / C / P / V / S / P / D / - / - / - / - / D / T / G / L / V / G / L / D / P / - / T / P / L / T / W / D / Q / S / F / Y / S / D / V / A / N / G
CaPO2 / K / G / L / L / Q / S / D / Q / V / L / L / S / G / G / S / T / D / D / I / V / L / E / Y / S / N / S / P / R / A / F / A / S / D / F / A / A / A / M / I / R / M / G / D / I / S / P / L / T / G / S / N / G / I / I / R / T / V / C / G / A
FBP3 / K / G / L / L / H / S / D / Q / V / L / F / D / G / G / S / T / D / S / L / V / R / A / Y / S / N / D / Q / R / A / F / E / S / D / F / V / T / A / M / I / K / M / G / N / I / K / P / L / T / G / S / N / G / Q / I / R / R / L / C / G / R
Wheat / K / G / L / L / H / S / D / Q / V / L / F / N / G / G / G / A / D / N / T / V / R / S / F / S / S / S / A / A / T / F / N / S / A / F / T / T / A / M / V / N / M / G / N / I / A / P / K / T / G / T / Q / G / Q / I / R / L / V / C / S / K
Rice / Q / G / I / F / K / S / D / Q / G / L / I / E / D / A / Q / T / N / R / T / A / V / R / F / A / L / N / Q / A / A / F / F / D / Q / F / A / R / S / M / V / K / M / S / Q / M / D / V / L / T / G / N / A / G / E / I / R / N / N / C / A / A
Swpa4 / Q / G / L / L / F / S / D / N / E / L / M / N / S / N / T / T / S / A / A / V / R / R / Y / R / D / E / M / D / A / F / L / A / D / F / A / A / A / M / V / K / M / S / L / L / P / P / S / P / G / V / E / L / E / I / R / E / V / C / S / E
CaPO2 / I / N / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / -
FBP3 / P / N / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / -
Wheat / V / N / S / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / -
Rice / P / N / R / R / S / S / D / L / L / N / A / A / D / D / D / Q / G / F / A / A / D / A
Swpa4 / V / N / A / N / T / V / A / S / M / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / -

Fig. S1. Sequence alignment of class III peroxidases from different types of plants. Capo2, FBP3, wheat, rice, and Swpa4 represent class III peroxidases from pepper (DQ489711), French been (AF149278), wheat (X85227), rice (Os04g0688100), and sweetpotato peroxidase (AY206409), respectively. Capo2, FBP3, and Swpa4 are three peroxidases that can generate H2O2 (Choi et al., 2007; Kim et al., 2008; Bindschedler et al., 2006). The alignment was made using ClastalW and marked with BoxShade (http://www.123genomics.com/analysis.html).