Supplemental Digital Content 3 -Table S2: Summary of CD8 ICS data

Week 0 / Week 6 / Week 14 / Week 24 / Week 48 / KW
%CD107+
CD8+ T cell / Gp120 / Vaccine / 0.000 / 0.054 / 0.001 / 0.115 / 0.050 / 0.388
Control / 0.000 / 0.033 / 0.065 / 0.030 / 0.110 / 0.234
Nef / Vaccine / 0.050 / 0.100 / 0.155 / 0.145‡ / 0.210‡ / 0.387
Control / 0.000 / 0.065 / 0.008 / 0.065 / 0.000 / 0.557
Tat / Vaccine / 0.080 / 0.180 / 0.070 / 0.010 / 0.115 / 0.175
Control / 0.038 / 0.015 / 0.060 / 0.005 / 0.020 / 0.662
Gag / Vaccine / 0.675‡ / 0.760‡ / 0.535 / 0.250‡ / 0.173 / 0.070
Control / 0.128 / 0.210 / 0.237 / 0.160 / 0.190 / 0.492
%IFNg+
CD8+ T cell / Gp120 / Vaccine / 0.005 / 0.016 / 0.000 / 0.007 / 0.004 / 0.130
Control / 0.000 / 0.016# / 0.000 / 0.009 / 0.005 / 0.023
Nef / Vaccine / 0.003 / 0.003 / 0.001 / 0.029# / 0.018 / 0.184
Control / 0.009 / 0.004 / 0.000 / 0.025 / 0.010 / 0.119
Tat / Vaccine / 0.000 / 0.005 / 0.000 / 0.007 / 0.004 / 0.330
Control / 0.000 / 0.010 / 0.000 / 0.003 / 0.000 / 0.482
Gag / Vaccine / 0.054 / 0.125‡ / 0.009# / 0.032 / 0.042 / 0.018
Control / 0.007 / 0.027 / 0.015 / 0.014 / 0.006 / 0.521
%IL2+
CD8+ T cell / Gp120 / Vaccine / 0.010 / 0.020‡ / 0.006 / 0.005 / 0.001# / 0.007
Control / 0.006 / 0.000 / 0.006 / 0.001 / 0.000 / 0.810
Nef / Vaccine / 0.007 / 0.010 / 0.019 / 0.013 / 0.001 / 0.203
Control / 0.000 / 0.002 / 0.002 / 0.002 / 0.000 / 0.889
Tat / Vaccine / 0.001 / 0.012 / 0.011 / 0.003 / 0.000 / 0.004
Control / 0.000 / 0.007 / 0.000 / 0.000 / 0.000 / 0.228
Gag / Vaccine / 0.031 / 0.031 / 0.048 / 0.005# / 0.000# / 0.003
Control / 0.009 / 0.007 / 0.015 / -0.001 / 0.000 / 0.204
%TNFa+
CD8+ T cell / Gp120 / Vaccine / 0.007 / 0.016 / 0.005 / 0.001 / 0.000‡ / 0.132
Control / 0.000 / 0.009 / 0.008 / 0.004 / 0.012 / 0.507
Nef / Vaccine / 0.017 / 0.004 / 0.026 / 0.040‡ / 0.005 / 0.518
Control / 0.006 / 0.009 / 0.013 / 0.002 / 0.011 / 0.407
Tat / Vaccine / 0.026 / 0.023 / 0.008 / 0.001 / 0.000#‡ / 0.017
Control / 0.000 / 0.007 / 0.004 / 0.000 / 0.010 / 0.508
Gag / Vaccine / 0.092 / 0.132‡ / 0.042 / 0.004# / 0.010# / 0.001
Control / 0.005 / 0.015 / 0.023 / 0.000 / 0.008 / 0.376
%CFSElow
CD8+ T cell / Gp120 / Vaccine / 0.09 / 0.56‡ / 0.20 / 0.28 / 0.04 / 0.243
Control / 0.24 / 0.06# / 0.12 / 0.11 / 0.00 / 0.170
Nef / Vaccine / 0.27 / 0.33 / 0.10 / 0.14 / 0.01# / 0.017
Control / 0.31 / 0.15 / 0.12# / 0.31 / 0.00# / 0.112
Tat / Vaccine / 0.02 / 0.03 / 0.01 / 0.04 / 0.02 / 0.775
Control / 0.04 / 0.05 / 0.00 / 0.02 / 0.00# / 0.271
Gag / Vaccine / 0.71 / 0.75 / 0.52 / 0.44 / 0.42 / 0.449
Control / 0.31 / 0.14 / 0.30 / 0.37 / 0.27 / 0.738

Shading - P < 0.05 compared to week 0, and P < 0.05 compared to respective timepoint in control group. # - P < 0.05 compared to week 0. ‡- P < 0.05 compared to control group

1