Supplementary Table 1: Primer sequences, SSR repeat length, and PCR product length in acc. PI 321125 of the SSRs that were not placed on the MD-20 X Okhale-1 genetic map

Primer / Primer sequence / SSR motif / Product length
UGEP7F / GCCAACAGTTCGCTCTGC / (GA)14 / 500
UGEP7R / CTGTCTCCCGTTCTCTCCTG
UGEP9F / GGTGGAGAAGGGAGAAGGAG / (GGA)7 / 239
UGEP9R / TTGAAGGCCCAATAGCTACG
UGEP13F / AGCACGATCGAAATCCATTC / (TC)18 / 206
UGEP13R / AGATCTCGCAGCGGTTTATG
UGEP16F / TCTCCAGCTACATATGTTTTACT / (CT)14(AT)16 / 197
UGEP16R / ATATATGGGACAACCATCCA
UGEP17F / CATTGGTGTCGTTCACTTGG / (GTT)7 / 218
UGEP17R / TGCACCGTATGAGCAACAAG
UGEP19F / GGCAAGGATACCTTCATTCG / (GA)18 / 230
UGEP19R / TACCTCTGCTCTGCACATGG
UGEP20F / GGGGAAGGCAATGATATGTG / (GA)20 / 153
UGEP20R / TTGGGGAGTGCCAACAATAC
UGEP22F / ACAGAGACACGGTGGAGGTG / (TC)29 / 227
UGEP22R / CACCATGTCATCGTCACCAG
UGEP25F / GTTCGGCCTCATCGTCAG / G8(GA)19 / 292
UGEP25R / TTTATCCGACGTGACAGGTG
UGEP27F / TTGCTCTGAGGTTGTGTTGC / (GA)19 / 247
UGEP27R / TCAAGCATAGTGCCCTCCTC
UGEP28F / GAAGTTGCCATCCATGCTTC / (TC)17 / 228
UGEP28R / AGGAACCGCCAGGAAATTAG
UGEP29F / TACCATTCCATTGCATCCAC / (CT)12 / 234
UGEP29R / TTAATTAGCACTTGGGCATGG
UGEP33F / TAGCCCGTTTGCTTGTTTTG / (TC)18 / 216
UGEP33R / AAGGCCCTAGAACGTCAAGC
UGEP34F / AAGATCCTCACACGCAAACAC / (CA)12 / 196
UGEP34R / ACCCTCAACTGGTGCCATAG
UGEP45F / GGTCTCTTCAAAGCCACTGC / (GA)13 / 216
UGEP45R / AACCAACCAATCCCAATATCC
UGEP46F / CAAGTCAAAACATTCAGATGG / (GA)14 / 163
UGEP46R / CCACTCCATTGTAGCGAAAC
UGEP47F / ACAGGCCCCATAAATTCCAC / (GA)18 / 198
UGEP47R / CCCCAATCATTCTTGTATGC
UGEP50F / CACCCAGACATGACCCTTTC / (CAA)7 / 249
UGEP50R / ACTAGTGCAGGGTGGTCTCG
UGEP51F / CAGCAGCACGACTGACCTG / (GT)11 / 299
UGEP51R / TGCCACCTGACTACTCTCTGC
UGEP54F / ACATTCCTGTTCGGGTTCTG / (GTT)8 / 222
UGEP54R / TCGTGCACCATACCAATAGC
UGEP57F / CCATGGGTTCATCAAACACC / (AG)16 / 445
UGEP57R / ACATGAGCTCGCGTATTGC
UGEP58F / CATGGTGGTGGAGAGAAACC / (CA)15 / 194
UGEP58R / GCAATGGTGACATTGAGCTG
UGEP59F / ACGTGCTACGAGTGCTTGTG / (GA)11 / 248
UGEP59R / AAACCCTAAGCCCCTCAATC
UGEP62F / GTGTGACGTGGCATACTTGG / (TC)13 / 194
UGEP62R / CACGCGAGGTAGGGTAGAAG
UGEP64F / GTCACGTCGATTGGAGTGTG / (CT)23 / 206
UGEP64R / TCTCACGTGCATTTAGTCATTG
UGEP66F / CAGATCTGGGTAGGGCTGTC / (AG)29 / 219
UGEP66R / GATGGTGGTTCATGCCAAC
UGEP67F / CTCCTGATGCAAGCAAGGAC / (TC)22TT(GT)5 / 229
UGEP67R / AGGTGCCGTAGTTTGTGCTC
UGEP69F / GCATGAGCGGGAGAATAAAG / (GT)9AT(GT)7 / 171
UGEP69R / AGCTAGCCAGAAGGCATGAG
UGEP70F / TGTTGTCGCTGGACTCGTAG / (TCC)7 / 235
UGEP70R / AACCACACCCGGTTCCTC
UGEP73F / GGTCAAAGAGCTGGCTATCG / (CT)4CC(CT)10 / 229
UGEP73R / ACCAGAACCGAATCATGAGG
UGEP74F / AGATCTGGCACCCATTTCC / (CT)21 / 223
UGEP74R / AGTCATCGGGGAGGGAAG
UGEP75F / GCATTGGACGAAATAAATTGG / (AC)19(AT)29 / 400
UGEP75R / GCAAATGTGCATGGTAGCAC
UGEP79F / CCACTTTGCCGCTTGATTAG / (CT)12 / 173
UGEP79R / TGACATGAGAAGTGCCTTGC
UGEP80F / TCCTGATCATCCTCATCATCC / (CAT)7 / 185
UGEP80R / CCACTGTTTGAGCATGTTGG
UGEP83F / TAAGCTACGGCAGCGTCAG / (GA)26 / 194
UGEP83R / TCTACGCGTACGTGACCATC
UGEP84F / GGAACTTCCGTCAGTCCTTG / (CT)24 / 195
UGEP84R / TGGGGAAGGTGTTGAATCTC
UGEP86F / ACTCCCCTCACTCCCACAC / (CCT)8 / 222
UGEP86R / CAGCCACCCTTGGACATC
UGEP87F / CTTCCCCGGACAAAGTGAAC / (TC)39 / 152
UGEP87R / AAGAGACAAGGCAGGGGAAG
UGEP88F / ACCTTGATCAGGGGTGCTC / (CT)20CC(CT)8 / 227
UGEP88R / TTTTGAGTTTGCTCCCATGAC
UGEP91F / GTGGCGAGAGAGGATGATTC / (AC)8(AG)14 / 236
UGEP91R / TTCTCTAGCACGGCTTCACC
UGEP93F / TGGCCTCGTTAGGTGAAGTC / (TC)21 / 174
UGEP93R / AGCACCAAAACTCCCACAAC
UGEP95F / AGGGGACGCTTGGTTATTTG / (TC)14 / 208
UGEP95R / GCCTCTACCTGTCTCCGTTG
UGEP96F / TAATGGGCCTAATGGCAATG / (CT)10 / 211
UGEP96R / CAAAATCCGAGCCAAGATTC
UGEP97F / TTGAGCAAGGCTCCTCCTAC / (GT)8TT(GT)13 / 231
UGEP97R / TCAACTCCTCAACCCTTTGG
UGEP98F / GTCTTCCATTTGCAGCAACC / (GCC)8 / 223
UGEP98R / ACGCGTACTGACGTGCTTG
UGEP100F / TCAAGTGTTTCTGGCACTCG / (CT)12 / 223
UGEP100R / TGCAAAAGCTGGGAGTAACC
UGEP101F / GCTCACTTACCCATGGCTTC / (GA)7AA(GA)19 / 234
UGEP101R / GAAATGTGGGGCACATAAGG
UGEP103F / AGGGATGTCTTCAGCATTGG / (GTT)8 / 239
UGEP103R / ACCGTGCACCATATCAACAG
UGEP105F / CTCCCGCTGTCCCATATTAC / (GA)20 / 161
UGEP105R / TTTCTCCAGCCACAAAGGAC
UGEP109F / ACGCGACTTTGACCTGCTAC / (GA)13 / 208
UGEP109R / AAAAGGACGGGAAAGGAGAG
UGEP111F / CTCTCCCTGAGTTGGTCTGC / (GAT)11 / 160
UGEP111R / TTGGTCAGAAGCATCAGGTG

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