List of 63 SSR markers used in the study (Ma et al. 2014)

Linkage group / Locus / Forward Primer (5'-3') / Reverse Primer (5'-3') / Annealing temperature (°C) / Expected Size of Alleles (bp)
LG01 / TM237 / TTGGGAAACAAGAGTGA / TCTGGGACGAGGATAAT / 52 / 234
LG01 / TM486 / ACACAAATAACCAAGCCCCA / TGCATAAGCTTGATGGCTGT / 52 / 242
LG01 / TM556 / TTTTTCCGATATGGAGGCAG / CCCCACAGCCCATTTATCTA / 52 / 213
LG02 / TM144 / GTTTCAAACCAAATACAC / GGCGACACCTTGGAATA / 52 / 241
LG02 / TM354 / TACCAACAATCTCAACGGCA / GCCACCAGAGCCATTAGAAG / 52 / 180
LG02 / TM476 / AGCCCGCTAGCACTCATAGA / TGCACGAGACAACAAAAAGG / 52 / 220
LG02 / TM542 / GCAGCGACAGTTCTGTTGAA / CACCACATCCCCTTCCTCTA / 52 / 245
LG02 / TM577 / ACTGCTTCCCCTTCTTCCAT / TTCTTCCCACCTTTCCTTCC / 52 / 238
LG03 / TM376 / GACGACTTGGAGGGTACGAG / CACGTATCCTTTGGCCTGTT / 52 / 231
LG03 / TM477 / TTGAATTTGGATCGGGGTAA / ATCAAATCAACCCCCTCCTC / 52 / 161
LG03 / TM531 / GGGGATTCTGATGAACTCCA / CCACATTCTCTCACTTGCCC / 52 / 159
LG03 / TM543 / AGGTGGCCATACCTACGTACA / TGGAAGAGTGCATTGCATGA / 52 / 201
LG04 / TM369 / CGGAGCTGGAATCTGAAGAG / GGAAGGGTTGCAAATTCTGA / 52 / 196
LG04 / TM406 / TTTCCCCACACAGCTACACA / TTTCAGGTAAACCCCACTGC / 60 / 181
LG04 / TM422 / GGACTTCGTTGCTTCCTTTG / CCATTCTCGACGAATCCAGT / 52 / 167
LG05 / TM580 / ACTCTGGAGAGGCGAAACAA / CAACATCAACATCAGCAGCC / 52 / 234
LG05 / TM614 / TCTTGACGAACAGATCGACG / CGATTGAAGATAACCCTTTTGG / 52 / 213
LG06 / TM381 / GAGGGAGAGGATGGTGATGA / TCACCTTTCCACATTGTGATTC / 52 / 170
LG06 / TM448 / CAGTCTCCTCTGCAACACCA / AAAGGTCGAAGTGGGAAACC / 54 / 108
LG06 / TM497 / TCGTATCTCCCCATCTCGAC / CGATAGGCACCGATTCATTT / 48 / 273
LG06 / TM524 / GAGGGGATTTGGATTTGGAT / CAAAGAAGCACAAAGAAAAAGAAA / 52 / 231
LG06 / TM547 / GAGAGACAGAGAGATGGGCAA / TGACCACCACCAGACCACTA / 54 / 108
LG06 / TM596 / CGTACTTCAACGCTATAGCTCTCT / CTTCGGCATGGCTTCTAAAC / 52 / 198
LG06 / TM609 / CATCGATCTCTTCGCAACAA / CAAGCCCCTCTCAAACTCAG / 52 / 191
LG07 / MSE0108 / AGTCCATGGTGGTTGATGATCCTT / TTGGGAGTAGGATTCTTGCAGAGC / 58 / 266
LG07 / TM169 / AATAAGGCTACTCTTGG / CGGCATTGTCTTTCAGT / 52 / 193
LG07 / TM535 / TCAATCACCCTCCATTGAAA / CGTATACCATGGTCGGAAGG / 52 / 190
LG07 / TM536 / GTGGCTTCAAAGAACAAGGC / AACGAGTTGACTGACCCCAC / 60 / 206
LG07 / TM561 / AACCCAGCAAACAAAACCAG / TGGACTCTGAAGGTTTCTCCA / 52 / 226
LG08 / TM386 / GTGACTTCGAGAATGGCTCC / TCAACCCACAAACAAATCCA / 52 / 260
LG08 / TM471 / ATGTATCGCTGTCTGGGGAC / CAAGAAGAAGCCTGACCCTG / 52 / 138
LG08 / TM508 / CAAATGCATAATGTGGTCGC / ATTTCCCTCCCTTTCATGCT / 52 / 215
LG09 / TM384 / TAGACGTAACGCCGTCAACA / GTCGAAGGTACCAAGCCAGA / 52 / 197
LG09 / TM400 / CTCCTCTGTTTACGCCTTGC / CCGCCTGTATTATCCCTTGA / 52 / 162
LG09 / TM457 / AGTACCGACAACACTTCCGC / AACTTCCCCTTTCCCTCCTC / 52 / 186
LG10 / TM391 / TTTATCGACGGACGTTGGTT / ACAAGATTGACGATGACGGG / 52 / 163
LG10 / TM552 / TTTTTCAGCGACAGCTCAGA / GTGTTTCTTCGCGTGTCAGA / 52 / 190
LG10 / TM562 / GTCCGGCAAGATTGGATTTA / TCGGTCGATCATCACTGTGT / 52 / 169
LG10 / TM604 / TCTCAATCAAGGTTCCGAGG / TGACATATTCGCCCAACAAA / 52 / 196
LG11 / TM380 / TCAACACCTCCCCATCTTTC / TTGATCATGTTGAAGACGGC / 52 / 193
LG11 / TM461 / GGCTAGGGTTTCTCCCACTT / GAAGGTCGAAGCGATGTTGT / 52 / 211
LG11 / TM494 / AAATGCGACTCCAGCTCACT / TTTTGGGAGGTCCAGTTTTG / 52 / 224
LG11 / TM584 / GACGGAGCTCTCGAACAATC / TCTTCGCCTTTGTTTTTGCT / 52 / 166
LG11 / TM586 / TCGATAATACCCCCAACCAA / TCTCTCTCAAAAGTGGGCGT / 52 / 186
LG12 / TM429 / CCTATATAGAGGCGGGACGA / TGAACACGGTGGTAATCGAA / 52 / 134
LG12 / TM490 / TGGGCCAGAAGAGAAAAGAA / GGTGTTCCTGGCACTTCAAT / 52 / 177
LG12 / TM499 / AACTGTGACACCGATTGCAG / AAGTTTCACTTGCCAGCACC / 54 / 255
LG12 / TM597 / CTCATGGGCAGACTCCAAAT / GTAGCGGTGTCGAAGAGGAG / 52 / 116
LG13 / TM319 / ATCATCATCGTCACAGT / CAGCATAAGTTGTTCAG / 54 / 139
LG13 / TM382 / TCTCAAAACCAAATAGGCTCAA / TTGCGTTATGATTTCTGGGA / 52 / 162
LG13 / TM532 / TTCAAAGTCATGACAGCCAAA / GCCACTCCTCCAACTCCATA / 52 / 179
LG13 / TM555 / TATGGGTATGGGTCTGCACC / GAGCCCTCCAACCATCATTA / 52 / 117
LG14 / TM348 / GAGATGGCTTGCTCAAGGTC / CCCCAACCAAATCAAATCAC / 52 / 275
LG14 / TM351 / GGGTGAGAGTAAAGGGGGAG / AAACACAAAATCAAATTTGTCAGAA / 52 / 247
LG14 / TM530 / CCGTGTTTACCACCACCCT / CCCTGGGAACAAGAAAGTGA / 52 / 273
LG14 / TM571 / ACGAGTTCGAACCAGACGAC / CGCCACTTGAATGGGTAGTT / 52 / 251
LG15 / TM328 / AGAGGTTGGGGCTTTGTA / ACCGACCAGTCCCTTTC / 52 / 163
LG15 / TM346 / GTTTCCAGTTCCAGATCCCA / TCCGCGTTTTCTTCTTCTGT / 52 / 232
LG15 / TM507 / ATTGTCACCGGAGTTTTGGA / ATTTGGGAGTTGGCAGAATG / 52 / 260
LG15 / TM540 / CTAGTGTTGGCAAAGTCGCA / GGCTGAAAGATTGGGTGTGT / 50 / 151
LG15 / TM551 / TCCGATCTTCATTCCTCACC / AAGAGGGGTGGGTTGAGACT / 52 / 127
LG15 / TM618 / CTGCGATTGCTGTTGTTGTT / TGATCGTGGTCACAGACGTT / 52 / 175
LG15 / TM627 / TCAAGCGATTGAAGAACACG / TCAACAAGGCCCAAAGAAAC / 52 / 247