Supplemental Table 3. Amino Acid comparison of the WNV premembrane protein from Georgia isolates compared to the the NY 99 strain (HQ596519).

Strain / V1I / A29S / V19I / Y43N / K71M / A73V / V76F / K83M / T103A / T115N / M143I / S147N / M150T / V153A / F155L
NY99 / V / A / V / Y / K / A / V / K / T / T / M / S / M / V / F
2001 / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / -
2002 / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / -
DES-1228-02 / - / - / - / - / - / - / - / - / - / N / - / - / - / - / -
2003 / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / -
2004 / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / -
CHC-04-2578 / - / - / - / - / - / - / - / - / - / T / - / -
DES-04-347 / - / - / - / N / - / - / - / - / - / - / - / - / - / -
FTN-04-1485 / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / T / - / -
CHC-04-2250 / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / T / - / -
2005 / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / -
FTN-05-930 / - / - / - / H / - / V / - / - / - / - / - / - / - / -
DES-05-238 / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / A / -
2006 / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / -
FTN-136-06 / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / I / - / - / -
2007 / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / -
2008 / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / -
DKB-08-163 / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / A / -
DKB-08-157 / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / L
DKB-08-35 / - / - / - / - / - / - / - / - / A / - / - / - / - / - / -
2009 / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / -
LWN-09-846 / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / L
LWN-09-844 / - / - / - / - / - / M / - / F / M / - / - / - / - / - / -
LWN-09-674 / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / L
DKB-09-482 / I / - / I / - / - / - / - / - / - / - / - / L / - / - / -
DKB-09-281 / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / L
2010 / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / -
LWN-10-1076 / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / L
LWN-10-1042 / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / L
2011 / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / -
CHC-11-1430 / - / S / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / -
CHC-11-1429 / - / S / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / -
CHC-11-1426 / - / S / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / -
CHC-11-1420 / - / S / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / -
CHC-11-1351 / - / S / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / -
CHC-11-1157 / - / S / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / - / -

2001- DES-107-01, DES-122-01, DES-186-01, DES-193-01, DES-577-01, DES-595-01, DES-687-01, DES-689-01, DES-894-01, DES-951-01

2002-708-02, 1081-02, 1238-02, 1445-02, CHC-282-02, DES-759-02, DES-1199-02, DES-1614-02, DES-2256-02

2003- 1985-03, DES-03-1898, DES-03-1631, DES-03-1685, DES-03-1686, DES-03-1698, DES-03-1744, DES-03-1753, DES-03-1759, DES-03-1774

2004- DES-04-365, DES-04-397, DES-04-403, DES-04-412, FTN-04-208, FTN-04-613

2005- LWN-05-4936, LWN-05-1155, GW1-05-325, DES-167-05, DES-05-254, DES-05-245, DES-05-184, DES-05-175

2006- CC-263-06, DES-210-06, DES-225-06, DES-226-06, DKB-272-06, DES-06-211, DES-06-222, DES-06-260, DES-206-06

2007- GW1-07-201, FTN-07-66, FTN-07-23, DKB-07-95, DKB-07-38, DKB-07-20, CHC-07-971, CHC-07-970, CHC-07-826, CHC-07-656

2008- LWN-08-491, FTN-08-176, FTN-08-139, FTN-08-86, FTN-08-60, DKB-08-403, DES-27-08

2009- MUS-09-20, LWN-09-983, LWN-09-824, FTN-09-213, FTN-09-195, FTN-09-144

2010- FTN-10-257, FTN-10-255, FTN-10-251, FTN-10-245, FTN-10-230, FTN-10-223, FTN-10-161, DKB-10-261, DKB-10-256

2011- GLY-11-852, FTN-11-165, DKB-11-607, DKB-11-208