Table S1. Overview of antimicrobial susceptibility of all bacterial strains tested as determined with Raman spectroscopy in comparison to Vitek®2 device
Antibiotic susceptibility (μg/ml)Strain number / Bacterial species / Antibiotics / Raman spectroscopy / Vitek®2 / Broth dilution
1 / E. cloacae / CIP / 0,125 / ≤ 0,25 / 0,25
2 / E. cloacae / CIP / 0,125 / ≤ 0,25 / 0,25
3 / E. cloacae / CIP / 0,125 / ≤ 0,25 / 0,25
4 / E. cloacae / CIP / 0,125 / ≤ 0,25 / 0,25
5 / E. cloacae / CIP / 0,125 / ≤ 0,25 / 0,25
6 / E. cloacae / CIP / 0,125 / ≤ 0,25 / 0,25
7 / E. cloacae / CIP / 0,125 / ≤ 0,25 / 0,25
8 / E. cloacae / CIP / 0,25 / ≤ 0,25 / 0,25
9 / E. cloacae / CIP / 0,125 / ≤ 0,25 / 0,25
10 / E. cloacae / CIP / 0,125 / ≤ 0,25 / 0,25
11 / E. faecalis / AMX / 1 / Sensitive / 1
12 / E. faecalis / AMX / 2 / Sensitive / 1
13 / E. faecalis / AMX / 1 / Sensitive / 1
14 / E. faecalis / AMX / 1 / Sensitive / 1
15 / E. faecalis / AMX / 8 / Sensitive / 2
16 / E. faecalis / AMX / 4 / Sensitive / 2
17 / E. faecalis / AMX / 1 / Sensitive / 1
18 / E. faecalis / AMX / 1 / Sensitive / 1
19 / E. faecalis / AMX / 2 / Sensitive / 1
20 / E. faecalis / AMX / 1 / Sensitive / 1
21 / E.coli / CXM / 2 / ≤ 4 / 1
22 / E.coli / CXM / 2 / ≤ 4 / 1
23 / E.coli / CXM / 2 / ≤ 4 / 1
24 / E.coli / CXM / 2 / ≤ 4 / 1
25 / E.coli / CXM / 2 / ≤ 4 / 1
26 / E.coli / CXM / 2 / ≤ 4 / 1
27 / E.coli / CXM / 2 / ≤ 4 / 1
28 / E.coli / CXM / 2 / ≤ 4 / 1
29 / E.coli / CXM / 2 / ≤ 4 / 1
30 / E.coli / CXM / 2 / ≤ 4 / 1
31 / K. pneumoniae / CXM / 1 / ≤ 1 / 1
32 / K. pneumoniae / CXM / 1 / ≤ 1 / 1
33 / K. pneumoniae / CXM / 0,5 / ≤ 1 / 1
34 / K. pneumoniae / CXM / 1 / ≤ 1 / 1
35 / K. pneumoniae / CXM / 1 / ≤ 1 / 1
36 / K. pneumoniae / CXM / 1 / ≤ 1 / 1
37 / K. pneumoniae / CXM / 1 / ≤ 1 / 1
38 / K. pneumoniae / CXM / 1 / ≤ 1 / 1
39 / K. pneumoniae / CXM / 1 / ≤ 1 / 1
40 / K. pneumoniae / CXM / 1 / ≤ 1 / 1
41 / P.aeruginosa / TOB / 2 / ≤1 / 1
42 / P.aeruginosa / TOB / 2 / ≤1 / 2
43 / P.aeruginosa / TOB / 0,5 / ≤1 / 1
44 / P.aeruginosa / TOB / 1 / ≤1 / 0,5
45 / P.aeruginosa / TOB / 1 / ≤1 / 0,5
46 / P.aeruginosa / TOB / 1 / ≤1 / 0,5
47 / P.aeruginosa / TOB / 2 / ≤1 / 0,5
48 / P.aeruginosa / TOB / 1 / ≤1 / 1
49 / P.aeruginosa / TOB / 1 / ≤1 / 0,5
50 / S. marcescens / GEN / 1 / ≤1 / 0,5
51 / S. marcescens / GEN / 2 / ≤2 / 1
52 / S. marcescens / GEN / 2 / ≤1 / 1
53 / S. marcescens / GEN / 1 / ≤1 / 1
54 / S. marcescens / GEN / 2 / ≤1 / 1
55 / S. marcescens / GEN / 2 / ≤1 / 1
56 / S. marcescens / GEN / 1 / ≤1 / 1
57 / S. marcescens / GEN / 2 / ≤2 / 1
58 / S. marcescens / GEN / 2 / ≤1 / 1
59 / S. aureus / GEN / 1 / ≤0.5 / 1
60 / S. aureus / GEN / 0.5 / ≤0.5 / 1
61 / S. aureus / GEN / 0.5 / ≤0.5 / 0,5
62 / S. aureus / GEN / 0.5 / ≤0.5 / 0,5
63 / S. aureus / GEN / 1 / ≤0.5 / 1
64 / S. aureus / GEN / 1 / ≤0.5 / 0,5
65 / S. aureus / GEN / 1 / ≤0.5 / 0,5
66 / S. aureus / GEN / 0.5 / ≤0.5 / 0,5
67 / S. aureus / GEN / 1 / ≤0.5 / 0,5
Antibiotic susceptibility (μg/ml)
Strain number / Bacterial species / Antibiotics / Raman spectroscopy / Vitek®2 / Broth dilution
68 / E. cloacae / CIP / 1* / ≥4 / 2
69 / E. cloacae / CIP / 1* / ≥4 / 2
70 / E. cloacae / CIP / ≥8 / ≥4 / >8
71 / E. cloacae / CIP / 1* / ≥4 / 2
72 / E. cloacae / CIP / ≥8 / ≥4 / >8
73 / E. cloacae / CIP / 1* / ≥4 / 2
74 / E. cloacae / CIP / 1* / ≥4 / 2
75 / E. cloacae / CIP / ≥8 / ≥4 / >8
76 / E. cloacae / CIP / 1* / ≥4 / 2
77 / E. faecium / AMX / ≥16 / >16 / >16
78 / E. faecium / AMX / 8 / >16 / >16
79 / E. faecium / AMX / ≥16 / >16 / >16
80 / E. faecium / AMX / ≥16 / >16 / >16
81 / E. faecium / AMX / ≥16 / >16 / >16
82 / E. faecium / AMX / ≥16 / >16 / >16
83 / E. faecium / AMX / ≥16 / >16 / >16
84 / E. faecium / AMX / ≥16 / >16 / >16
85 / E. faecium / AMX / ≥16 / >16 / >16
86 / E.coli / CXM / ≥128 / >64 / >128
87 / E.coli / CXM / ≥128 / >64 / >128
88 / E.coli / CXM / ≥128 / >64 / >128
89 / E.coli / CXM / ≥128 / >64 / >128
90 / E.coli / CXM / 32 / >64 / 64
91 / E.coli / CXM / ≥128 / >64 / >128
92 / E.coli / CXM / 32 / >64 / >128
93 / E.coli / CXM / 32 / >64 / >128
94 / E.coli / CXM / ≥128 / >64 / >128
95 / K. pneumoniae / CXM / ≥128 / >64 / >128
96 / K. pneumoniae / CXM / ≥128 / >64 / >128
97 / K. pneumoniae / CXM / ≥128 / >64 / >128
98 / K. pneumoniae / CXM / ≥128 / >64 / >128
99 / K. pneumoniae / CXM / ≥128 / >64 / >128
100 / K. pneumoniae / CXM / 16 / >64 / 32
101 / K. pneumoniae / CXM / ≥128 / >64 / >128
102 / K. pneumoniae / CXM / ≥128 / >64 / >128
103 / K. pneumoniae / CXM / ≥128 / >64 / >128
104 / K. pneumoniae / CXM / ≥128 / >64 / >128
105 / P.aeruginosa / TOB / 128 / >8/≥16 / >128
106 / P.aeruginosa / TOB / 16 / >8/≥16 / 32
107 / P.aeruginosa / TOB / ≥128 / >8/≥16 / >128
108 / P.aeruginosa / TOB / ≥128 / >8/≥16 / >128
109 / P.aeruginosa / TOB / ≥128 / >8/≥16 / >128
110 / P.aeruginosa / TOB / ≥128 / >8/≥16 / >128
111 / P.aeruginosa / TOB / ≥128 / >8/≥16 / >128
112 / P.aeruginosa / TOB / ≥128 / >8/≥16 / >128
113 / P.aeruginosa / TOB / 128 / >8/≥16 / 64
114 / S. marcescens / CXM / ≥64 / 32 / >64
115 / S. marcescens / CXM / 16 / 32 / 32
116 / S. marcescens / CXM / 16 / 32 / 16
117 / S. marcescens / CXM / 16 / 32 / 16
118 / S. marcescens / CXM / 8 / 32 / 16
119 / S. marcescens / CXM / 8 / 32 / 16
120 / S. marcescens / CXM / 8 / 32 / 16
121 / S. marcescens / CXM / 16 / 32 / 16
122 / S. marcescens / CXM / 8 / 32 / 16
123 / S. marcescens / CXM / 8 / 32 / 16
124 / S. aureus / CIP / ≥8 / >4/≥8 / >8
125 / S. aureus / CIP / ≥8 / >4/≥8 / >8
126 / S. aureus / CIP / 2* / >4/≥8 / 1
127 / S. aureus / CIP / ≥8 / >4/≥8 / >8
128 / S. aureus / CIP / 4 / >4/≥8 / >8
129 / S. aureus / CIP / ≥8 / >4/≥8 / >8
130 / S. aureus / CIP / 1* / >4/≥8 / 2
131 / S. aureus / CIP / 0,5* / >4/≥8 / 1
132 / S. aureus / CIP / ≥8 / >4/≥8 / >8
133 / S. aureus / CIP / 1* / >4/≥8 / 1