Table S1 accessions sampled for TMS5 gene
Type of nucleus / Variety / Origin / IRGC Acc. NO / ProviderIndica / 9311 / China / Lab store
Guangluai 4 / China / Lab store
Nangjingn 3 / China / Lab store
Nangjing 11 / China / Lab store
Zhenshan 97 / China / Lab store
Taichung native 1 / Taiwan / Lab store
Peta / Indonesia / Lab store
Milyang 23 / Korea / Lab store
Milyang 54 / Korea / Lab store
Suwon 331 / Korea / Lab store
Minghui 63 / China / Lab store
Xiangzaoxian 24 / China / Lab store
Teqing / China / Lab store
Shuhui 527 / China / Hunan Yahua Seed Insitute
Chau / Vietnam / 56036 / IRRI
Binulawan / Philippines / 26872 / IRRI
Chhote Dhan / Nepal / 58930 / IRRI
Kalukantha / Sri Lanka / 7755 / IRRI
Rathuwee / Sri Lanka / 8952 / IRRI
Khao Dawk Mali / Thailand / 27748 / IRRI
Lalaman / India / 46202 / IRRI
Japonica / Nipponbare / China / Lab store
P002 / USA / Lab store
Lemont / USA / Lab store
CPSLO17 / USA / Lab store
Rosemont / USA / Lab store
IM273 / No record / Lab store
IM359 / No record / Lab store
D16 / No record / Hunan Yahua Seed Insitute
Taibei 309 / Taiwan / Labor store
Zhengxuan 2 / China / Labor store
2426B / China / Bejing-basedChineseAcademyofAgricultural Sciences
2464B / China / Beijing-basedChineseAcademyofAgricultural Sciences
Liaoxing 1B / China / Beijing-basedChineseAcademyofAgricultural Sciences
Aizinuo / China / Lab store
Zhonghua 11 / China / Lab store
Qiuguang / China / Lab store
Bairizao / China / Lab store
Balila / China / Lab store
Dalijing / China / Lab store
PC311 / China / Lab store
Lunhui 42 / China / Lab store
C418 / China / Lab store
Luk Takhar / Afghanistan / 58286 / IRRI
Mansaku / Japan / 8191 / IRRI
Table S1 continued
Type of nucleus / Variety / Origin / IRGC Acc. NO / ProviderJaponica / Norin 20 / Japan / 418 / IRRI
Koshihikari / Japan / 10907 / IRRI
Kotobuki Mochi / Japan / 2545 / IRRI
Akihikari / Japan / Lab store
Ta Hung Ku / China / 1107 / IRRI
Heu kgyeong / Korea,South / 55530 / IRRI
Khao Hawm / Thailand / 24225 / IRRI
Gotak Gatik / Indonesia / 43397 / IRRI
O. rufipogon / Changjinag 1068 CWR / Hainan,
China / Lab store
Anren CWR / Hunan, China / Lab store
Caling CWR / Hunan,
China / Hunan Rice
Dongxiang CWR / Jiangxi,
China / Hunan Hybrid Rice Research Center
Gongguan CWR / Guangxi,
China / South China Agriculture
Hainan / Hainan,
China / South China Agriculture
Jiangyong CWR / Hunan,
China / Hunan Rice
Liujiang CWR / Guangdong,
China / Nanning Wild Rice Garden
O. nivara / Nepel NWR / Nepel / 105706 / IRRI
Aromatic / ARC 13829 / India / 42469 / IRRI
Basmati 217 / India / 53637 / IRRI
JC 101 / India / 9060 / IRRI
Pankhari 203 / India / 5999 / IRRI
DA 13 / Bangladesh / 5857 / IRRI
Kitrana 508 / Madagascar / 12793 / IRRI
Mehr / Iran / 12883 / IRRI
Bico Branco / Brazil / 38994 / IRRI
JC73-4 / India / 9115 / IRRI
JC111 / India / 9062 / IRRI
JC117 / India / 9179 / IRRI
JC148 / India / 9069 / IRRI
JC149 / India / 9070 / IRRI
Aus / Black Gora / India / 40275 / IRRI
FR13A / India / 6144 / IRRI
DZ78 / Bangladesh / 8555 / IRRI
Bhadoia 233 / Bangladesh / 6541 / IRRI
KALAMKATI / India / 45975 / IRRI
T1 / India / 6294 / IRRI
Table S2 Primers used for amplification and sequencing of the TMS5 gene
Name / SequencePromoter-1F / ATTGGACCCACCGATTT
Promoter-1R / ATTGATCTAGTGATGGTGC
Promoter-2F / TGTGGTGGAGAAATGCG
Promoter-2R / TTGGCACGAAGCACGAT
Gene-1F / TCACCCTTCCAACCTCTTAC
Gene-1R / TCAGGCTGAATAGCAACAAT
Gene-1F / GGAGGTATTGCTTCTTATCG
Gene-1R / GGGTGGCAACTTATTGATTG
3’end F / GCTCGTTATACCGCAGAG
3’end R / GAAGGGTGACAAATGGAA
Table S3 Latitude and flowering time in different wild rice
Variety / Latitude / Flowering timeDongxiang CWR / 28° 14´ N / Late August to Early September
Caling CWR / 26° 70´ N / Late August to Early September
Anren CWR / 26° 50´ N / September
Jiangyong CWR / 25° 28´ N / September
Liujiang CWR / 24° 27´ N / Late September to mid-October
Gongguan CWR / 21° 47´ N / Late September to mid-October
Changjiang 1068 CWR / 18° 09´ N- 20° 18´ N / Late October to late November
Hainan / 18° 09´ N- 20° 18´ N / Late October to late November
Nepel NWR / 6° 01´ N / Late October to late November
high temperature low temperature
Changjiang 1068
Chaling CWR
Dongxiang CWR
Liujiang CWR
Nepel NWR
Figure S1 Fertility analysis of wild rice with non-synonymous substitution sites under high and low temperature.
Figure S2 Geographic locations of wild rice.
1. TMS5 promoter sequence of different materials:
Ruf, O. Rufipogon; Niv: O. nivara; Ind: Indica; Jpn, Japonica
>RufChangjiang1068
CGGGTGATCAGGATGAGCAGGCCTCCGGAACTCCGTCCAGTTGCGTACCTGCATGGGTAGGCGGGCGATCAAGTTTTTGGGGAGCGCTCTTGGGCGCGACTGCTCCTGTTCGACAACGGTTCTACACTGCTACATCTTCGCCAACATGTCGACGGACAACACCAACACTCGCACTGGCACTGGAAAGCCTCAACTAGTACATGAGCGTTCTCAGGGTATATGTCCATTCCCTTACCGTTAATTATGCTGCTAGAAGATTTTTCTGTTAATGCTTATCGCAATGTTACAATTGCGTTACTATGTGAATGTTATACTTATTTTATGAAAAGCATGCTCATGCTGAGCACCATCACTAGATCAATTCTCATTGCAAATGTCATGTTTATTATCTTGTTGGTGGACCTGCAGCCAATTTTGGGTC...AAGAAGAGAACGAGGTAGCGGAGAGGTTTGAGGTGATGTTGTGTGGTGGAGAAATGCGTGAGATGAGGATTGTGTCCGATATTTCACTTCGCACCGGATGCTCGATCTGAAGCATTTTCGGATTTGTGATTCTATTTTGAACATTTGTGTTGTGGTACTGAAATTTCCGAGATTTCAGAAAAACTTTTTAAAATAATTCGAACTAATTTTAGCCAAATCTAAACAAATTTGGACCAAATTCAAAAAAAGAGAAAAAATTTGAAAATTATGACGAAATATTTTGGTGTCCGGTGAGGGTCCGAAATTTCGGGAATTCCGAACGAAAATTATAAACATTGTGCATGGGAGTTTAATTACGGGGATGGGAATTTATCCTCATGACTCCCTGCCTTTCAATACGCTGGGGGAATTGGGAGGAAATTCATCTTCACTTAAAATCTAATTTCCTTCTATACTACGTAAGACTATCGGATTGAATCCAATAAACTTCTAAACTGCCTAAGATATCTGTCCAAAATTAGAGATAAATTAGCAACACCATACCAAACCAACCAAAATGACAAATTAATTCTCAGTCCAAAATTACATGCATGGACAGTGCAGCAACAACCGGCATCCATGAATCCATAAACCGAGAGTGGCCAAACAGCTGCTACTTCACCTGCACTGCAACTTCTTGCGAATCCTTAACCCTCTGAATCTGATAGGTTGTCAAGATAATCTTGCATTTGTGGCTTTGACACGACGACGATGACGAACACCGCCTGATTCTGATGGAGCAGAAGCTGCCATTTCCCGATGGGCACAGCAAGCTATTCGACCGAGGAATCTCTACCTTCGCTGCCGATGCAACCTCTTGCACCGGCAGCAAGCTGGTTATCGGTGCCGAGGAGAAGCCCTTCTCAATGTTGATGTTATTCCAATACACTCCTATAATCGATAATATTGTAAGCTAATATATTGACGTGCAATTCTTTTACGTCTTCGCGAAAAACCGGTAATGTCGTAAGGAAATGCCCCCAAAAGCTCCCACGTGTTCACCCTTCCAACCTCTTACAGGCTAGATGTTGAAGAAGCATCCTGGGCCGTTGGATATCAATCCAACGCC.AGCAGTAGTCGACCGAGTAGACATTGACTTGGGCCGTGCCCGGCCCGGCCCATCGTGCTTCGTGCCAAAACGGGCCGTGCCGGAACAACCCCCCACCACGGCGGCGGCGGCGGCGGCGCCA
>NivNepal NWR
CGGGTGATCAGGACGAGCAGGCCTCCGGAACTCCGTCCAGTTGCGTACCTGCATGGGTAGGCGGGCGATCAAGTTTTGGGGGAGCGCTCTTGGGCGCGACTGCTTCTGTTCGACAACGGTTCTACACTGCTACATCTTCGCCAACATGTCGACGGACAACACCAACACTCGCACTGGCACTGGAAAGCCTCAACTAGTACATGAGCGTTCTCAGGGTATATGTCCATTCCCTTACCGTTAATTATGCTGCTAGAAGATTTTTCTGTTAATGCTTATCGCAATGTTACAATTGCGTTACTATGTGAATGTTATACTTATTTTATGAAAAGCATGCTCATGCTGAGCACCATCACTAGATCAATTCTCATTGCAAATGTCATGTTTATTATCTTGTTGGTGGACCTGCAGCCAATTTTGGGTC...AAGAAGAGAACGAGGTAGCGGAGAGGTTTGAGGTGATGTTGTGTGGTGGAGAAATGCGTGAGATGAGGATTGTGTCCGATATTTCACTTCGCACCGGATGCTCGATCTGAAGCATTTTCGGATTTGTGATTCTATTTTGAACATTTGTGTTGTGGTACTGAAATTTCCGAGATTTCAGAAAAACTTTTTAAAATAATTCGAACTAATTTTAGCCAAATCTAAACAAATTTGGACCAAATTCAAAAAAAGAGAAAAAATTTGAAAATTATGACGAAATATTTTGGTGTCCGGTGAGGGTCCGAAATTTCGGGAATTCCGAACGAAAATTATAAACATTGTGCATGGGAGTTTAATTACGGGGATGGGAATTTATCCTCATGACTCCCTGCCTTTCAATACGCTGGGGGAATTGGGAGGAAATTCATCTTCACTTAAAATCTAATTTCCTTCTATACTACGTAAGACTATCGGATTGAATCCAACAAACTTCTAAACTGCCTAAGATATCTGTCCAAAATTAGAGATAAATTAGCAACACCATACCAAACCAACCAAAATGACAAATTAATTCTCAGTCCAAAATTACATGCATGGACAGTGCAGCAACAACCGGCATCCATGAATCCATAAACCGAGAGTGGCCAAACAGCTGCTACTTCACCTGCGCTGCAACTTCTTGCGAATCCTTAACCCTCTGAATCTGATAGGTTGTCAAGATAATCTTGCATTTGTGGCTTTGACGCGACGACGATGACGAACACCGCCTGATTCTGATGGAGCAGAAGCTGCCATTTCCCGATGGGCACAGCAAGCTATTCGACCGAGGAATCTCTACCTTCGATGCCGATGCAACCTCTTGCACCGGCAGCAAGATGGTCGTCGGTGCCGAGGAGAAGCCCTTCTCAATGTTGATGTTATTCTAATACACACCTATAATCGATAATATTGTAAGCTAATATATTGACGTGCAATTCTTTTACGCGTTCGCGAAAAACCGGTAATGTCGTAAGGAAATGCCCCCAAAAGCTCCCACGTGTTCACCCTTCCAACCTCTTACAGGCTAGATGTTGAAGAAGCATCCTGGGCCGTTGGATATCAATCCAACGCCTAGCAGTAGTTGACCGAGTAGACATTGACTTGGGCCGTGCCCGGCCCGGCCCATCGTGCTTCGTACCAAAACGGGCCGTGCCGGACCAACCCCCCACCACGGCGGCGGCGGCGGCGGCGCCA
>RufAnren
CGGGTGATCAGGACGAGCAGGCCTCCGGAACTCCGTCCAGTTGCGTACCTGCATGGGTAGGCGGGCGATCAAGTTTTTGGGGAGCGCTCTTGGGCGCGACTGCTCCTGTTCGACAATGGTTCTACACTGCTACATCTTCGCCAACATGTCGACGGACAACACCAACACTCGCACTGGCACTGGAAAGCCTCAACTAGTACATGAGCGTTCTCAGGATATATGTCCATTCCCTTACCGTTAATTATGCTGCTAGAAGATTTTTCTGTTAATGCTTATCGCAATGTTACAATTGCGCTACTATGTGAATGTTATACTTATTTTATGAAAAGCATGCTCATGCTGAGCACCATCACTAGATCAATTCTCATTACAAATGTCATGTTTATTATCTTGTTGGTGGACCTGCAGCCAATTTTGGGTC...AAGAAGAGAACGAGGTAGCGGAGAGGTTTGAGGTGATGTTGTGTGGTGGAGAAATGCGTGAGATGAGGATTGTGTCCGATATTTCACTTCGCACCGGATGCTCGATCTGAAGCATTTTTGGATTTGTGATTCTATTTTGAACATTTGTGTTGTGGTACTGAAATTTCCGAGATTTCAGAAAAACTTTTTAAAATAATTTGAACTAATTTTAGCCAAATCTAAACAAATTTGGACCAAATTCAAAAAAAGAGAAAAAATTTGAAAATTATGACGAAATATTTTGGTGTCCGGTGAGGGTCCGAAATTTCGGGAATTCCGAACGAAAATTATAAACATTGTGCATGGGAGTATAATTACGGGGATGGGAATTTATCCTCATGACTCCCTGCCTTTCAATACGCTGGGGGAATTGGGAGGAAATTCATCTTCACTTAAAATCTAATTTCCTTCTATACTACGTAAGACTATCGGATTGAATCCAATAAACTTCTAAACTGCCTAAGATATCTGTCCAAAATTAGAGATAAATTAGCAACACCATACCAAACCAACCAAAATGACAAATTAATTCTCAGTCCAAAATTACATGCATGGACAGTGCAGCAACAACCGGCATCCATGAATCCATAAACCGAGAGTGGCCAAACAGCTGCTACTTCACCTGCACTGCAACTTCTTGCGAATCCTTAACCCTCTGAATCTGATAGGTTGTCAAGATAATCTTGCATTTGTGGCTTTGACACGACGACGATGACGAACACCGCCTGATTCTGATGGAGCAGAAGCTGCCATTTCCCGATGGGCACAGCAAGCTATTCGACCGAGGTATCTCTACCTTCGATGCCGATGCAACCTCATGCACCGGCAACAAGCTAGTCGTCGGTGCCGAGGAGAAGCCCTTCTCAATGTTGATATTATTCCAATATACACTTATAATCGATAATATTATAAGCTAATATATTGACGTGCAATTCTTTTACGCGTTCGCGAAAAACCGGTAATGTTGTAAGGAAATGCCCCCAAAAGCTCCCACGTGTTCACCCTTCCAACCTCTTACAGGCTAGATGTTGAAGAAGCATCCTGGGCCGTTGGATATCAATCCAACGGCTAGCAGTAGTCGACCGAGTAGACATTGACTTGGGCCGTGCCCGGCCCGGCCCATCGTGCTTCGTGCCAAAACGGGCCGTGCCGAACCAACCCCCCACCACGGCGGCGGCGGCGGCGGCGCCA
>RufChaLing
CGGGTGATCAGGACGAGCAGGCCTCCGGAACTCCGTCCAGTTGCGTACCTGCATGGGTAGGCGGGCGATCAAGTTTTTGGGGAGCGCTCTTGGGCGCGACTGCTCCTGTTCGACAACGGTTCTACACTGCTACATCTTCGCCAACATGTCGACGGACAACACCAACACTCGCACTGGCACTGGAAAGCCTCAACTAGTACATGAGCGTTCTCAGGGTATATGTCCATTCCCTTACCGTTAATTATGCTGCTAGAAGATTTTTCTGT..ATGCTTATCGCAATGTTACAATTGCGTTACTATGTGAATGTTATACTTATTTTATGAAAAGCATGCTCATGCTGAGCACCATCACTAGATCAATTCTCATTGCAAATGTCATGTTTATTATCTTGTTGGTGGACCTGCAGCCAATTTTGGGTCAAGAAGAATAGAACGAGGTAGCAGAGAGGTTTGAGGTGATGTTGTGTGGTGGAGAAATGCGTGAGATGAGGATTGTGTCCGATATTTCACTTCGCACCGGTTGCTCGATCTGAAGCATTTTCGGATTTGTGATTCTATTTTGAACATTTGTGTTGTGGTACTGAAATTTCCGAGATTTCAGAAAAACTTTTTAAAATAATTCGAACTAATTTTAGCCAAATCTAAACAAATTTGGACCAAATTCAAAAAAAGAGAAAAAATTTGAAAATTATGACGAAATATTTTGGTGTCCGGTGAGGGTCCGAAATTTCGGGAATTCCGAACGAAAATTATAAACATTGTGCATGGGAGTTTAATTACGGGGATGGGAATTTATCCTCATGACTCCCTGCCTTTCAATACGCTGGGGGAATTGGGAGGAAATTCATCTTCACTTAAAATCTAATTTCCTTCTATACTACGTAAGACTATCGGATTGAATCCAATAAACTTCTAAACTGCCTAAGATATCTGTCCAAAATTAGAGATAAATTAGCAACACCATACCAAACCAACCAAAATGACAAATTAATTCTCAGTCCAAAATTACATGCATGGACAGTGCAGCAACAACCGGCATCCATGAATCCATAAACCGAGAGTGGCCAAACAGCTGCTACTTCACCTGCACTGCAACTTCTTGCGAATCCTTAACCCTCTGAATCTGATAGGTTGTCAAGATAATCTTGCATTTGTGGCTTTGACACGACGACGATGACGAACACTGCCTGATTCTGATGGAGCAGAAGCTGCCATTTCCCGATGGGCACAGCAAGCTATTCGACCGAGGAATCTCTACCTTCGCTGCCGATGCAACCTCTTGCACCGGCAGCAAGCTGGTCGTCGGTGCCGAGGAGAAGCCCTTCTCAATGTTGATGTTATTCCAATACACTCCTATAATCGATAATATTGTAAGCTAATATATTGACGTGCAATTCTTTTACGTCTTCGCGAAAAACCGGTAATGTCGTAAGGAAATGCCCCCAAAAGCTCCCACGTGTTCACCCTTCCAACCTCTTACAGGCTAGATGTTGAAGAAGCATCCTGGGCCGTTGGATATCAATCCAACGCATAGCAGTAGTCGACCGAGTAGACATTGACTTGGGCCGTGCCCGGCCCGGCCCATCGTGCTTCGTGCCAAAACGGGCCGTGCCGGAACAACCCCCCACCACGGCGGCGGCGGCGGCGGCGCCA
>RufDongXiang
CGGGTGATCAGGACGAGCAGGCCTCCGGAACTCCGTCCAGTTGCGTACCTGCATGGGTAGGCGGGCGATCAAGTTTTTGGGGAGCGCTCTTGGGCGCGACTGCTCCTGTTCGACAACGGTTCTACACTGCTACATCTTCGCCAACATGTCGACGGACAACACCAACACTCGCACTGGCACTGGAAAGCCTCAACTAGTACATGAGCGTTCTCAGGGTATATGTCCATTCCCTTACCGTTAATTATGCTGCTAGAAGATTTTTCTGTTAATGCTTATCGCAATGTTACAATTGCGTTACTATGTGAATGTTATACTTATTTTATGAAAAGCATGCTCATGCTGAGCACCATCACTAGATCAATTCTCATTGCAAATGTCATGTTTATTATCTTGTTGGTGGACCTGCAGCCAATTTTGGGTCAAGAAGAAGAGAACGAGGTAGCGGAGAGGTTTGAGGTGATGTTGTGTGGTGGAGAAATGCGTGAGATGAGGATTGTGTCCGATATTTCACTTCGCACCGGTTGCTCGATCTGAAGCATTTTCGGATTTGTGATTCTATTTTGAACATTTGTGTTGTGGTACTGAAATTTCCGAGATTTCAGAAAAACTTTTTAAAATAATTCGAACTAATTTTAGCCAAATCTAAACAAATTTGGACCAAATTCAAAAAAAGAGAAAAAATTTGAAAATTATGACGAAATATTTTGGTGTCCGGTGAGGGTCCGAAATTTCGGGAATTCCGAACGAAAATTATAAACATTGTGCATGGGAGTTTAATTACGGGGATGGGAATTTATCCTCATGACTCCCTGCCTTTCAATACGCTGGGGGAATTGGGAGGAAATTCATCTTCACTTAAAATCTAATTTCCTTCTATACTACGTAAGACTATCGGATTGAATCCAATAAACTTCTAAACTGCCTAAGATATCTGTCCAAAATTAGAGATAAATTAGCAACACCATACCAAACCAACCAAAATGACAAATTAATTCTCAGTCCAAAATTACATGCATGGACAGTGCAGCAACAACCGGCATCCATGAATCCATAAACCGAGAGTGGCCAAACAGCTGCTACTTCACCTGCACTGCAACTTCTTGCGAATCCTTAACCCTCTGAATCTGATAGGTTGTCAAGATAATCTTGCATTTGTGGCTTTGACACGACGACGATGACGAACACTGCCTGATTCTGATGGAGCAGAAGCTGCCATTTCCCGATGGGCACAGCAAGCTATTCGACCGAGGAATCTCTACCTTCGCTGCCGATGCAACCTCTTGCACCGGCAGCAAGCTGGTCGTCGGTGCCGAGGAGAAGCCCTTCTCAATGTTGATGTTATTCCAATACACTCCTATAATCGATAATATTGTAAGCTAATATATTGACGTGCAATTCTTTTACGTCTTCGCGAAAAACCGGTAATGTCGTAAGGAAATGCCCCCAAAAGCTCCCACGTGTTCACCCTTCCAACCTCTTACAGGCTAGATGTTGAAGAAGCATCCTGGGCCGTTGGATATCAATCCAACGCATAGCAGTAGTCGACCGAGTAGACATTGACTTGGGCCGTGCCCGGCCCGGCCCATCGTGCTTCGTGCCAAAACGGGCCGTGCCGGAACAACCCCCCACCACGGCGGCGGCGGCGGCGGCGCCA
>RufGongGuan
CGGGTGATCAGGACGAGCAGGCCTCCGGAACTCCGTCCAGTTGCGTACCTGCATGGGTAGGCGGGCGATCAAGTTTTTGGGGAGCGCTCTTGGGCGCGACTGCTCCTGTTCGACAACGGTTCTACACTGCTACATCTTCGCCAACATGTCGACGGACAACACCAACACTCGCACTGGCACTGGAAAGCCTCAACTAGTACATGAGCGTTCTCAGGGTATATGTCCATTCCCTTACCGTTAATTATGCTGCTAGAAGATTTTTCTGTTAATGCTTATCGCAATGTTACAATTGCGTTACTATGTGAATGTTATACTTATTTTATGAAAAGCATGCTCATGCTGAGCACCATCACTAGATCAATTCTCATTGCAAATGTCATGTTTATTATCTTGTTGGTGGACCTGCAGCCAATTTTGGGTCAAGAAGAAGAGAACGAGGTAGCGGAGAGGTTTGAGGTGATGTTGTGTGGTGGAGAAATGCGTGAGATGAGGATTGTGTCCGATATTTCACTTCGCACCGGTTGCTCGATCTGAAGCATTTTCGGATTTGTGATTCTATTTTGAACATTTGTGTTGTGGTACTGAAATTTCCGAGATTTCAGAAAAACTTTTTAAAATAATTCGAACTAATTTTAGCCAAATCTAAACAAATTTGGACCAAATTCAAAAAAAGAGAAAAAATTTGAAAATTATGACGAAATATTTTGGTGTCCGGTGAGGGTCCGAAATTTCGGGAATTCCGAACGAAAATTATAAACATTGTGCATGGGAGTTTAATTACGGGGATGGGAATTTATCCTCATGACTCCCTGCCTTTCAATACGCTGGGGGAATTGGGAGGAAATTCATCTTCACTTAAAATCTAATTTCCTTCTATACTACGTAAGACTATCGGATTGAATCCAATAAACTTCTAAACTGCCTAAGATATCTGTCCAAAATTAGAGATAAATTAGCAACACCATACCAAACCAACCAAAATGACAAATTAATTCTCAGTCCAAAATTACATGCATGGACAGTGCAGCAACAACCGGCATCCATGAATCCATAAACCGAGAGTGGCCAAACAGCTGCTACTTCACCTGCACTGCAACTTCTTGCGAATCCTTAACCCTCTGAATCTGATAGGTTGTCAAGATAATCTTGCATTTGTGGCTTTGACACGACGACGATGACGAACACTGCCTGATTCTGATGGAGCAGAAGCTGCCATTTCCCGATGGGCACAGCAAGCTATTCGACCGAGGAATCTCTACCTTCGCTGCCGATGCAACCTCTTGCACCGGCAGCAAGCTGGTCGTCGGTGCCGAGGAGAAGCCCTTCTCAATGTTGATGTTATTCCAATACACTCCTATAATCGATAATATTGTAAGCTAATATATTGACGTGCAATTTTTTTACGTCTTCGCGAAAAACCGGTAATGTCGTAAGGAAATGCCCCCAAAAGCTCCCACGTGTTCACCCTTCCAACCTCTTACAGGCTAGATGTTGAAGAAGCATCCTGGGCCGTTGGATATCAATCCAACGCCTAGCAGTAGTCGACCGAGTAGACATTGACTTGGGCCGTGCCCGGCCCGGCCCATCGTGCTTCGTGCCAAAACGGGCCGTGCCGGAACAACCCCCCACCACGGCGGCGGCGGCGGCGGCGCCA
>RufHaiNan
CGGGTGATCAGGACGAGCAGGCCTCCGGAACTCCGTCCAGTTGCGTACCTGCATGGGTAGGCGGGCGATCAAGTTTTTGGGGAGCGCTCTTGGGCGCGACTGCTCCTGTTCGACAACGGTTCTACACTGCTACATCTTCGCCAACATGTCGACGGACAACACCAACACTCGCACTGGCACTGGAAAGCCTCAACTAGTACATGAGCGTTCTCAGGGTATATGTCCATTCCCTTACCGTTAATTATGCTGCTAGAAGATTTTTCTGTTAATGCTTATCGCAATGTTACAATTGCGTTACTATGTGAATGTTATACTTATTTTATGAAAAGCATGCTCATGCTGAGCACCATCACTAGATCAATTCTCATTGCAAATGTCATGTTTATTATCTTGTTGGTGGACCTGCAGCCAATTTTGGGTCAAGAAGAAGAGAACGAGGTAGCGGAGAGGTTTGAGGTGATGTTGTGTGGTGGAGAAATGCGTGAGATGAGGATTGTGTCCGATATTTCACTTCGCACCGGTTGCTCGATCTGAAGCATTTTCGGATTTGTGATTCTATTTTGAACATTTGTGTTGTGGTACTGAAATTTCCGAGATTTCAGAAAAACTTTTTAAAATAATTCGAACTAATTTTAGCCAAATCTAAACAAATTTGGACCAAATTCAAAAAAAGAGAAAAAATTTGAAAATTATGACGAAATATTTTGGTGTCCGGTGAGGGTCCGAAATTTCGGGAATTCCGAACGAAAATTATAAACATTGTGCATGGGAGTTTAATTACGGGGATGGGAATTTATCCTCATGACTCCCTGCCTTTCAATACGCTGGGGGAATTGGGAGGAAATTCATCTTCACTTAAAATCTAATTTCCTTCTATACTACGTAAGACTATCGGATTGAATCCAATAAACTTCTAAACTGCCTAAGATATCTGTCCAAAATTAGAGATAAATTAGCAACACCATACCAAACCAACCAAAATGACAAATTAATTCTCAGTCCAAAATTACATGCATGGACAGTGCAGCAACAACCGGCATCCATGAATCCATAAACCGAGAGTGGCCAAACAGCTGCTACTTCACCTGCACTGCAACTTCTTGCGAATCCTTAACCCTCTGAATCTGATAGGTTGTCAAGATAATCTTGCATTTGTGGCTTTGACACGACGACGATGACGAACACTGCCTGATTCTGATGGAGCAGAAGCTGCCATTTCCCGATGGGCACAGCAAGCTATTCGACCGAGGAATCTCTACCTTCGCTGCCGATGCAACCTCTTGCACCGGCAGCAAGCTGGTCGTCGGTGCCGAGGAGAAGCCCTTCTCAATGTTGATGTTATTCCAATACACTCCTATAATCGATAATATTGTAAGCTAATATATTGACGTGCAATTCTTTTACGTCTTCGCGAAAAACCGGTAATGTCGTAAGGAAATGCCCCCAAAAGCTCCCACGTGTTCACCCTTCCAACCTCTTACAGGCTAGATGTTGAAGAAGCATCCTGGGCCGTTGGATATCAATCCAACGCCTAGCAGTAGTCGATCGAGTAGACATTGACTTGGGCCGTGCCCGGCCCGGCCCATCGTGCTTCGTGCCAAAACGGGCCGTGCCGGAACAACCCCCCACCACGGCGGCGGCGGCGGCGGCGCCA
>RufJiangYong
CGGGTGATCAGGACGAGCAGGCCTCCGGAACTCCGTCCAGTTGCGTACCTGCATGGGTAGGCGGGCGATCAAGTTTTTGGGGAGCGCTCTTGGGCGCGACTGCTCCTGTTCGACAACGGTTCTACACTGCTACATCTTCGCCAACATGTCGACGGACAACACCAACACTCGCACTGGCACTGGAAAGCCTCAACTAGTACATGAGCGTTCTCAGGGTATATGTCCATTCCCTTACCGTTAATTATGCTGCTAGAAGATTTTTCTGTTAATGCTTATCGCAATGTTACAATTGCGTTACTATGTGAATGTTATACTTATTTTATGAAAAGCATGCTCATGCTGAGCACCATCACTAGATCAATTCTCATTGCAAATGTCATGTTTATTATCTTGTTGGTGGACCTGCAGCCAATTTTGGGTCAAGAAGAAGAGAACGAGGTAGCGGAGAGGTTTGAGGTGATGTTGTGTGGTGGAGAAATGCGTGAGATGAGGATTGTGTCCGATATTTCACTTCGCACCGGTTGCTCGATCTGAAGCATTTTCGGATTTGTGATTCTATTTTGAACATTTGTGTTGTGGTACTGAAATTTCCGAGATTTCAGAAAAACTTTTTAAAATAATTCGAACTAATTTTAGCCAAATCTAAACAAATTTGGACCAAATTCAAAAAAAGAGAAAAAATTTGAAAATTATGACGAAATATTTTGGTGTCCGGTGAGGGTCCGAAATTTCGGGAATTCCGAACGAAAATTATAAACATTGTGCATGGGAGTTTAATTACGGGGATGGGAATTTATCCTCATGACTCCCTGCCTTTCAATACGCTGGGGGAATTGGGAGGAAATTCATCTTCACTTAAAATCTAATTTCCTTCTATACTACGTAAGACTATCGGATTGAATCCAATAAACTTCTAAACTGCCTAAGATATCTGTCCAAAATTAGAGATAAATTAGCAACACCATACCAAACCAACCAAAATGACAAATTAATTCTCAGTCCAAAATTACATGCATGGACAGTGCAGCAACAACCGGCATCCATGAATCCATAAACCGAGAGTGGCCAAACAGCTGCTACTTCACCTGCACTGCAACTTCTTGCGAATCCTTAACCCTCTGAATCTGATAGGTTGTCAAGATAATCTTGCATTTGTGGCTTTGACACGACGACGATGACGAACACTGCCTGATTCTGATGGAGCAGAAGCTGCCATTTCCCGATGGGCACAGCAAGCTATTCGACCGAGGAATCTCTACCTTCGCTGCCGATGCAACCTCTTGCACCGGCAGCAAGCTGGTCGTCGGTGCCGAGGAGAAGCCCTTCTCAATGTTGATGTTATTCCAATACACTCCTATAATCGATAATATTGTAAGCTAATATATTGACGTGCAATTCTTTTACGTCTTCGCGAAAAACCGGTAATGTCGTAAGGAAATGCCCCCAAAAGCTCCCACGTGTTCACCCTTCCAACCTCTTACAGGCTAGATGTTGAAGAAGCATCCTGGGCCGTTGGATATCAATCCAACGCATAGCAGTAGTCGACCGAGTAGACATTGACTTGGGCCGTGCCCGGCCCGGCCCATCGTGCTTCGTGCCAAAACGGGCCGTGCCGGAACAACCCCCCACCACGGCGGCGGCGGCGGCGGCGCCA
>RufLiuJiang
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>IndBinulawan
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>IndNanjing11
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>IndSuwon331
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>IndRathuwee
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>IndMilyang54
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>IndPeta
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>IndMilyang23
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>IndTeqing
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>IndMinghui63
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>IndXiangzaoxian24
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>Jpn2426B
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>JpnBalila
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>JpnIM359
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>JpnQiuguang
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>JpnP002
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>JpnCPSL017
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>JpnIM273
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>JpnRosemont
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>JpnZhonghua11
CGGGTGATCAGGACGAGCAGGCCTCCGGAACTCCGTCCAGTTGCGTACCTGCATGGGTAGGCGGGCGATCAAGTTTTTGGGGAGCGCTCTTGGGCGCGACTGCTCCTGTTCGACAACGGTTCTACACTGCTACATCTTCGCCAACATGTCGACGGACAACACCAACACTCGCACTGGCACTGGAAAGCCTCAACTAGTACATGAGCGTTCTCAGGGTATATGTCCATTCCCTTACCGTTAATTATGCTGCTAGAAGATTTTTCTGTTAATGCTTATCGCAATGTTACAATTGCGTTACTATGTGAATGTTATACTTATTTTATGAAAAGCATGCTCATGCTGAGCACCATCACTAGATCAATTCTCATTGCAAATGTCATGTTTATTATCTTGTTGGTGGACCTGCAGCCAATTTTGGGTCAAGAAGAAGAGAACGAGGTAGCGGAGAGGTTTGAGGTGATGTTGTGTGGTGGAGAAATGCGTGAGATGAGGATTGTGTCCGATATTTCACTTCGCACCGGTTGCTCGATCTGAAGCATTTTCGGATTTGTGATTCTATTTTGAACATTTGTGTTGTGGTACTGAAATTTCCGAGATTTCAGAAAAACTTTTTAAAATAATTCGAACTAATTTTAGCCAAATCTAAACAAATTTGGACCAAATTCAAAAAAAGAGAAAAAATTTGAAAATTATGACGAAATATTTTGGTGTCCGGTGAGGGTCCGAAATTTCGGGAATTCCGAACGAAAATTATAAACATTGTGCATGGGAGTTTAATTACGGGGATGGGAATTTATCCTCATGACTCCCTGCCTTTCAATACGCTGGGGGAATTGGGAGGAAATTCATCTTCACTTAAAATATAATTTCCTTCTATACTACGTAAGACTATCGGATTGAATCCAATAAACTTCTAAACTGCCTAAGATATCTGTCCAAAATTAGAGATAAATTAGCAACACCATACCAAACCAACCAAAATGACAAATTAATTCTCAGTCCAAAATTACATGCATGGACAGTGCAGCAACAACCGGCATCCATGAATCCATAAACCGAGAGTGGCCAAACAGCTGCTACTTCACCTGCACTGCAACTTCTTGCGAATCCTTAACCCTCTGAATCTGATAGGTTGTCAAGATAATCTTGCATTTGTGGCTTTGACACGACGACGATGACGAACACTGCCTGATTCTGATGGAGCAGAAGCTGCCATTTCCCGATGGGCACAGCAAGCTATTCGACCGAGGAATCTCTACCTTCGCTGCCGATGCAACCTCTTGCACCGGCAGCAAGCTGGTCGTCGGTGCCGAGGAGAAGCCCTTCTCAATGTTGATGTTATTCCAATACACTCCTATAATCGATAATATTGTAAGCTAATATATTGACGTGCAATTCTTTTACGTCTTCGCGAAAAACCGGTAATGTCGTAAGGAAATGCCCCCAAAAGCTCCCACGTGTTCACCCTTCCAACCTCTTACAGGCTAGATGTTGAAGAAGCATCCTGGGCCGTTGGATATCAATCCAACGCATAGCAGTAGTCGACCGAGTAGACATTGACTTGGGCCGTGCCCGGCCCGGCCCATCGTGCTTCGTGCCAAAACGGGCCGTGCCGGAACAACCCCCCACCACGGCGGCGGCGGCGGCGGCGCCA
>JpnTaibei309
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2. TMS5 gene sequence of different materials:
Aro, Aromatic
>RufChangjiang1068
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>NivNepalNWR
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>RufAnren
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>RufChaling
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>RufDongxiang
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>rufGongguan
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>RufHainan
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>RufJiangyong
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>RufLiujiang
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>IndBinulawan
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>IndChau
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>IndChhoteDhan
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>IndLalaman
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>IndKalukantha
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>Ind9311
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>IndShuhui527
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>IndSuwon331
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>IndMilyang54
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>IndPeta
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>IndMiyang23
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>IndTeqing
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>IndMinghui63
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>IndXiangzaoxian24
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>IndZhenshan97
ATGGCGAACAGCGGCAAGTCATCGCCGGCGGCGACCTCCACCACCGCGCCGCCACCGGGTCGGCCGAAGGCGAAGGCGCCGCCCCTCACCGTCGAGGGCTACCCCGTGGAGGGCATCTCCATCGGCGGGCAGGAGACCTGCGTCATCTTCCCGACGCTGAGCGCCGCCTTCGACATCGGCCGGTGCCCGCAGCGCGCCGTCTCGCAGGAGTTCCTCTTCATCTCCCACGCCCACCTCGACCACATCGGCGGCCTCCCCATGTACGTCGCCACCCGGGGCCTCTACCGGCAGCGCCCGCCCACCATCTTCATCCCCGCCTGCCTCAGGGACCCCGTGGAGCGCCTCTTCGAGCTCCACCGCTCCATGGACCAGTCCGAGCTCAGCCACAACCTCGTCCCCCTCGAGATTGGTCAGGAGCACGAGCTCAGGAGGGACCTCAAGGTGAAGGCCTTCAAGACCTACCACGCCATTCCCAGCCAGGTGAAGGGTTCATCAGTTCTTGGTTGTTCTGGATGAATTATTCTTGATTGATTGATTTGGTCGGAAATGTGTGGTGAATTTGGTTGAGATGTGATGTGATTGTAGGGGTATGTGATATACACGGTGAAGCAAAAGCTCAAGCCAGAGTATCTTGGCCTCCCTGGGAGCGAGATCAAGCAGCTGAAGCTGTCAGGTGTGGAGGTCTGTTGTTGTTTTTTTTTTTTTTTGATATTGTGGATGTCTGGATGAAATGGAATACAATTCACAATTTAGTGATGTTGTTGATGCTGTGCGTGGTTCTGTTTTTCAGATTACGAATACATTGACGGTGCCTGAGATTGCTTTTACCGGAGATACGATGGCAGATTTCATTCTTGATCCTGATAATGCGGATGTTTTGAAGGCGAAAATTCTTGTAGTGGAGGTATTGCTTCTTATCGTCTATATGGTTAATTTGTTGTCAATTGTCATTGTTGCTATTCAGCCTGAGAAAAAAAAAAGAGGGAAACTGTTTCTTCAAGCACGGATATCAGTATATTACCAAGATTAATTTTATCAACAGAAGGAAAAGCAACAGCCTTTGCTTTTCAGGAGAGATTGATTCCAACTCCATATTAACTGATAACTGAGTACCATTTTTTCAAACTAAAACCTTTGCAGAACCAATTGGCAGCAATTAGTGGGAACTATGTTGCCTGAAGCATGTTTCAGTTTCCATACTGAATATTTATTGTCCTTCTCCTGACGAAATTTTAATTATCTCCAAATTTAACTTAGTGAACTGTGTTCTGGAAATTGCAGAGTACTTTTGTTGATGACTCTGTTACAATTGAGCATGCAAGAGAATATGGGCACACCCATCTGTTTGAGGTTATTCCCAAATTTTGCTTATTTCATATTTCTGTGGAAGAAAAACATTTCACCTAGCATTGCTAATTTTGCCCATTATC.TTTTTTTTATGTATGCAGATACTGAATCAGTGTGACAAACTTGAAAACAAAGCTATTCTGCTAATCCACTTTTCTGCTCGTTATACCGCAGAGGTGAGCTATCTCTGTTGTAATCCAATTTTACTTATATCATTTTATCCTGATTCAATTAGTAATCTGTATGCTTTGTTTCAACTCTGTGGATTTATTTTTTGTTTCAAGCAAGTTTCACCAATATTGTTATTTTTTAATGCCATCATTATGAGCAGGCAAAATGTGCCCACTTTTCTTGTAGCATCCTCCTTTCCTCTTAAAAGTACACATGTTTGTGTTTCATTCTTTACAAATAAATACATTTATCTTCAATTTTTTTCTCACCATCATTAAACATTTCATCA
>JpnLiaoxing1B
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>JpnNorin20
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>JpnMansaku
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>JpnGotakGatik
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>JpnKhaoHawm
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>JpnDalijing
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>JpnPC311
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>JpnC418
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>JpnLunhui42
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>JpnNipponbare
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>JpnZhengxuan2
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>Jpn2426B
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>Jpn2464B
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>JpnKoshihikari
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>JpnTaHungKu
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>JpnHeuKgyeong
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>JpnLukTakhar
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>JpnKotobukiMochi
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>JpnAizinuo
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>JpnBalila
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>JpnIM359
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>JpnQiuguang
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>JpnLemont
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>JpnP002
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>JpnCPSL017
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>JpnBarizao
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>JpnAkihikari
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>JpnD16
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>JpnIM273
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>JpnRosemont
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>JpnZhonghua11
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>JpnTaibei309
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>AroARC13829
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>AroBasmati217
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>AroJC101
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>AroPankhari203
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>AroDA13
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>AroKitrana508
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>AroMehr
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>AroBicoBranco
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>AusFR13A
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>AusBhadoia233
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>AusKALAMKATI
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>AusT1
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3. TMS5 3'-flanking sequence of different materials:
>RufChangjiang1068
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>NivNepelNWR
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>RufAnren
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>RufChaling
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>RufDongxiang
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>RufHainan
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>RufJiangyong
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>RufLiujiang
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>IndBinulawan
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>IndChau
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>IndChhoteDhan
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>IndLalaman
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>IndKalukantha
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>Ind9311
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>IndGuangluai4
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>IndNanjing3
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>IndShuhui527
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>IndKhaoDawkMali
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>IndTaichungnative1
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>IndNanjing11
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>IndSuwon331
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>IndRathuwee
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>IndMilyang54
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>IndPeta
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>IndMilyang23
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>IndTeqing
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>IndMinghui63
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>IndXiangzaoxian24
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>JpnNorin20
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>JpnMansaku
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>JpnGotakGatik
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>JpnKhaoHawm
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>JpnDalijing
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>JpnPC311
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>JpnLunhui42
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>JpnNipponbare
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>Jpn2426B
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>JpnTaibei309
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