The use of antibiotic resistogram profiles as an epidemiological tool for source trace back of Brucella infection in Egypt

Ragab A. Azzam*1, Ashraf E. Sayour2

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Ashraf Sayour

Table 0: Epidemiological markers(revealed by antibiotic resistogram patternsof 42Brucellamelitensis biovar 3 field isolates from different animal hosts and various localities in 11 governorates

Governorates / Matrouh / Alexandria / Behira / Kafr El-Sheikh / Sharkia / Ismailia / Monofia / Giza / Fayoum / Bani-Suef / Assuit
Areas / - / Nobaria / Kafr El-Dawwar / Sakha / Mahallet Mousa / Mahallet Mousa / Zagazig / Salhia / Salhia / Salhia / - / Quesna / Quesna / Quesna / Quesna / Toukh / Menouf / Toukh / El-Saf / El-Saf / Oseem / Oseem / Oseem / Oseem / Oseem / Oseem / Oseem / El-Saf / El-Rayyan / Quaroun / El-Wasta / Bani Suef / Ehnasia / Ehnasia / Ehnasia / Ehnasia / Ehnasia / El-Fashn / El-Fashn / Bani Sanad / Bani Sanad / Bani Sanad
Hosts / Sh / Ca / Ca / Sh / Sh / Sh / Ca / Go / Go / Go / Ca / Sh / Ca / Ca / Sh / Ca / Ca / Ca / Ca / Ca / Sh / Sh / Sh / Sh / Go / Go / Sh / Ca / Ca / Ca / Ca / Ca / Ca / Ca / Ca / Ca / Ca / Ca / Sh / Bu / Bu / Ca
Years / 00 / 02 / 00 / 00 / 00 / 98 / 08 / 07 / 07 / 07 / 98 / 07 / 07 / 07 / 07 / 07 / 95 / 95 / 05 / 06 / 06 / 06 / 06 / 06 / 06 / 06 / 07 / 08 / 00 / 98 / 07 / 07 / 06 / 06 / 06 / 06 / 06 / 02 / 02 / 07 / 07 / 07
Isolate serial # / 1 / 2 / 3 / 4 / 5 / 6 / 7 / 8 / 9 / 10 / 11 / 12 / 13 / 14 / 15 / 16 / 17 / 18 / 19 / 20 / 21 / 22 / 23 / 24 / 25 / 26 / 27 / 28 / 29 / 30 / 31 / 32 / 33 / 34 / 35 / 36 / 37 / 38 / 39 / 40 / 41 / 42
Antibiotics / Antibiotic resistogram patterns expressed as diameter of antibiotic inhibition zone in millimeters
Penicillin 5 / 0 / 0 / 9 / 8 / 0 / 0 / 9 / 0 / 8 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 9 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 9 / 0
Ampicillin 10 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0
Sublactam/ Ampicillin 10 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0
Amoxicillin 10 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 15 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0
Cephradine 10 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 13 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 10 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0
Cefuroxime 10 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0
Ceftazidime 10 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0
Cefoperazone 10 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0
Cefotaxime 10 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0
Cefepime 10 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 12 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0
Erythromycin 10 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 15 / 0 / 15 / 0 / 0 / 0 / 0 / 9 / 0 / 30 / 0 / 20 / 18 / 0 / 0 / 15 / 0 / 0 / 14 / 0 / 0 / 0 / 25 / 0 / 0 / 0 / 0 / 9 / 15 / 0 / 0 / 22 / 0 / 0
Azithromycin 10 / 0 / 0 / 0 / 0 / 8 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 11 / 0 / 14 / 0 / 15 / 0 / 25 / 0 / 11 / 0 / 0 / 25 / 14 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0
Neomycin 10 / 15 / 8 / 15 / 12 / 10 / 0 / 0 / 15 / 13 / 11 / 12 / 20 / 8 / 8 / 8 / 12 / 0 / 20 / 8 / 10 / 0 / 15 / 10 / 0 / 13 / 18 / 10 / 11 / 15 / 15 / 13 / 13 / 10 / 18 / 8 / 0 / 12 / 11 / 12 / 12 / 9 / 13
Streptomycin 2.5 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 14 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0
Amikacin 50 / 15 / 12 / 0 / 15 / 0 / 0 / 0 / 15 / 0 / 12 / 0 / 20 / 8 / 8 / 8 / 12 / 0 / 0 / 10 / 0 / 12 / 0 / 15 / 8 / 10 / 0 / 0 / 0 / 10 / 0 / 12 / 10 / 15 / 12 / 8 / 0 / 0 / 0 / 0 / 10 / 12 / 0
Lincomycin / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0
Clindamycin 15 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0
Meropenem 5 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0
Ciprofloxacin / 10 / 14 / 14 / 12 / 16 / 12 / 15 / 14 / 9 / 13 / 9 / 10 / 10 / 15 / 11 / 12 / 10 / 15 / 15 / 16 / 14 / 15 / 13 / 11 / 16 / 13 / 15 / 10 / 13 / 15 / 10 / 13 / 13 / 13 / 15 / 10 / 10 / 14 / 14 / 10 / 12 / 10 / 12
20 / 15 / 14 / 13 / 17 / 13 / 15 / 15 / 15 / 16 / 10 / 11 / 15 / 17 / 13 / 15 / 12 / 16 / 16 / 16 / 14 / 15 / 15 / 12 / 17 / 15 / 17 / 11 / 14 / 13 / 14 / 15 / 18 / 13 / 16 / 15 / 11 / 14 / 14 / 12 / 12 / 11 / 13
30 / 16 / 15 / 16 / 18 / 17 / 15 / 16 / 16 / 20 / 18 / 15 / 16 / 20 / 20 / 18 / 18 / 17 / 19 / 18 / 15 / 16 / 16 / 15 / 18 / 17 / 17 / 11 / 16 / 15 / 16 / 17 / 22 / 14 / 18 / 18 / 11 / 15 / 15 / 12 / 12 / 16 / 15
40 / 17 / 15 / 18 / 21 / 17 / 16 / 16 / 19 / 25 / 16 / 15 / 16 / 20 / 22 / 20 / 20 / 17 / 19 / 18 / 17 / 17 / 17 / 16 / 18 / 18 / 18 / 13 / 17 / 20 / 17 / 20 / 23 / 18 / 18 / 20 / 15 / 15 / 16 / 13 / 12 / 18 / 18
50 / 20 / 16 / 20 / 16 / 18 / 16 / 18 / 23 / 23 / 22 / 16 / 16 / 25 / 25 / 22 / 23 / 20 / 20 / 21 / 19 / 18 / 17 / 17 / 21 / 20 / 18 / 15 / 19 / 22 / 22 / 25 / 25 / 23 / 20 / 20 / 15 / 16 / 16 / 13 / 15 / 20 / 22
Levofloxacin / 10 / 10 / 12 / 16 / 12 / 30 / 17 / 10 / 15 / 12 / 25 / 10 / 14 / 14 / 8 / 15 / 12 / 9 / 12 / 14 / 9 / 11 / 12 / 10 / 12 / 13 / 16 / 12 / 15 / 17 / 14 / 10 / 13 / 14 / 15 / 10 / 10 / 10 / 12 / 12 / 12 / 13 / 12
20 / 18 / 13 / 16 / 17 / 14 / 12 / 12 / 14 / 13 / 12 / 10 / 13 / 20 / 9 / 12 / 12 / 11 / 13 / 16 / 11 / 13 / 14 / 11 / 13 / 13 / 16 / 12 / 15 / 19 / 15 / 15 / 14 / 20 / 15 / 13 / 16 / 12 / 13 / 13 / 14 / 11 / 15
30 / 17 / 17 / 20 / 20 / 20 / 13 / 14 / 18 / 15 / 12 / 15 / 14 / 22 / 15 / 15 / 18 / 12 / 15 / 17 / 13 / 15 / 16 / 13 / 15 / 14 / 17 / 15 / 17 / 19 / 15 / 16 / 16 / 23 / 16 / 15 / 15 / 12 / 16 / 14 / 14 / 14 / 15
40 / 18 / 18 / 17 / 22 / 18 / 18 / 15 / 19 / 15 / 20 / 18 / 15 / 25 / 15 / 16 / 20 / 13 / 17 / 19 / 14 / 16 / 16 / 15 / 16 / 16 / 17 / 18 / 17 / 20 / 15 / 22 / 16 / 20 / 16 / 18 / 18 / 14 / 13 / 18 / 18 / 22 / 16
50 / 20 / 14 / 20 / 22 / 15 / 20 / 18 / 20 / 20 / 20 / 24 / 18 / 25 / 16 / 25 / 25 / 15 / 19 / 20 / 17 / 20 / 17 / 16 / 19 / 18 / 19 / 22 / 17 / 22 / 17 / 25 / 16 / 23 / 16 / 20 / 18 / 16 / 22 / 22 / 20 / 23 / 17
Vancomycin / 0 / 0 / 0 / 0 / 10 / 8 / 0 / 0 / 8 / 10 / 0 / 0 / 8 / 8 / 8 / 8 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 0 / 10 / 10 / 0 / 8 / 0 / 0 / 12 / 0 / 8 / 8 / 8 / 0

Ca: Cattle, Bu: Buffalo, Sh: Sheep, Go: Goat

Table 1: Epidemiological characterization of 42 Brucellamelitensis biovar 3 field isolates from different animal hosts in11 governorates by comparison of their antibiotic resistogram patterns using the correlation coefficient (rounded to 2 digits)

Governorates / Matrouh / Alex / Behira / Kafr El-Sheikh / Sharkia / Ismailia / Monofia / Giza / Fayoum / Bani Suef / Assuit
1 / 2 / 3 / 4 / 5 / 6 / 7 / 8 / 9 / 10 / 11 / 12 / 13 / 14 / 15 / 16 / 17 / 18 / 19 / 20 / 21 / 22 / 23 / 24 / 25 / 26 / 27 / 28 / 29 / 30 / 31 / 32 / 33 / 34 / 35 / 36 / 37 / 38 / 39 / 40 / 41 / 42
Matrouh / 1 / 1 / 0.97 / 0.91 / 0.97 / 0.79 / 0.78 / 0.85 / 0.98 / 0.83 / 0.84 / 0.84 / 0.91 / 0.95 / 0.91 / 0.93 / 0.93 / 0.86 / 0.67 / 0.97 / 0.76 / 0.84 / 0.88 / 0.99 / 0.8 / 0.98 / 0.79 / 0.84 / 0.89 / 0.98 / 0.93 / 0.71 / 0.89 / 0.98 / 0.96 / 0.96 / 0.85 / 0.8 / 0.93 / 0.89 / 0.81 / 0.92 / 0.93
Alex / 2 / 0.97 / 1 / 0.9 / 0.97 / 0.84 / 0.83 / 0.89 / 0.97 / 0.82 / 0.86 / 0.83 / 0.88 / 0.96 / 0.91 / 0.93 / 0.92 / 0.9 / 0.66 / 0.99 / 0.76 / 0.87 / 0.87 / 0.98 / 0.83 / 0.98 / 0.79 / 0.84 / 0.91 / 0.97 / 0.91 / 0.69 / 0.89 / 0.97 / 0.95 / 0.96 / 0.88 / 0.8 / 0.92 / 0.88 / 0.8 / 0.92 / 0.93
Behira / 3 / 0.91 / 0.9 / 1 / 0.92 / 0.88 / 0.83 / 0.92 / 0.91 / 0.9 / 0.83 / 0.88 / 0.79 / 0.93 / 0.87 / 0.91 / 0.88 / 0.88 / 0.74 / 0.93 / 0.78 / 0.77 / 0.91 / 0.88 / 0.76 / 0.93 / 0.83 / 0.89 / 0.94 / 0.95 / 0.97 / 0.66 / 0.85 / 0.91 / 0.91 / 0.93 / 0.88 / 0.82 / 0.96 / 0.93 / 0.75 / 0.9 / 0.97
Kafr El-Sheikh / 4 / 0.97 / 0.97 / 0.92 / 1 / 0.79 / 0.81 / 0.9 / 0.95 / 0.84 / 0.82 / 0.84 / 0.87 / 0.94 / 0.89 / 0.92 / 0.91 / 0.87 / 0.68 / 0.97 / 0.74 / 0.85 / 0.86 / 0.97 / 0.8 / 0.96 / 0.77 / 0.84 / 0.88 / 0.96 / 0.9 / 0.68 / 0.86 / 0.96 / 0.93 / 0.96 / 0.86 / 0.78 / 0.92 / 0.89 / 0.79 / 0.94 / 0.91
5 / 0.79 / 0.84 / 0.88 / 0.79 / 1 / 0.85 / 0.81 / 0.83 / 0.8 / 0.88 / 0.77 / 0.7 / 0.87 / 0.81 / 0.87 / 0.81 / 0.81 / 0.6 / 0.86 / 0.73 / 0.71 / 0.87 / 0.79 / 0.76 / 0.85 / 0.84 / 0.8 / 0.92 / 0.87 / 0.88 / 0.67 / 0.86 / 0.82 / 0.86 / 0.83 / 0.81 / 0.8 / 0.86 / 0.88 / 0.71 / 0.82 / 0.87
6 / 0.78 / 0.83 / 0.83 / 0.81 / 0.85 / 1 / 0.88 / 0.79 / 0.8 / 0.8 / 0.78 / 0.64 / 0.89 / 0.83 / 0.89 / 0.82 / 0.89 / 0.57 / 0.87 / 0.7 / 0.78 / 0.78 / 0.79 / 0.77 / 0.83 / 0.71 / 0.8 / 0.84 / 0.84 / 0.83 / 0.67 / 0.79 / 0.81 / 0.81 / 0.86 / 0.87 / 0.79 / 0.87 / 0.87 / 0.7 / 0.83 / 0.85
Sharkia / 7 / 0.85 / 0.89 / 0.92 / 0.9 / 0.81 / 0.88 / 1 / 0.84 / 0.88 / 0.77 / 0.83 / 0.68 / 0.92 / 0.88 / 0.91 / 0.85 / 0.97 / 0.68 / 0.93 / 0.78 / 0.84 / 0.84 / 0.85 / 0.84 / 0.89 / 0.75 / 0.84 / 0.89 / 0.88 / 0.89 / 0.64 / 0.83 / 0.87 / 0.83 / 0.92 / 0.91 / 0.79 / 0.92 / 0.86 / 0.7 / 0.89 / 0.91
8 / 0.98 / 0.97 / 0.91 / 0.95 / 0.83 / 0.79 / 0.84 / 1 / 0.84 / 0.89 / 0.85 / 0.91 / 0.94 / 0.92 / 0.94 / 0.95 / 0.86 / 0.67 / 0.97 / 0.75 / 0.83 / 0.87 / 0.98 / 0.79 / 0.98 / 0.79 / 0.85 / 0.9 / 0.98 / 0.94 / 0.71 / 0.9 / 0.97 / 0.96 / 0.97 / 0.84 / 0.79 / 0.92 / 0.89 / 0.8 / 0.93 / 0.94
9 / 0.83 / 0.82 / 0.9 / 0.84 / 0.8 / 0.8 / 0.88 / 0.84 / 1 / 0.77 / 0.92 / 0.7 / 0.87 / 0.9 / 0.89 / 0.91 / 0.87 / 0.87 / 0.86 / 0.9 / 0.86 / 0.83 / 0.82 / 0.84 / 0.87 / 0.74 / 0.91 / 0.85 / 0.86 / 0.9 / 0.78 / 0.85 / 0.81 / 0.86 / 0.89 / 0.88 / 0.95 / 0.89 / 0.86 / 0.86 / 0.86 / 0.9
10 / 0.84 / 0.86 / 0.83 / 0.82 / 0.88 / 0.8 / 0.77 / 0.89 / 0.77 / 1 / 0.76 / 0.79 / 0.88 / 0.85 / 0.91 / 0.88 / 0.78 / 0.57 / 0.87 / 0.65 / 0.74 / 0.76 / 0.87 / 0.71 / 0.88 / 0.7 / 0.77 / 0.82 / 0.88 / 0.85 / 0.63 / 0.83 / 0.86 / 0.89 / 0.86 / 0.77 / 0.76 / 0.82 / 0.86 / 0.74 / 0.89 / 0.84
Ismailia / 11 / 0.84 / 0.83 / 0.88 / 0.84 / 0.77 / 0.78 / 0.83 / 0.85 / 0.92 / 0.76 / 1 / 0.73 / 0.87 / 0.82 / 0.87 / 0.93 / 0.83 / 0.88 / 0.87 / 0.92 / 0.89 / 0.84 / 0.82 / 0.84 / 0.87 / 0.75 / 0.99 / 0.86 / 0.87 / 0.89 / 0.81 / 0.77 / 0.84 / 0.82 / 0.88 / 0.92 / 0.92 / 0.91 / 0.89 / 0.92 / 0.84 / 0.89
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Assuit / 40 / 0.81 / 0.8 / 0.75 / 0.79 / 0.71 / 0.7 / 0.7 / 0.8 / 0.86 / 0.74 / 0.92 / 0.71 / 0.82 / 0.75 / 0.8 / 0.9 / 0.71 / 0.85 / 0.8 / 0.88 / 0.91 / 0.71 / 0.79 / 0.82 / 0.8 / 0.64 / 0.93 / 0.74 / 0.81 / 0.77 / 0.84 / 0.73 / 0.81 / 0.81 / 0.79 / 0.85 / 0.92 / 0.78 / 0.81 / 1 / 0.79 / 0.77
41 / 0.92 / 0.92 / 0.9 / 0.94 / 0.82 / 0.83 / 0.89 / 0.93 / 0.86 / 0.89 / 0.84 / 0.82 / 0.95 / 0.92 / 0.95 / 0.95 / 0.85 / 0.65 / 0.93 / 0.71 / 0.82 / 0.81 / 0.93 / 0.77 / 0.93 / 0.73 / 0.83 / 0.85 / 0.92 / 0.88 / 0.71 / 0.87 / 0.92 / 0.91 / 0.94 / 0.84 / 0.8 / 0.88 / 0.91 / 0.79 / 1 / 0.89
42 / 0.93 / 0.93 / 0.97 / 0.91 / 0.87 / 0.85 / 0.91 / 0.94 / 0.9 / 0.84 / 0.89 / 0.81 / 0.95 / 0.93 / 0.94 / 0.91 / 0.93 / 0.74 / 0.96 / 0.83 / 0.81 / 0.93 / 0.91 / 0.81 / 0.97 / 0.85 / 0.89 / 0.96 / 0.97 / 1 / 0.7 / 0.9 / 0.93 / 0.94 / 0.96 / 0.9 / 0.86 / 0.97 / 0.93 / 0.77 / 0.89 / 1

Table 2: Epidemiological characterization of 42 Brucellamelitensis biovar 3 field isolates from different animal hosts in 11 governorates by comparison of their antibiotic resistogram patterns with those of selected reference Brucella strains using the correlation coefficient (rounded to 2 digits and multiplied by 100 to give an integer number)

Governorates / Matrouh / Alex / Behira / Kafr El-Sheikh / Sharkia / Ismailia / Monofia / Giza / Fayoum / Bani Suef / Assuit
1 / 2 / 3 / 4 / 5 / 6 / 7 / 8 / 9 / 10 / 11 / 12 / 13 / 14 / 15 / 16 / 17 / 18 / 19 / 20 / 21 / 22 / 23 / 24 / 25 / 26 / 27 / 28 / 29 / 30 / 31 / 32 / 33 / 34 / 35 / 36 / 37 / 38 / 39 / 40 / 41 / 42
Br. melitensis 16M / 84 / 84 / 93 / 85 / 79 / 83 / 87 / 84 / 83 / 73 / 81 / 71 / 86 / 82 / 85 / 80 / 85 / 65 / 87 / 71 / 70 / 84 / 81 / 69 / 87 / 76 / 81 / 87 / 88 / 91 / 59 / 78 / 83 / 84 / 87 / 81 / 75 / 91 / 86 / 66 / 82 / 91
Br. melitensis Ether / 86 / 85 / 94 / 87 / 79 / 84 / 89 / 87 / 86 / 76 / 84 / 73 / 88 / 85 / 87 / 84 / 86 / 68 / 88 / 74 / 72 / 86 / 84 / 71 / 89 / 77 / 83 / 88 / 89 / 93 / 63 / 80 / 85 / 85 / 90 / 83 / 77 / 92 / 88 / 69 / 86 / 93
Br. melitensis Rev.1 / 80 / 80 / 82 / 77 / 71 / 79 / 82 / 79 / 86 / 67 / 85 / 73 / 81 / 82 / 81 / 80 / 87 / 75 / 84 / 83 / 80 / 80 / 79 / 78 / 85 / 71 / 83 / 82 / 82 / 87 / 67 / 77 / 76 / 80 / 85 / 82 / 84 / 86 / 79 / 74 / 73 / 88
Br. abortus 2308 / 77 / 77 / 84 / 78 / 70 / 71 / 82 / 76 / 75 / 66 / 74 / 62 / 79 / 75 / 78 / 73 / 81 / 58 / 80 / 65 / 65 / 76 / 74 / 64 / 80 / 68 / 74 / 79 / 80 / 83 / 48 / 70 / 76 / 75 / 81 / 76 / 68 / 84 / 79 / 59 / 75 / 84
Br. abortus RB51 / 82 / 84 / 92 / 86 / 81 / 80 / 88 / 83 / 79 / 75 / 82 / 68 / 88 / 78 / 85 / 81 / 83 / 62 / 87 / 69 / 73 / 81 / 80 / 71 / 84 / 73 / 84 / 86 / 88 / 88 / 56 / 73 / 86 / 79 / 86 / 87 / 72 / 89 / 88 / 69 / 85 / 88
Br. suis 1330 / 65 / 68 / 71 / 67 / 72 / 67 / 72 / 65 / 79 / 56 / 81 / 56 / 69 / 64 / 68 / 71 / 72 / 76 / 71 / 94 / 79 / 83 / 64 / 91 / 69 / 84 / 82 / 83 / 69 / 72 / 89 / 75 / 66 / 64 / 70 / 80 / 78 / 73 / 68 / 77 / 63 / 73

Table 3: Epidemiological characterization of selected 6 reference Brucella strains by comparison of their antibiotic resistogram patterns using the correlation coefficient (rounded to 2 digits and multiplied by 100 to give an integer number)

Reference Brucella
Strains / Br. melitensis 16M / Br. melitensis Ether / Br. melitensis Rev.1 / Br. abortus 2308 / Br. abortus RB51 / Br. suis 1330
Br. melitensis 16M / 100 / 98 / 89 / 82 / 95 / 66
Br. melitensis Ether / 98 / 100 / 88 / 84 / 92 / 66
Br. melitensis Rev.1 / 89 / 88 / 100 / 74 / 80 / 75
Br. abortus 2308 / 82 / 84 / 74 / 100 / 82 / 54
Br. abortus RB51 / 95 / 92 / 80 / 82 / 100 / 65
Br. suis 1330 / 66 / 66 / 75 / 54 / 65 / 100