NIPGR ID / Chromosome / Gene IDs / Chromosome / Ks / Ka / Ka/Ks / MYA
CILEA-05 / 1 / AT5G53820.1 / 5 / 49,14 / 0,27 / 0,005 / 377,96
CILEA-12 / 2 / AT1G51900.1 / 1 / 4,66 / 0,93 / 0,200 / 35,87
2 / AT4G29440.1 / 4 / 8,14 / 1,05 / 0,129 / 62,65
2 / AT4G29440.2 / 4 / 5,22 / 1,10 / 0,210 / 40,18
2 / AT4G32350.1 / 4 / 11,52 / 1,00 / 0,087 / 88,58
ClLEA-13 / 2 / AT1G45688.1 / 1 / 53,54 / 0,45 / 0,008 / 411,88
2 / AT1G45688.2 / 1 / 54,26 / 0,43 / 0,008 / 417,37
ClLEA-14 / 2 / AT2G21490.1 / 2 / 3,93 / 0,78 / 0,199 / 30,21
ClLEA-17 / 2 / AT3G44380.1 / 3 / 2,80 / 0,19 / 0,068 / 21,53
ClLEA-25 / 3 / AT5G27980.1 / 5 / 12,32 / 0,34 / 0,027 / 94,75
ClLEA-29 / 4 / AT2G40170.1 / 2 / 3,98 / 0,12 / 0,031 / 30,64
4 / AT3G51810.1 / 3 / 3,40 / 0,13 / 0,037 / 26,18
ClLEA-32 / 5 / AT1G01470.1 / 1 / 8,29 / 0,22 / 0,027 / 63,81
ClLEA-41 / 6 / AT2G44060.1 / 2 / 5,57 / 0,14 / 0,025 / 42,87
6 / AT2G44060.2 / 2 / 5,57 / 0,14 / 0,025 / 42,87
ClLEA-46 / 7 / AT1G64450.1 / 1 / 6,78 / 0,21 / 0,032 / 52,19
ClLEA-48 / 8 / AT1G20450.2 / 1 / 4,30 / 0,64 / 0,149 / 33,10
8 / AT1G76180.1 / 1 / 95,48 / 0,36 / 0,004 / 734,43
8 / AT2G21490.1 / 2 / 50,45 / 1,49 / 0,030 / 388,09
ClLEA-49 / 8 / AT5G21130.1 / 5 / 46,24 / 0,87 / 0,019 / 355,70
8 / AT4G39745.1 / 4 / 46,24 / 0,87 / 0,019 / 355,71
ClLEA-55 / 9 / AT4G15910.1 / 4 / 43,40 / 0,61 / 0,014 / 333,85
ClLEA-58 / 9 / AT2G01080.1 / 2 / 26,00 / 0,19 / 0,007 / 199,98
ClLEA-71 / 11 / AT5G38760.1 / 5 / 32,79 / 0,16 / 0,005 / 252,19
ClLEA-72 / 11 / AT3G50980.1 / 3 / 57,44 / 0,52 / 0,009 / 441,83
11 / AT1G20440.1 / 1 / 26,67 / 1,09 / 0,041 / 205,16
Mean / 25,70 / 0,55 / 0,054 / 197,68
SupplementaryTable 7Calculated divergence times and Ka/Ks rates between watermelon and Arabidopsis, rice, soybean, grape, poplar, potato and maize using orthologous LEA gene pairs.
Oryza sativa- Citrullus lanatusNIPGR ID / Chromosome / Gene IDs / Chromosome / Ks / Ka / Ka/Ks / MYA
ClLEA-20 / 2 / LOC_Os03g09160.1 / 3 / 8,90 / 0,99 / 0,11 / 68,43
2 / LOC_Os07g44100.1 / 7 / 45,88 / 0,83 / 0,02 / 352,92
ClLEA-29 / 4 / LOC_Os05g28210.1 / 5 / 3,99 / 0,15 / 0,04 / 30,70
ClLEA-34 / 5 / LOC_Os03g07180.1 / 3 / 44,50 / 4,02 / 0,09 / 342,28
ClLEA-41 / 6 / LOC_Os03g62620.2 / 3 / 18,43 / 0,17 / 0,01 / 141,78
ClLEA-56 / 9 / LOC_Os03g53610.1 / 3 / 50,19 / 0,36 / 0,01 / 386,10
ClLEA-72 / 11 / LOC_Os01g50700.1 / 1 / 6,84 / 0,61 / 0,09 / 52,59
Mean / 25,53 / 1,02 / 0,05 / 196,40
Glysine max- Citrullus lanatus
NIPGR ID / Chromosome / Gene IDs / Chromosome / Ks / Ka / Ka/Ks / MYA
ClLEA-04 / 1 / Glyma.13G050000.2 / 13 / 21,86 / 0,17 / 0,008 / 168,18
1 / Glyma.19G040000.1 / 19 / 8,42 / 0,18 / 0,022 / 64,79
1 / Glyma.18G278700.1 / 18 / 4,53 / 0,22 / 0,049 / 34.81
ClLEA-05 / 1 / Glyma.13G050000.2 / 13 / 15,03 / 0,15 / 0,010 / 115,61
1 / Glyma.18G278700.1 / 18 / 2,52 / 0,20 / 0,078 / 19,36
1 / Glyma.19G040000.1 / 19 / 13,38 / 0,17 / 0,012 / 102,89
ClLEA-12 / 2 / Glyma.01G004100.1 / 1 / 62,58 / 0,88 / 0,014 / 481,35
2 / Glyma.02G043200.1 / 2 / 38,63 / 0,91 / 0,024 / 297,17
2 / Glyma.16G120200.1 / 16 / 56,91 / 0,87 / 0,015 / 437,79
2 / Glyma.01G004100.2 / 1 / 63,66 / 0,99 / 0,015 / 489,66
ClLEA-10 / 1 / Glyma.05G094300.1 / 5 / 2,55 / 2,90 / 1,138 / 19,61
1 / Glyma.17G172900.1 / 17 / 2,14 / 2,68 / 1,252 / 16.45
ClLEA-13 / 2 / Glyma.09G179400,1 / 9 / 48,79 / 0,43 / 0,009 / 375.32
2 / Glyma.05G242600.1 / 5 / 51,70 / 0,43 / 0,008 / 397,72
2 / Glyma.05G094300.1 / 5 / 53,95 / 0,43 / 0,008 / 415,03
2 / Glyma.07G099500.1 / 7 / 46,01 / 0,43 / 0,009 / 353,94
ClLEA-17 / 2 / Glyma.11G182400.1 / 11 / 5,69 / 0,13 / 0,023 / 43,76
ClLEA-20 / 2 / Glyma.02G274900.1 / 2 / 3,02 / 0,11 / 0,038 / 23,20
2 / Glyma.14G041100.1 / 14 / 2,99 / 0,12 / 0,039 / 23,01
2 / Glyma.20G052500.1 / 20 / 2,29 / 0,13 / 0,057 / 17,58
ClLEA-28 / 4 / Glyma.18G203500.1 / 18 / 7,80 / 0,11 / 0,014 / 59,99
4 / Glyma.07G152400.1 / 7 / 60,14 / 0,17 / 0,003 / 462,59
4 / Glyma.16G097900.1 / 16 / 61,69 / 0,12 / 0,002 / 474,55
ClLEA-29 / 4 / Glyma.01G119600.1 / 1 / 1,73 / 0,16 / 0,090 / 13,31
4 / Glyma.03G056000.1 / 3 / 2,04 / 0,16 / 0,080 / 15,67
4 / Glyma.16G097900.1 / 16 / 3,39 / 0,18 / 0,054 / 26,09
4 / Glyma.07G152400.1 / 7 / 41,97 / 0,39 / 0,009 / 322,84
ClLEA-32 / 5 / Glyma.18G238700.2 / 18 / 2,19 / 0,16 / 0,074 / 16,85
5 / Glyma.18G238700.1 / 18 / 2,14 / 0,17 / 0,079 / 16,44
5 / Glyma.16G031300.1 / 16 / 2,16 / 0,23 / 0,108 / 16,60
5 / Glyma.07G064700.1 / 7 / 2,10 / 0,18 / 0,087 / 16,18
ClLEA-35 / 5 / Glyma.08G184000.1 / 8 / 10,99 / 0,24 / 0,022 / 84,50
5 / Glyma.15G048800.1 / 15 / 47,77 / 0,26 / 0,005 / 367,47
ClLEA-41 / 6 / Glyma.20G044800.1 / 20 / 2,85 / 0,12 / 0,041 / 21,89
6 / Glyma.02G277300.1 / 2 / 3,46 / 0,12 / 0,034 / 26,64
6 / Glyma.14G037300.1 / 14 / 3,34 / 0,12 / 0,035 / 25,66
6 / Glyma.02G277300.2 / 2 / 3,47 / 0,12 / 0,033 / 26,68
ClLEA-42 / 7 / Glyma.20G216300.1 / 20 / 1,31 / 0,30 / 0,231 / 10,07
7 / Glyma.10G174100.1 / 10 / 2,17 / 0,32 / 0,149 / 16,69
ClLEA-46 / 7 / Glyma.08G023500.1 / 8 / 10,91 / 0,14 / 0,013 / 83,89
7 / Glyma.05G217500.1 / 5 / 11,07 / 0,15 / 0,014 / 85,13
ClLEA-49 / 8 / Glyma.14G041700.1 / 14 / 5,48 / 0,98 / 0,179 / 42,17
ClLEA-53 / 9 / Glyma.15G015800.1 / 15 / 1,37 / 0,15 / 0,109 / 10,55
ClLEA-58 / 9 / Glyma.08G184000.1 / 8 / 8,83 / 0,17 / 0,020 / 67,89
9 / Glyma.15G048800.1 / 15 / 9,04 / 0,17 / 0,019 / 69,53
ClLEA-71 / 11 / Glyma.18G278700.1 / 18 / 3,32 / 0,14 / 0,043 / 25,54
ClLEA-72 / 11 / Glyma.13G201300.1 / 13 / 2,64 / 0,46 / 0,173 / 20,28
11 / Glyma.12G235800.1 / 12 / 2,80 / 0,45 / 0,161 / 21,54
11 / Glyma.08G048900.1 / 8 / 51,51 / 0,65 / 0,013 / 396,20
Mean / 17,88 / 0,40 / 0,096 / 137,56
Vitis vinifera- Citrullus lanatus
NIPGR ID / Chromosome / Gene IDs / Chromosome / Ks / Ka / Ka/Ks / MYA
ClLEA-04 / 1 / GSVIVT01008194001 / 17 / 46,94 / 0,25 / 0,005 / 361,08
ClLEA-12 / 2 / GSVIVT01015396001 / 11 / 8,27 / 1,01 / 0,122 / 63,64
ClLEA-17 / 2 / GSVIVT01036107001 / 6 / 2,57 / 0,16 / 0,062 / 19,79
ClLEA-20 / 2 / GSVIVT01037488001 / 6 / 2,07 / 0,09 / 0,044 / 15,94
2 / GSVIVT01025868001 / 8 / 2,98 / 0,15 / 0,050 / 22,94
ClLEA-29 / 4 / GSVIVT01032796001 / 13 / 1,83 / 0,12 / 0,064 / 14,08
4 / GSVIVT01032795001 / 13 / 2,94 / 0,14 / 0,048 / 22,65
4 / GSVIVT01011188001 / 8 / 2,93 / 0,17 / 0,059 / 22,55
ClLEA-35 / 5 / GSVIVT01029690001 / 12 / 8,71 / 0,11 / 0,013 / 66,98
5 / GSVIVT01012274001 / 3 / 5,50 / 1,26 / 0,229 / 42,34
ClLEA-41 / 6 / GSVIVT01038264001 / 5 / 2,65 / 0,12 / 0,044 / 20,38
ClLEA-49 / 8 / GSVIVT01037448001 / 6 / 5,68 / 0,97 / 0,171 / 43,69
ClLEA-53 / 9 / GSVIVT01017064001 / 9 / 1,61 / 0,14 / 0,089 / 12,40
ClLEA-54 / 9 / GSVIVT01017248001 / 9 / 42,32 / 1,64 / 0,039 / 325,54
ClLEA-58 / 9 / GSVIVT01029690001 / 12 / 51,87 / 0,21 / 0,004 / 399,00
Mean / 12,59 / 0,44 / 0,070 / 96,87
Populus triocarpa- Citrullus lanatus
NIPGR ID / Chromosome / Gene IDs / Chromosome / Ks / Ka / Ka/Ks / MYA
ClLEA-04 / 1 / Potri.004G107500.1 / 4 / 4,12 / 0,15 / 0,037 / 31,68
Potri.004G107700.1 / 4 / 6,18 / 0,16 / 0,027 / 47,53
Potri.004G107100.1 / 4 / 6,18 / 0,16 / 0,027 / 47,53
Potri.004G107900.2 / 4 / 6,18 / 0,16 / 0,027 / 47,53
Potri.004G107900.1 / 4 / 6,18 / 0,16 / 0,027 / 47,53
Potri.004G107800.1 / 4 / 6,18 / 0,16 / 0,027 / 47,52
Potri.004G107300.1 / 4 / 5,22 / 0,16 / 0,031 / 40,13
Potri.017G108300.1 / 17 / 1,59 / 0,16 / 0,097 / 12,26
Potri.004G107600.1 / 4 / 3,88 / 0,41 / 0,106 / 29,82
ClLEA-05 / 1 / Potri.004G107500.1 / 4 / 16,51 / 0,14 / 0,008 / 127,01
Potri,004G107300.1 / 4 / 21,54 / 0,15 / 0,007 / 165,73
Potri.004G107700.1 / 4 / 22,31 / 0,15 / 0,007 / 171,64
Potri.004G107100.1 / 4 / 22,38 / 0,15 / 0,007 / 172,14
Potri.004G107900.1 / 4 / 22,41 / 0,15 / 0,007 / 172,41
Potri.004G107800.1 / 4 / 22,19 / 0,15 / 0,007 / 170,71
Potri.017G108300.1 / 17 / 2,59 / 0,14 / 0,056 / 19,91
Potri.017G108400.1 / 17 / 2,98 / 0,15 / 0,052 / 22,93
Potri.004G107600.1 / 4 / 6,58 / 0,40 / 0,061 / 50,65
ClLEA-12 / 2 / Potri.004G038600.1 / 4 / 2,53 / 0,81 / 0,322 / 19,44
Potri.007G059800.1 / 7 / 22,23 / 0,89 / 0,040 / 171,02
Potri.018G079500.1 / 18 / 50,42 / 0,92 / 0,018 / 387,88
ClLEA-10 / 1 / Potri.007G045000.1 / 7 / 3,17 / 17,55 / 5,540 / 24,37
ClLEA-13 / 2 / Potri.014G026800.1 / 14 / 49,67 / 0,42 / 0,008 / 382,08
Potri.002G124600.2 / 2 / 50,07 / 0,41 / 0,008 / 385,12
Potri.002G124600.1 / 2 / 50,05 / 0,41 / 0,008 / 385,03
ClLEA-17 / 2 / Potri.001G218400.1 / 1 / 4,97 / 0,19 / 0,038 / 38,24
ClLEA-20 / 2 / Potri.001G219700.2 / 1 / 2,12 / 0,09 / 0,043 / 16,28
Potri.001G219700.1 / 1 / 2,12 / 0,09 / 0,043 / 16,28
Potri.016G024200.1 / 16 / 3,29 / 0,17 / 0,053 / 25,31
Potri.006G025900.1 / 6 / 2,94 / 0,17 / 0,059 / 22,62
Potri.001G219700.3 / 1 / 2,21 / 0,11 / 0,048 / 17,03
Potri.017G067100.1 / 17 / 49,83 / 0,61 / 0,012 / 383,32
ClLEA-25 / 3 / Potri.T122000.1 / scaffold / 2,30 / 0,26 / 0,114 / 17,67
ClLEA-29 / 4 / Potri.010G187100.1 / 10 / 2,59 / 0,13 / 0,050 / 19,95
ClLEA-32 / 5 / Potri.014G090800.1 / 14 / 2,20 / 0,21 / 0,095 / 16,89
ClLEA-35 / 5 / Potri.001G208000.1 / 1 / 2,62 / 0,18 / 0,068 / 20,17
Potri.T165600.1 / scaffold / 3,59 / 0,19 / 0,054 / 27,58
ClLEA-41 / 6 / Potri.007G146300.1 / 7 / 2,83 / 0,09 / 0,033 / 21,78
Potri.007G146300.2 / 7 / 2,90 / 0,10 / 0,034 / 22,34
Potri.007G146300.3 / 7 / 2,90 / 0,10 / 0,034 / 22,34
ClLEA-46 / 7 / Potri.003G141200.1 / 3 / 3,05 / 0,13 / 0,043 / 23,44
ClLEA-56 / 9 / Potri.T122000.1 / scaffold / 20,06 / 0,26 / 0,013 / 154,30
ClLEA-58 / 9 / Potri.T165600.1 / scaffold / 7,42 / 0,17 / 0,023 / 57,09
Potri.001G208000.1 / 1 / 8,64 / 0,19 / 0,021 / 66,44
ClLEA-71 / 11 / Potri.004G107500.1 / 4 / 4,04 / 0,17 / 0,042 / 31,10
Potri.004G107300.1 / 4 / 4,33 / 0,18 / 0,042 / 33,34
Potri.004G107700.1 / 4 / 3,47 / 0,18 / 0,052 / 26,69
Potri.004G107100.1 / 4 / 3,47 / 0,18 / 0,052 / 26,69
Potri.004G107900.2 / 4 / 3,47 / 0,18 / 0,052 / 26,69
Potri.004G107800.1 / 4 / 3,47 / 0,18 / 0,052 / 26,69
Potri.017G108300.1 / 17 / 2,09 / 0,19 / 0,090 / 16,11
Potri.004G107600.1 / 4 / 3,91 / 0,61 / 0,156 / 30,05
Mean / 10,97 / 0,58 / 0,153 / 84,35
Solanum tuberosum- Citrullus lanatus
NIPGR ID / Chromosome / Gene IDs / Chromosome / Ks / Ka / Ka/Ks / MYA
ClLEA-04 / 1 / PGSC0003DMT400026057 / 2 / 2,29 / 0,22 / 0,09 / 17,62
ClLEA-04 / 1 / PGSC0003DMT400048312 / 3 / 31,73 / 0,27 / 0,01 / 244,10
ClLEA-05 / 1 / PGSC0003DMT400026057 / 2 / 6,16 / 0,21 / 0,03 / 47,39
ClLEA-12 / 2 / PGSC0003DMT400047266 / 7 / 2,26 / 0,84 / 0,37 / 17,39
ClLEA-14 / 2 / PGSC0003DMT400079483 / 1 / 3,03 / 0,69 / 0,23 / 23,30
ClLEA-17 / 2 / PGSC0003DMT400067714 / 11 / 27,69 / 0,14 / 0,01 / 212,99
ClLEA-20 / 2 / PGSC0003DMT400069460 / 6 / 3,21 / 0,12 / 0,04 / 24,73
ClLEA-20 / 2 / PGSC0003DMT400069459 / 6 / 3,21 / 0,12 / 0,04 / 24,73
ClLEA-20 / 2 / PGSC0003DMT400058471 / 1 / 3,52 / 0,12 / 0,03 / 27,10
ClLEA-20 / 2 / PGSC0003DMT400069461 / 6 / 3,63 / 0,14 / 0,04 / 27,89
ClLEA-25 / 3 / PGSC0003DMT400057862 / 1 / 15,24 / 0,31 / 0,02 / 117,23
ClLEA-26 / 4 / PGSC0003DMT400029760 / 10 / 16,05 / 0,37 / 0,02 / 123,48
ClLEA-29 / 4 / PGSC0003DMT400017025 / 6 / 2,41 / 0,14 / 0,06 / 18,57
ClLEA-29 / 4 / PGSC0003DMT400021902 / 9 / 7,79 / 0,30 / 0,04 / 59,92
ClLEA-32 / 5 / PGSC0003DMT400000222 / 1 / 1,87 / 0,25 / 0,14 / 14,36
ClLEA-32 / 5 / PGSC0003DMT400000224 / 1 / 1,92 / 0,25 / 0,13 / 14,76
ClLEA-32 / 5 / PGSC0003DMT400000221 / 1 / 4,57 / 0,20 / 0,04 / 35,19
ClLEA-41 / 6 / PGSC0003DMT400035650 / 8 / 3,68 / 0,12 / 0,03 / 28,28
ClLEA-41 / 6 / PGSC0003DMT400016543 / 12 / 6,77 / 0,16 / 0,02 / 52,09
ClLEA-44 / 7 / PGSC0003DMT400009070 / 2 / 15,73 / 12,46 / 0,79 / 120,96
ClLEA-49 / 8 / PGSC0003DMT400022064 / 12 / 7,01 / 0,73 / 0,10 / 53,93
ClLEA-49 / 8 / PGSC0003DMT400053139 / 4 / 49,38 / 0,77 / 0,02 / 379,82
ClLEA-49 / 8 / PGSC0003DMT400056160 / 5 / 51,61 / 0,88 / 0,02 / 397,02
ClLEA-49 / 8 / PGSC0003DMT400022474 / 1 / 3,87 / 0,97 / 0,25 / 29,80
ClLEA-53 / 9 / PGSC0003DMT400006760 / 3 / 1,81 / 0,18 / 0,098 / 13,90
ClLEA-58 / 9 / PGSC0003DMT400076587 / 1 / 49,71 / 0,20 / 0,00 / 382,36
ClLEA-71 / 11 / PGSC0003DMT400048312 / 3 / 9,82 / 0,17 / 0,02 / 75,56
ClLEA-71 / 11 / PGSC0003DMT400026057 / 2 / 1,45 / 0,15 / 0,10 / 11,16
ClLEA-72 / 11 / PGSC0003DMT400079483 / 1 / 3,09 / 0,38 / 0,12 / 23,79
ClLEA-72 / 11 / PGSC0003DMT400009070 / 2 / 13,35 / 12,92 / 0,97 / 102,67
Mean / 11,80 / 1,16 / 0,13 / 90,74
Zea mays-Citrullus lanatus
NIPGR ID / Chromosome / Gene IDs / Chromosome / Ks / Ka / Ka/Ks / MYA
ClLEA-20 / 2 / GRMZM2G089743_T02 / 3 / 32,84 / 0,15 / 0,005 / 252,60
ClLEA-20 / 2 / GRMZM2G089743_T01 / 3 / 53,61 / 0,16 / 0,003 / 412,35
ClLEA-20 / 2 / GRMZM2G007936_T01 / 7 / 49,51 / 1,04 / 0,021 / 380,84
ClLEA-29 / 4 / AC233879.1_FGT002 / 6 / 53,71 / 0,13 / 0,002 / 413,17
ClLEA-41 / 6 / GRMZM2G352415_T03 / 1 / 62,85 / 0,18 / 0,003 / 483,47
ClLEA-41 / 6 / GRMZM2G053637_T01 / 7 / 7,96 / 0,22 / 0,027 / 61,21
ClLEA-49 / 8 / GRMZM2G113057_T01 / 9 / 6,45 / 0,84 / 0,130 / 49,58
ClLEA-49 / 8 / GRMZM2G445296_T01 / 1 / 8,00 / 0,86 / 0,107 / 61,57
ClLEA-55 / 9 / GRMZM2G146004_T01 / 8 / 7,76 / 0,72 / 0,093 / 59,71
ClLEA-60 / 10 / GRMZM2G146004_T01 / 8 / 49,57 / 0,57 / 0,011 / 381,30
ClLEA-61 / 10 / GRMZM2G072890_T01 / 3 / 7,49 / 0,72 / 0,096 / 57,60
Mean / 30,89 / 0,51 / 0,045 / 237,58