Supplementary Table S5.Intrapopulation and net genetic distance among 21 Sri Lankan sub populations derived from HVS-1 and part of HVS-2 sequences (Tajima-Nei model x 100).

VA-Rat / VA-Dal / VA-Dam / VA-Hen / VA-Pol / SU-Mee / SU-Bam / SU-Mul / SU-Thu / SU-Kuk / SL-Thu / SL-Lan / SL-Ban / TS-Jaf / TS-Bat / TS-Tri / TS-Vau / TI-Bal / TI-Mat / TI-Ban / TI-Nan
VA-Rat / 0.6657
VA-Dal / 0.1829 / 0.8738
VA-Dam / 0.3735 / 0.2326 / 1.2579
VA-Hen / 0.2677 / 0.1554 / 0.0108 / 1.3943
VA-Pol / 0.0624 / 0.2131 / 0.1206 / 0.0519 / 1.2814
SU-Mee / 0.3063 / 0.1570 / 0.0840 / 0.0973 / 0.0942 / 1.5872
SU-Bam / 0.2702 / 0.2079 / 0.1985 / 0.1754 / 0.1203 / 0.0525 / 1.9756
SU-Mul / 0.2558 / 0.1248 / 0.0000 / 0.0000 / 0.0256 / 0.0000 / 0.0187 / 1.5611
SU-Thu / 0.5668 / 0.4294 / 0.1417 / 0.0881 / 0.1978 / 0.2740 / 0.3948 / 0.0871 / 1.3526
SU-Kuk / 0.3955 / 0.2194 / 0.0396 / 0.0933 / 0.2051 / 0.0459 / 0.1382 / 0.0000 / 0.2658 / 1.0334
SL-Thu / 0.3493 / 0.1974 / 0.1611 / 0.1563 / 0.1724 / 0.0896 / 0.1520 / 0.0613 / 0.3430 / 0.1599 / 0.8867
SL-Lan / 0.3725 / 0.2430 / 0.1087 / 0.0466 / 0.0518 / 0.0612 / 0.1498 / 0.0000 / 0.1572 / 0.1691 / 0.1566 / 1.4727
SL-Ban / 0.5055 / 0.2495 / 0.0738 / 0.2247 / 0.2792 / 0.0635 / 0.1251 / 0.0242 / 0.3739 / 0.0000 / 0.1807 / 0.2034 / 1.1974
TS-Jaf / 0.2727 / 0.1503 / 0.1105 / 0.0935 / 0.0843 / 0.0426 / 0.0696 / 0.0000 / 0.2442 / 0.0928 / 0.1153 / 0.0789 / 0.0905 / 1.3561
TS-Bat / 0.2084 / 0.1514 / 0.0845 / 0.0572 / 0.0046 / 0.0000 / 0.0178 / 0.0000 / 0.2653 / 0.0726 / 0.0631 / 0.0491 / 0.1007 / 0.0000 / 1.4105
TS-Tri / 0.3050 / 0.1609 / 0.0000 / 0.0208 / 0.1055 / 0.0080 / 0.0548 / 0.0000 / 0.2011 / 0.0000 / 0.1216 / 0.0855 / 0.0031 / 0.0000 / 0.0259 / 1.5604
TS-Vau / 0.2552 / 0.0868 / 0.0818 / 0.0351 / 0.0782 / 0.0000 / 0.0993 / 0.0000 / 0.1611 / 0.0998 / 0.0824 / 0.0000 / 0.1266 / 0.0000 / 0.0000 / 0.0064 / 1.6622
TI-Bal / 0.3262 / 0.1472 / 0.1439 / 0.1607 / 0.1284 / 0.0178 / 0.0226 / 0.0000 / 0.3625 / 0.0854 / 0.1216 / 0.1022 / 0.0333 / 0.0106 / 0.0000 / 0.0144 / 0.0131 / 1.4726
TI-Mat / 0.3596 / 0.1882 / 0.1138 / 0.1364 / 0.1464 / 0.0090 / 0.0383 / 0.0000 / 0.3052 / 0.0507 / 0.1053 / 0.1235 / 0.0369 / 0.0064 / 0.0035 / 0.0017 / 0.0097 / 0.0000 / 1.4307
TI-Ban / 0.3910 / 0.1656 / 0.1773 / 0.1772 / 0.2047 / 0.0145 / 0.0737 / 0.0263 / 0.3750 / 0.1290 / 0.1220 / 0.1486 / 0.1068 / 0.0413 / 0.0170 / 0.0134 / 0.0362 / 0.0000 / 0.0000 / 1.2413
TI-Nan / 0.5672 / 0.3402 / 0.1487 / 0.1657 / 0.2447 / 0.1398 / 0.1635 / 0.0723 / 0.2824 / 0.1131 / 0.2364 / 0.1341 / 0.1185 / 0.1329 / 0.1205 / 0.1435 / 0.1533 / 0.1224 / 0.0925 / 0.1614 / 1.3462