Table S3:The actual and predicated pIC50 values with their residuals of the Training and
Test set molecules generated by CoMFA and CoMSIA models for V600EBRAF.
S # / Skeleton / Actual pIC50 / CoMFA / CoMSIAPredicted values / Residual / Predicted values / Residual
Training set
1 / 01A / 5.50 / 5.30 / 0.20 / 5.47 / 0.03
2 / 01B / 7.00 / 7.42 / -0.42 / 7.55 / -0.54
3 / 01C / 7.60 / 7.64 / -0.04 / 7.61 / -0.01
4 / 02A / 5.50 / 5.37 / 0.13 / 5.16 / 0.34
5 / 02B / 7.90 / 7.45 / 0.45 / 7.54 / 0.37
6 / 02C / 9.00 / 9.10 / -0.10 / 9.18 / -0.18
7 / 03B / 7.70 / 7.45 / 0.25 / 7.81 / -0.11
8 / 03C / 7.60 / 7.43 / 0.17 / 7.42 / 0.18
9 / 04A / 5.40 / 5.16 / 0.24 / 5.18 / 0.22
10 / 04B / 7.92 / 7.71 / 0.21 / 7.99 / -0.07
11 / 04C / 7.60 / 7.60 / 0.00 / 7.61 / -0.01
12 / 05B / 7.60 / 7.18 / 0.42 / 7.48 / 0.12
13 / 05C / 8.10 / 7.81 / 0.29 / 7.67 / 0.43
14 / 06A / 4.60 / 4.72 / -0.12 / 4.70 / -0.09
15 / 06C / 7.50 / 7.50 / 0.01 / 7.45 / 0.05
16 / 07A / 4.90 / 5.28 / -0.38 / 4.81 / 0.10
17 / 07B / 5.50 / 6.35 / -0.85 / 6.50 / -1.00
18 / 08B / 6.20 / 6.44 / -0.24 / 6.37 / -0.17
19 / 08C / 7.90 / 7.52 / 0.38 / 7.65 / 0.25
20 / 09A / 5.90 / 5.90 / 0.01 / 6.42 / -0.52
21 / 09B / 6.10 / 5.93 / 0.17 / 5.98 / 0.12
22 / 10B / 7.70 / 7.21 / 0.49 / 7.34 / 0.36
23 / 10C / 7.30 / 7.64 / -0.34 / 7.66 / -0.36
24 / 11B / 6.80 / 6.73 / 0.07 / 6.83 / -0.03
25 / 11C / 7.70 / 7.76 / -0.06 / 7.62 / 0.08
26 / 12A / 4.80 / 4.86 / -0.06 / 4.95 / -0.15
27 / 12B / 7.30 / 7.02 / 0.28 / 6.98 / 0.32
28 / 12C / 7.40 / 7.66 / -0.26 / 7.53 / -0.13
29 / 13A / 4.80 / 4.79 / 0.01 / 5.02 / -0.22
30 / 13B / 7.20 / 7.57 / -0.37 / 7.10 / 0.10
31 / 13C / 7.00 / 7.12 / -0.12 / 6.81 / 0.19
32 / 14A / 5.30 / 5.20 / 0.10 / 5.09 / 0.21
33 / 14B / 6.30 / 7.06 / -0.75 / 6.80 / -0.50
34 / 14C / 8.10 / 8.13 / -0.03 / 7.88 / 0.22
35 / 15A / 4.90 / 4.88 / 0.02 / 4.80 / 0.10
36 / 15B / 6.50 / 6.46 / 0.04 / 6.76 / -0.26
37 / 16A / 5.30 / 4.76 / 0.54 / 4.93 / 0.37
38 / 16B / 7.50 / 7.43 / 0.07 / 7.38 / 0.12
39 / 16C / 9.00 / 9.10 / -0.10 / 8.87 / 0.13
40 / 17A / 4.90 / 4.81 / 0.09 / 5.05 / -0.15
41 / 17C / 7.80 / 7.69 / 0.11 / 7.84 / -0.04
42 / 18A / 4.70 / 5.27 / -0.57 / 4.77 / -0.07
43 / 18B / 7.40 / 6.59 / 0.81 / 6.76 / 0.64
44 / 18C / 7.90 / 8.22 / -0.32 / 7.97 / -0.07
45 / 19A / 5.90 / 5.39 / 0.51 / 5.06 / 0.84
46 / 19B / 7.10 / 6.79 / 0.31 / 6.94 / 0.16
47 / 19C / 8.20 / 8.07 / 0.13 / 8.01 / 0.19
48 / 20A / 4.00 / 4.41 / -0.41 / 4.45 / -0.45
49 / 20C / 7.90 / 8.00 / -0.10 / 8.04 / -0.14
50 / 21A / 4.50 / 4.55 / -0.05 / 4.68 / -0.18
51 / 22A / 4.80 / 4.75 / 0.05 / 4.99 / -0.19
52 / 22B / 4.80 / 4.89 / -0.09 / 4.61 / 0.19
53 / 22C / 7.40 / 7.22 / 0.18 / 7.24 / 0.16
54 / 23A / 4.30 / 4.73 / -0.43 / 5.01 / -0.71
55 / 23B / 4.90 / 5.26 / -0.35 / 4.64 / 0.26
56 / 23C / 8.20 / 7.93 / 0.27 / 8.09 / 0.12
57 / 24A / 5.00 / 4.90 / 0.10 / 4.89 / 0.11
58 / 24B / 4.00 / 3.88 / 0.12 / 4.05 / -0.05
59 / 25A / 4.70 / 5.04 / -0.33 / 4.98 / -0.28
60 / 26A / 5.10 / 4.97 / 0.13 / 5.18 / -0.08
61 / 26C / 7.90 / 7.93 / -0.03 / 8.01 / -0.11
62 / 27A / 4.40 / 4.42 / -0.02 / 4.60 / -0.20
63 / 27B / 4.00 / 4.14 / -0.14 / 4.10 / -0.10
64 / 27C / 7.50 / 7.46 / 0.04 / 7.72 / -0.22
65 / 28C / 7.60 / 7.58 / 0.02 / 7.56 / 0.04
66 / 29A / 5.00 / 5.42 / -0.41 / 5.33 / -0.33
67 / 29B / 4.00 / 4.34 / -0.34 / 4.33 / -0.33
68 / 29C / 6.80 / 7.26 / -0.46 / 7.24 / -0.44
69 / 30A / 4.50 / 4.53 / -0.03 / 4.92 / -0.42
70 / 30B / 4.00 / 3.91 / 0.09 / 3.93 / 0.07
71 / 30C / 7.40 / 7.22 / 0.18 / 7.24 / 0.16
72 / 31A / 5.40 / 5.07 / 0.34 / 5.15 / 0.25
73 / 32B / 4.00 / 4.12 / -0.12 / 3.99 / 0.02
74 / 32C / 6.80 / 6.89 / -0.09 / 6.95 / -0.15
75 / 33A / 4.10 / 4.31 / -0.21 / 4.28 / -0.18
76 / 33B / 4.90 / 4.51 / 0.39 / 4.36 / 0.54
77 / 34A / 4.70 / 4.55 / 0.15 / 4.60 / 0.10
78 / 34B / 4.50 / 4.58 / -0.08 / 4.39 / 0.11
79 / 35A / 4.20 / 4.27 / -0.07 / 4.20 / 0.01
80 / 36A / 4.70 / 4.40 / 0.30 / 4.70 / 0.00
81 / 36C / 8.20 / 8.07 / 0.13 / 8.31 / -0.11
82 / 37A / 5.00 / 4.88 / 0.12 / 4.53 / 0.47
83 / 38A / 4.30 / 4.31 / -0.01 / 4.55 / -0.25
84 / 38C / 7.60 / 7.68 / -0.08 / 7.75 / -0.15
85 / 43A / 4.70 / 4.33 / 0.37 / 4.63 / 0.07
86 / 44A / 4.50 / 4.10 / 0.40 / 4.16 / 0.34
87 / 45A / 5.00 / 5.10 / -0.10 / 4.94 / 0.06
88 / 46A / 4.60 / 4.98 / -0.38 / 4.99 / -0.39
89 / 47A / 5.90 / 5.51 / 0.40 / 5.44 / 0.46
90 / 48A / 4.30 / 4.61 / -0.31 / 4.59 / -0.29
91 / 49A / 6.40 / 6.31 / 0.10 / 6.00 / 0.40
92 / 50A / 6.30 / 6.45 / -0.15 / 6.05 / 0.25
93 / 51A / 6.20 / 6.00 / 0.21 / 5.96 / 0.24
94 / 52A / 5.60 / 5.71 / -0.11 / 5.67 / -0.07
95 / 53A / 6.50 / 6.94 / -0.44 / 6.84 / -0.34
Test Set
1 / 03A / 4.70 / 5.15 / -0.45 / 5.00 / -0.30
2 / 05A / 4.70 / 4.98 / -0.28 / 4.94 / -0.24
3 / 06B / 7.30 / 6.45 / 0.85 / 6.36 / 0.94
4 / 07C / 7.00 / 7.75 / -0.75 / 7.76 / -0.76
5 / 08A / 5.50 / 4.86 / 0.64 / 4.84 / 0.67
6 / 09C / 7.70 / 7.81 / -0.11 / 7.55 / 0.15
7 / 10A / 5.00 / 5.06 / -0.06 / 4.96 / 0.04
8 / 11A / 6.00 / 5.21 / 0.79 / 4.97 / 1.03
9 / 15C / 7.50 / 7.46 / 0.04 / 7.34 / 0.16
10 / 17B / 7.60 / 7.32 / 0.28 / 7.42 / 0.18
11 / 20B / 4.00 / 4.96 / -0.96 / 4.34 / -0.34
12 / 21B / 4.80 / 5.15 / -0.35 / 4.40 / 0.40
13 / 21C / 8.20 / 6.69 / 1.52 / 7.09 / 1.11
14 / 24C / 6.70 / 7.58 / -0.88 / 7.82 / -1.12
15 / 25B / 4.80 / 4.18 / 0.62 / 4.12 / 0.68
16 / 25C / 7.10 / 7.58 / -0.48 / 7.82 / -0.72
17 / 26B / 5.00 / 4.07 / 0.93 / 4.12 / 0.88
18 / 28A / 5.80 / 5.34 / 0.46 / 5.16 / 0.64
19 / 28B / 5.00 / 4.17 / 0.83 / 4.02 / 0.98
20 / 31B / 4.00 / 5.08 / -1.08 / 4.63 / -0.63
21 / 31C / 7.80 / 6.99 / 0.81 / 7.00 / 0.80
22 / 32A / 4.50 / 5.02 / -0.52 / 5.26 / -0.76
23 / 33C / 7.90 / 7.46 / 0.44 / 7.79 / 0.11
24 / 34C / 7.40 / 7.35 / 0.05 / 7.52 / -0.12
25 / 35C / 6.40 / 7.30 / -0.90 / 7.32 / -0.92
26 / 37C / 8.00 / 7.51 / 0.49 / 7.51 / 0.49
27 / 39A / 4.30 / 4.35 / -0.05 / 4.64 / -0.34
28 / 40A / 4.40 / 4.39 / 0.01 / 4.67 / -0.27
29 / 41A / 4.90 / 5.50 / -0.60 / 5.63 / -0.73
30 / 42A / 5.30 / 5.32 / -0.02 / 5.21 / 0.09